Protein–RNA interactions for Protein: Q99JY6

Higd1b, HIG1 domain family member 1B, mousemouse

Predictions only

Length 98 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Higd1bQ99JY6 Mcfd2-201ENSMUST00000024963 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Higd1bQ99JY6 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Higd1bQ99JY6 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Higd1bQ99JY6 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Higd1bQ99JY6 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Higd1bQ99JY6 Smim17-203ENSMUST00000161855 664 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Higd1bQ99JY6 Upp1-205ENSMUST00000164791 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Higd1bQ99JY6 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Higd1bQ99JY6 Dhrs7c-205ENSMUST00000168612 1108 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Higd1bQ99JY6 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Higd1bQ99JY6 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Higd1bQ99JY6 Gm44357-201ENSMUST00000195897 142 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Higd1bQ99JY6 Gm19658-201ENSMUST00000196231 138 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Higd1bQ99JY6 Gm44367-201ENSMUST00000196836 138 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Higd1bQ99JY6 Gm44350-201ENSMUST00000197197 138 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Higd1bQ99JY6 Gm44390-201ENSMUST00000197533 144 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Higd1bQ99JY6 Gm44313-201ENSMUST00000198018 138 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Higd1bQ99JY6 Gm44486-201ENSMUST00000198508 138 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Higd1bQ99JY6 Gm44314-201ENSMUST00000199263 138 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Higd1bQ99JY6 Gm44394-201ENSMUST00000199558 138 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Higd1bQ99JY6 Gm44484-201ENSMUST00000199873 138 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Higd1bQ99JY6 Gm44466-201ENSMUST00000200264 138 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Higd1bQ99JY6 Gm44359-201ENSMUST00000200671 138 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Higd1bQ99JY6 AC121577.1-201ENSMUST00000227302 707 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Higd1bQ99JY6 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Higd1bQ99JY6 Mrps6-201ENSMUST00000047429 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Higd1bQ99JY6 4931422A03Rik-201ENSMUST00000056170 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Higd1bQ99JY6 Nkx2-6-201ENSMUST00000062437 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Higd1bQ99JY6 Hnrnpk-232ENSMUST00000225674 2704 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Higd1bQ99JY6 AC116503.1-201ENSMUST00000215445 2192 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Higd1bQ99JY6 Cct3-ps1-201ENSMUST00000118023 1647 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Higd1bQ99JY6 Dao-203ENSMUST00000161610 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Higd1bQ99JY6 Bcat1-202ENSMUST00000048252 1642 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Higd1bQ99JY6 Zfp236-201ENSMUST00000171071 9626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Higd1bQ99JY6 Phf23-209ENSMUST00000153684 1797 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Higd1bQ99JY6 Gm14342-201ENSMUST00000137629 2119 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Higd1bQ99JY6 Fam160a2-204ENSMUST00000122327 3521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Higd1bQ99JY6 Bysl-201ENSMUST00000024783 3854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Higd1bQ99JY6 Myh3-201ENSMUST00000007301 5992 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Higd1bQ99JY6 Grk3-203ENSMUST00000197776 1570 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Higd1bQ99JY6 Hvcn1-201ENSMUST00000072602 2790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Higd1bQ99JY6 Rbmx2-201ENSMUST00000033433 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Higd1bQ99JY6 Abhd14b-201ENSMUST00000048527 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Higd1bQ99JY6 Ccdc24-201ENSMUST00000106422 1365 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Higd1bQ99JY6 Bach2-202ENSMUST00000108180 8882 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Higd1bQ99JY6 Arhgef37-201ENSMUST00000171629 3234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Higd1bQ99JY6 Tbata-201ENSMUST00000035894 1506 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Higd1bQ99JY6 Myh3-202ENSMUST00000108689 6031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Higd1bQ99JY6 Xrcc1-201ENSMUST00000063249 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Higd1bQ99JY6 Daglb-201ENSMUST00000045593 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Higd1bQ99JY6 Sfxn4-203ENSMUST00000135808 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Higd1bQ99JY6 Nup88-203ENSMUST00000108531 2453 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Higd1bQ99JY6 Ddx19b-202ENSMUST00000065784 3104 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Higd1bQ99JY6 Tmem38a-201ENSMUST00000034244 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Higd1bQ99JY6 Zc3h4-202ENSMUST00000209289 5853 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Higd1bQ99JY6 Spon1-201ENSMUST00000046687 6161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Higd1bQ99JY6 Gm13814-201ENSMUST00000141341 3077 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Higd1bQ99JY6 Ciart-202ENSMUST00000159739 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Higd1bQ99JY6 Rps19-201ENSMUST00000108428 1284 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Higd1bQ99JY6 Gm11536-201ENSMUST00000130733 535 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Higd1bQ99JY6 Gm15758-201ENSMUST00000161681 695 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Higd1bQ99JY6 Syne4-208ENSMUST00000176304 1006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Higd1bQ99JY6 Rps2-ps5-201ENSMUST00000184266 849 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Higd1bQ99JY6 Rnf2-203ENSMUST00000186415 1106 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Higd1bQ99JY6 1700080E11Rik-202ENSMUST00000190661 682 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Higd1bQ99JY6 Ube2g1-201ENSMUST00000021148 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Higd1bQ99JY6 AC154471.1-201ENSMUST00000224418 436 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Higd1bQ99JY6 Etfb-201ENSMUST00000004729 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Higd1bQ99JY6 Olfr283-201ENSMUST00000057386 1102 ntAPPRIS P1 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Higd1bQ99JY6 Rtp3-201ENSMUST00000084922 1425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Higd1bQ99JY6 1810058I24Rik-203ENSMUST00000152147 2521 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Higd1bQ99JY6 Ank3-223ENSMUST00000182557 1569 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Higd1bQ99JY6 Vmn1r65-201ENSMUST00000086338 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Higd1bQ99JY6 Matr3-206ENSMUST00000187389 3107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Higd1bQ99JY6 G3bp2-209ENSMUST00000202258 1884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Higd1bQ99JY6 Pcdh19-202ENSMUST00000149154 10289 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Higd1bQ99JY6 Il13ra1-201ENSMUST00000033418 3712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Higd1bQ99JY6 Ppp6r1-201ENSMUST00000064099 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Higd1bQ99JY6 Tnk1-203ENSMUST00000108628 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Higd1bQ99JY6 Tppp3-203ENSMUST00000177126 1396 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Higd1bQ99JY6 Gm28043-201ENSMUST00000130871 6521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Higd1bQ99JY6 Chfr-202ENSMUST00000112519 3159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Higd1bQ99JY6 Ciz1-203ENSMUST00000113332 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Higd1bQ99JY6 Gm20633-201ENSMUST00000176742 2831 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Higd1bQ99JY6 Armcx1-204ENSMUST00000113198 2085 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Higd1bQ99JY6 Il9r-202ENSMUST00000128311 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Higd1bQ99JY6 Gm26788-201ENSMUST00000181692 1750 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Higd1bQ99JY6 Pcdhb18-201ENSMUST00000055949 5041 ntAPPRIS P1 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Higd1bQ99JY6 Pcdhgb1-201ENSMUST00000192931 4723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Higd1bQ99JY6 Pcdhga9-201ENSMUST00000091935 4724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Higd1bQ99JY6 Pck2-205ENSMUST00000226352 2784 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Higd1bQ99JY6 Proser3-202ENSMUST00000108165 2466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Higd1bQ99JY6 Proser3-206ENSMUST00000215288 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Higd1bQ99JY6 Zfp148-202ENSMUST00000165418 9431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Higd1bQ99JY6 Hacd2-201ENSMUST00000061156 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Higd1bQ99JY6 Hoxd3os1-202ENSMUST00000139005 1701 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Higd1bQ99JY6 Eif3j1-201ENSMUST00000028668 5413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Higd1bQ99JY6 Begain-204ENSMUST00000209829 3272 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Higd1bQ99JY6 Kbtbd6-201ENSMUST00000100359 2982 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Higd1bQ99JY6 Il11ra2-201ENSMUST00000108006 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26 ms