Protein–RNA interactions for Protein: Q8VCH8

Ubxn4, UBX domain-containing protein 4, mousemouse

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Length 506 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ubxn4Q8VCH8 Gm17251-201ENSMUST00000170103 925 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ubxn4Q8VCH8 Gm20444-201ENSMUST00000174014 648 ntTSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ubxn4Q8VCH8 Cox7a2l-201ENSMUST00000025095 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ubxn4Q8VCH8 Il17b-201ENSMUST00000025471 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ubxn4Q8VCH8 Oxt-201ENSMUST00000028764 537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ubxn4Q8VCH8 Lce1f-201ENSMUST00000047153 728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ubxn4Q8VCH8 Mrpl34-201ENSMUST00000048914 607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ubxn4Q8VCH8 Olfr541-201ENSMUST00000080681 1103 ntAPPRIS P1 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ubxn4Q8VCH8 Ifnl2-201ENSMUST00000081684 702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ubxn4Q8VCH8 Arhgap27os3-201ENSMUST00000124462 2729 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ubxn4Q8VCH8 Spin1-201ENSMUST00000095797 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ubxn4Q8VCH8 Ccdc85a-204ENSMUST00000109502 5220 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ubxn4Q8VCH8 Adam22-203ENSMUST00000088744 9245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ubxn4Q8VCH8 Ano6-201ENSMUST00000071874 4927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ubxn4Q8VCH8 Acin1-216ENSMUST00000141453 2381 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ubxn4Q8VCH8 Fer-202ENSMUST00000038080 2365 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ubxn4Q8VCH8 4833439L19Rik-201ENSMUST00000026989 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ubxn4Q8VCH8 Zbtb49-202ENSMUST00000114113 2645 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ubxn4Q8VCH8 Gm28551-201ENSMUST00000144660 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ubxn4Q8VCH8 Slc6a4-202ENSMUST00000108402 2796 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ubxn4Q8VCH8 Clcn3-204ENSMUST00000110301 4099 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ubxn4Q8VCH8 Gm3002-201ENSMUST00000170480 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ubxn4Q8VCH8 Gm3005-202ENSMUST00000178728 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ubxn4Q8VCH8 Sema6c-202ENSMUST00000090823 4029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ubxn4Q8VCH8 Tmem51os1-204ENSMUST00000153023 3440 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ubxn4Q8VCH8 Prrt3-201ENSMUST00000101059 3304 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ubxn4Q8VCH8 AC238940.1-201ENSMUST00000225106 1858 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
Ubxn4Q8VCH8 Gm10327-201ENSMUST00000105222 1002 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
Ubxn4Q8VCH8 Sfxn5-203ENSMUST00000113787 638 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ubxn4Q8VCH8 A530058N18Rik-205ENSMUST00000143993 550 ntTSL 3 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ubxn4Q8VCH8 Gm9727-201ENSMUST00000161387 555 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
Ubxn4Q8VCH8 Mir8117-201ENSMUST00000184773 107 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
Ubxn4Q8VCH8 Gm5069-202ENSMUST00000192714 1011 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
Ubxn4Q8VCH8 Vsig2-206ENSMUST00000215957 851 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ubxn4Q8VCH8 Mzt1-203ENSMUST00000227948 952 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
Ubxn4Q8VCH8 Lce3c-201ENSMUST00000055375 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ubxn4Q8VCH8 Dlgap3-203ENSMUST00000106094 4207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ubxn4Q8VCH8 Fam155a-201ENSMUST00000110969 3388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ubxn4Q8VCH8 Ret-201ENSMUST00000032201 5456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ubxn4Q8VCH8 Asb10-202ENSMUST00000117900 1432 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ubxn4Q8VCH8 Rbm47-206ENSMUST00000200775 3180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ubxn4Q8VCH8 Slc25a15-201ENSMUST00000033871 3430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ubxn4Q8VCH8 Myh3-201ENSMUST00000007301 5992 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ubxn4Q8VCH8 Adam11-202ENSMUST00000103081 4620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ubxn4Q8VCH8 Tbx3-203ENSMUST00000121021 4777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ubxn4Q8VCH8 Ptger3-201ENSMUST00000041175 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ubxn4Q8VCH8 Ddi2-202ENSMUST00000177592 3539 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ubxn4Q8VCH8 Slc5a11-201ENSMUST00000033035 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ubxn4Q8VCH8 Gstcd-202ENSMUST00000080583 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ubxn4Q8VCH8 Sin3a-208ENSMUST00000168678 5206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ubxn4Q8VCH8 Cad-206ENSMUST00000201838 3153 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ubxn4Q8VCH8 Cpxm2-201ENSMUST00000033149 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ubxn4Q8VCH8 Trabd2b-201ENSMUST00000094894 6617 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ubxn4Q8VCH8 Miga2-208ENSMUST00000140075 2196 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ubxn4Q8VCH8 Osbpl9-202ENSMUST00000084366 3134 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ubxn4Q8VCH8 Map10-201ENSMUST00000053078 3542 ntAPPRIS P1 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ubxn4Q8VCH8 Map2k6-202ENSMUST00000100260 2088 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ubxn4Q8VCH8 Gpr19-204ENSMUST00000116515 2075 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ubxn4Q8VCH8 2310007B03Rik-202ENSMUST00000143419 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ubxn4Q8VCH8 Hist1h4d-201ENSMUST00000102968 1138 ntAPPRIS P1 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ubxn4Q8VCH8 Crybb3-202ENSMUST00000117143 749 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ubxn4Q8VCH8 Gm13823-201ENSMUST00000119930 345 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Ubxn4Q8VCH8 Hoxa7-203ENSMUST00000140316 643 ntTSL 3 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ubxn4Q8VCH8 Gm11025-201ENSMUST00000140773 466 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Ubxn4Q8VCH8 Fam241b-208ENSMUST00000142796 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ubxn4Q8VCH8 Gm18733-201ENSMUST00000173950 856 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Ubxn4Q8VCH8 1700080E11Rik-202ENSMUST00000190661 682 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ubxn4Q8VCH8 Gm38225-201ENSMUST00000194001 393 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Ubxn4Q8VCH8 Sox2ot-202ENSMUST00000196058 753 ntTSL 3 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ubxn4Q8VCH8 Gm43691-201ENSMUST00000196625 697 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ubxn4Q8VCH8 AC133598.3-202ENSMUST00000224219 531 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Ubxn4Q8VCH8 AC149294.4-201ENSMUST00000227870 882 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Ubxn4Q8VCH8 Tspo-201ENSMUST00000047419 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ubxn4Q8VCH8 Cabp7-201ENSMUST00000009219 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ubxn4Q8VCH8 Tbr1-201ENSMUST00000048934 3977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ubxn4Q8VCH8 Spib-201ENSMUST00000035323 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ubxn4Q8VCH8 Pcdhgc3-201ENSMUST00000076807 4687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ubxn4Q8VCH8 Adsl-206ENSMUST00000168756 1439 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ubxn4Q8VCH8 Olfm1-202ENSMUST00000100244 2686 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ubxn4Q8VCH8 Fbxo8-202ENSMUST00000110322 1709 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ubxn4Q8VCH8 Ehbp1l1-201ENSMUST00000049295 6404 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ubxn4Q8VCH8 Rpl21-201ENSMUST00000035983 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ubxn4Q8VCH8 Dpp6-201ENSMUST00000071500 3826 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ubxn4Q8VCH8 Grin1-202ENSMUST00000114307 4127 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ubxn4Q8VCH8 Slc19a2-201ENSMUST00000044021 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ubxn4Q8VCH8 Ankra2-208ENSMUST00000226100 1476 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Ubxn4Q8VCH8 Taf6-201ENSMUST00000048698 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ubxn4Q8VCH8 Rnase10-201ENSMUST00000022424 1629 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ubxn4Q8VCH8 Pak4-201ENSMUST00000032823 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.1
Ubxn4Q8VCH8 Etl4-201ENSMUST00000045555 5931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ubxn4Q8VCH8 Fam126b-201ENSMUST00000038372 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ubxn4Q8VCH8 Ncaph-201ENSMUST00000110387 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ubxn4Q8VCH8 Bhlhb9-204ENSMUST00000180025 2812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ubxn4Q8VCH8 Krt36-201ENSMUST00000107416 1671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ubxn4Q8VCH8 Zfp354c-201ENSMUST00000000632 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ubxn4Q8VCH8 Gm28386-201ENSMUST00000189147 1849 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Ubxn4Q8VCH8 Eif5-201ENSMUST00000050993 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ubxn4Q8VCH8 Gm15477-201ENSMUST00000140578 2130 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ubxn4Q8VCH8 Hnrnph1-203ENSMUST00000109142 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ubxn4Q8VCH8 Cluh-201ENSMUST00000092915 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.2 ms