Protein–RNA interactions for Protein: Q8CFZ4

Gpc3, Glypican-3, mousemouse

Predictions only

Length 579 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gpc3Q8CFZ4 Tnfrsf19-205ENSMUST00000225730 744 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Gpc3Q8CFZ4 Ap2s1-201ENSMUST00000086112 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Gpc3Q8CFZ4 Ociad2-205ENSMUST00000201908 2378 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Gpc3Q8CFZ4 Dapk1-201ENSMUST00000044083 5304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Gpc3Q8CFZ4 Cd72-202ENSMUST00000098104 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Gpc3Q8CFZ4 Knop1-203ENSMUST00000106549 1467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Gpc3Q8CFZ4 Ntf3-201ENSMUST00000050484 1483 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Gpc3Q8CFZ4 Medag-201ENSMUST00000093110 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Gpc3Q8CFZ4 Sgce-205ENSMUST00000115579 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Gpc3Q8CFZ4 Fggy-202ENSMUST00000079223 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Gpc3Q8CFZ4 Snrpa-202ENSMUST00000122202 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Gpc3Q8CFZ4 4933430H06Rik-201ENSMUST00000200924 1343 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
Gpc3Q8CFZ4 Mdfic-203ENSMUST00000125326 3635 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Gpc3Q8CFZ4 Stx5a-202ENSMUST00000073430 2112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Gpc3Q8CFZ4 Stat3-201ENSMUST00000092671 2927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Gpc3Q8CFZ4 Etl4-208ENSMUST00000114614 5898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Gpc3Q8CFZ4 Mctp1-204ENSMUST00000125209 4715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Gpc3Q8CFZ4 Riox2-201ENSMUST00000023407 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Gpc3Q8CFZ4 Traf2-201ENSMUST00000028311 3044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Gpc3Q8CFZ4 Prkcsh-205ENSMUST00000216344 2228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Gpc3Q8CFZ4 2600006K01Rik-201ENSMUST00000047607 1406 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Gpc3Q8CFZ4 Yod1-201ENSMUST00000049813 6128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Gpc3Q8CFZ4 Ddhd1-203ENSMUST00000111828 9802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Gpc3Q8CFZ4 Fermt2-201ENSMUST00000045905 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Gpc3Q8CFZ4 Lurap1l-201ENSMUST00000055922 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Gpc3Q8CFZ4 Hp1bp3-202ENSMUST00000097836 3113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Gpc3Q8CFZ4 Rpsa-ps9-201ENSMUST00000120702 885 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Gpc3Q8CFZ4 Gm16194-204ENSMUST00000141797 475 ntTSL 3 BASIC14.85□□□□□ -0.03
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Gpc3Q8CFZ4 Gm6460-202ENSMUST00000163787 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Gpc3Q8CFZ4 Gm8879-201ENSMUST00000170260 1125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Gpc3Q8CFZ4 4933402N22Rik-202ENSMUST00000170301 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Gpc3Q8CFZ4 Lamtor1-202ENSMUST00000193465 661 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Gpc3Q8CFZ4 Gm34086-201ENSMUST00000196486 743 ntTSL 3 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Gpc3Q8CFZ4 Gm30906-201ENSMUST00000219578 535 ntTSL 3 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Gpc3Q8CFZ4 Ano7-201ENSMUST00000058682 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Gpc3Q8CFZ4 Taf7l-201ENSMUST00000009740 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Gpc3Q8CFZ4 Adra1b-204ENSMUST00000167574 3047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Gpc3Q8CFZ4 Ankrd6-202ENSMUST00000084748 4354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Gpc3Q8CFZ4 Rnf135-201ENSMUST00000017839 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Gpc3Q8CFZ4 Mcf2l-207ENSMUST00000110876 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Gpc3Q8CFZ4 Apc-202ENSMUST00000079362 8867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Gpc3Q8CFZ4 Ncs1-201ENSMUST00000000199 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Gpc3Q8CFZ4 Pias3-203ENSMUST00000107077 2695 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Gpc3Q8CFZ4 Gm16685-201ENSMUST00000181286 1592 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Gpc3Q8CFZ4 Hoxd3-203ENSMUST00000111983 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Gpc3Q8CFZ4 Ghr-201ENSMUST00000069451 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Gpc3Q8CFZ4 Cfp-201ENSMUST00000001156 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gpc3Q8CFZ4 Phka2-202ENSMUST00000112376 2310 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gpc3Q8CFZ4 Rfx5-203ENSMUST00000107254 4450 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gpc3Q8CFZ4 Lpcat1-208ENSMUST00000223060 2141 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gpc3Q8CFZ4 Glmn-202ENSMUST00000082121 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gpc3Q8CFZ4 Synm-202ENSMUST00000074233 7818 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gpc3Q8CFZ4 Tap2-201ENSMUST00000025197 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gpc3Q8CFZ4 Car6-202ENSMUST00000105683 1460 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gpc3Q8CFZ4 R3hcc1-206ENSMUST00000216152 1467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gpc3Q8CFZ4 Gm26576-201ENSMUST00000181018 1977 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gpc3Q8CFZ4 1700029J07Rik-201ENSMUST00000095323 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gpc3Q8CFZ4 Tpbg-202ENSMUST00000098500 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gpc3Q8CFZ4 AC161252.3-201ENSMUST00000225465 1549 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Gpc3Q8CFZ4 Sec11a-203ENSMUST00000119980 903 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gpc3Q8CFZ4 Klk12-201ENSMUST00000014063 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
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Gpc3Q8CFZ4 Kctd17-202ENSMUST00000159771 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gpc3Q8CFZ4 Alms1-ps2-201ENSMUST00000160606 1170 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
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Gpc3Q8CFZ4 Slc39a8-202ENSMUST00000081978 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gpc3Q8CFZ4 Ppp1r15a-202ENSMUST00000167273 2809 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
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Gpc3Q8CFZ4 Dimt1-201ENSMUST00000022203 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gpc3Q8CFZ4 Mpl-201ENSMUST00000006556 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gpc3Q8CFZ4 Usp33-201ENSMUST00000026507 4153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gpc3Q8CFZ4 Gm8131-201ENSMUST00000213783 1570 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Gpc3Q8CFZ4 Cbln4-201ENSMUST00000087950 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gpc3Q8CFZ4 Srcin1-202ENSMUST00000107593 3733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gpc3Q8CFZ4 Tmem181b-ps-203ENSMUST00000188746 1626 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gpc3Q8CFZ4 Gm7324-201ENSMUST00000094051 1647 ntAPPRIS P1 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gpc3Q8CFZ4 Ctnnd2-203ENSMUST00000226119 4111 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gpc3Q8CFZ4 Nfyc-201ENSMUST00000043429 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gpc3Q8CFZ4 Exosc5-206ENSMUST00000206561 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gpc3Q8CFZ4 Morn1-201ENSMUST00000030915 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gpc3Q8CFZ4 Ctu2-201ENSMUST00000116412 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gpc3Q8CFZ4 Fubp1-206ENSMUST00000196739 2526 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gpc3Q8CFZ4 Tns1-222ENSMUST00000212888 5643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gpc3Q8CFZ4 Leng8-201ENSMUST00000037472 5105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Gpc3Q8CFZ4 Gm13859-201ENSMUST00000119936 1423 ntBASIC14.83□□□□□ -0.03
Gpc3Q8CFZ4 Clec4g-201ENSMUST00000058040 1441 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.03
Gpc3Q8CFZ4 Zbed4-201ENSMUST00000041297 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Gpc3Q8CFZ4 Gpc5-201ENSMUST00000022707 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Gpc3Q8CFZ4 Gm15222-202ENSMUST00000228667 1726 ntBASIC14.83□□□□□ -0.03
Gpc3Q8CFZ4 Kcnma1-228ENSMUST00000224468 3753 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.83□□□□□ -0.03
Gpc3Q8CFZ4 Siglecf-203ENSMUST00000122423 2607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Gpc3Q8CFZ4 Mto1-201ENSMUST00000034896 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Gpc3Q8CFZ4 Gm28182-201ENSMUST00000188354 2477 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
Gpc3Q8CFZ4 Grik5-201ENSMUST00000003468 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Gpc3Q8CFZ4 Vamp2-201ENSMUST00000021273 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
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