Protein–RNA interactions for Protein: Q8CCI5

Rybp, RING1 and YY1-binding protein, mousemouse

Predictions only

Length 228 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RybpQ8CCI5 9930104L06Rik-201ENSMUST00000094769 2911 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
RybpQ8CCI5 Kctd14-201ENSMUST00000050732 2343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
RybpQ8CCI5 Inpp4a-209ENSMUST00000140264 3676 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
RybpQ8CCI5 Zbtb25-204ENSMUST00000176278 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
RybpQ8CCI5 B4galnt1-201ENSMUST00000006914 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
RybpQ8CCI5 Celf4-203ENSMUST00000223704 2492 ntAPPRIS ALT1 BASIC13.02□□□□□ -0.32
RybpQ8CCI5 Apol8-202ENSMUST00000089450 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.32
RybpQ8CCI5 Cd300lf-203ENSMUST00000106562 1762 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
RybpQ8CCI5 Xpr1-203ENSMUST00000111775 4094 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.32
RybpQ8CCI5 Gbf1-201ENSMUST00000026254 6450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
RybpQ8CCI5 Pank1-201ENSMUST00000036584 3460 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
RybpQ8CCI5 Chst15-201ENSMUST00000077472 5041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
RybpQ8CCI5 Adamts8-201ENSMUST00000068135 3631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
RybpQ8CCI5 Ak1-201ENSMUST00000068271 2034 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
RybpQ8CCI5 Ubtf-209ENSMUST00000173870 2936 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
RybpQ8CCI5 Sertad2-203ENSMUST00000109586 5515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
RybpQ8CCI5 Rpl36al-203ENSMUST00000110620 757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.33
RybpQ8CCI5 Gm5866-201ENSMUST00000177881 973 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
RybpQ8CCI5 Gm27437-201ENSMUST00000183429 107 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
RybpQ8CCI5 Dap-204ENSMUST00000186425 597 ntTSL 3 BASIC13.02□□□□□ -0.33
RybpQ8CCI5 Kansl3-206ENSMUST00000187628 336 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
RybpQ8CCI5 Gm37267-201ENSMUST00000194222 681 ntTSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.33
RybpQ8CCI5 Gm31816-201ENSMUST00000209388 1294 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
RybpQ8CCI5 Lpcat1-208ENSMUST00000223060 2141 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
RybpQ8CCI5 AC154846.1-201ENSMUST00000226278 862 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
RybpQ8CCI5 AC132863.2-201ENSMUST00000226643 799 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
RybpQ8CCI5 Selenow-201ENSMUST00000044355 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
RybpQ8CCI5 Mlf1-202ENSMUST00000077916 1114 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
RybpQ8CCI5 Crat-202ENSMUST00000102854 2160 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
RybpQ8CCI5 Ispd-205ENSMUST00000221895 4022 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
RybpQ8CCI5 Vipr1-201ENSMUST00000035115 4902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
RybpQ8CCI5 Plagl1-202ENSMUST00000121646 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
RybpQ8CCI5 Adam22-207ENSMUST00000115388 9161 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
RybpQ8CCI5 Prr18-201ENSMUST00000069742 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
RybpQ8CCI5 Gm28182-201ENSMUST00000188354 2477 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
RybpQ8CCI5 Pnck-201ENSMUST00000002087 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
RybpQ8CCI5 Hsf4-206ENSMUST00000173859 1576 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
RybpQ8CCI5 Hnrnpa2b1-204ENSMUST00000203220 1638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
RybpQ8CCI5 Ncln-202ENSMUST00000118498 2841 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
RybpQ8CCI5 Atf7-202ENSMUST00000108828 2887 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
RybpQ8CCI5 Il18r1-204ENSMUST00000193391 1738 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
RybpQ8CCI5 Zfp57-201ENSMUST00000069250 1749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
RybpQ8CCI5 Sirt5-207ENSMUST00000221515 1793 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
RybpQ8CCI5 P2ry2-201ENSMUST00000037540 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
RybpQ8CCI5 Cenpl-203ENSMUST00000111620 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
RybpQ8CCI5 Dcaf7-201ENSMUST00000058438 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
RybpQ8CCI5 Tc2n-203ENSMUST00000160830 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
RybpQ8CCI5 Ccdc117-201ENSMUST00000020776 3372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
RybpQ8CCI5 Prkcq-201ENSMUST00000028118 3583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
RybpQ8CCI5 Fn1-201ENSMUST00000055226 8315 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
RybpQ8CCI5 Gm37411-201ENSMUST00000194180 2282 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
RybpQ8CCI5 Pou2f2-201ENSMUST00000098679 2340 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
RybpQ8CCI5 Mfn2-202ENSMUST00000105714 2427 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
RybpQ8CCI5 Trf-201ENSMUST00000035158 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
RybpQ8CCI5 Mob1a-202ENSMUST00000055261 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
RybpQ8CCI5 Gm43056-201ENSMUST00000197865 2791 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
RybpQ8CCI5 Timp3-201ENSMUST00000020234 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
RybpQ8CCI5 Six3os1-211ENSMUST00000176958 2889 ntTSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
RybpQ8CCI5 Gm2895-201ENSMUST00000171591 3194 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
RybpQ8CCI5 Car4-201ENSMUST00000103194 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
RybpQ8CCI5 Rgs19-203ENSMUST00000108771 1110 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
RybpQ8CCI5 Rgs19-205ENSMUST00000108776 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
RybpQ8CCI5 Gm12585-201ENSMUST00000117307 290 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
RybpQ8CCI5 4930417O22Rik-201ENSMUST00000123249 1184 ntTSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
RybpQ8CCI5 Gm11724-201ENSMUST00000125577 472 ntTSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
RybpQ8CCI5 Rpl27a-203ENSMUST00000143107 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
RybpQ8CCI5 Gm17409-201ENSMUST00000167423 962 ntAPPRIS P1 BASIC13.01□□□□□ -0.33
RybpQ8CCI5 Bpnt1-205ENSMUST00000210277 1226 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
RybpQ8CCI5 Saa2-203ENSMUST00000210769 652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
RybpQ8CCI5 Gm30934-201ENSMUST00000215803 815 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
RybpQ8CCI5 AC165157.4-201ENSMUST00000220587 139 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
RybpQ8CCI5 AC124732.1-201ENSMUST00000221551 910 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
RybpQ8CCI5 Arl3-201ENSMUST00000026009 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
RybpQ8CCI5 Saa2-201ENSMUST00000075982 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
RybpQ8CCI5 Wdfy2-201ENSMUST00000014691 6646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
RybpQ8CCI5 Syt7-204ENSMUST00000223586 1344 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
RybpQ8CCI5 Aurkc-204ENSMUST00000208049 1401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
RybpQ8CCI5 Olfr95-202ENSMUST00000216318 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
RybpQ8CCI5 Alx1-208ENSMUST00000219194 1695 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
RybpQ8CCI5 R3hcc1-202ENSMUST00000121142 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
RybpQ8CCI5 Srp72-202ENSMUST00000120550 2297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
RybpQ8CCI5 Car10-203ENSMUST00000107858 2742 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
RybpQ8CCI5 P4hb-201ENSMUST00000026122 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
RybpQ8CCI5 Kcnq1-201ENSMUST00000009689 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
RybpQ8CCI5 Arap1-204ENSMUST00000107010 5147 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
RybpQ8CCI5 Kif1a-210ENSMUST00000190723 6141 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
RybpQ8CCI5 Ints7-201ENSMUST00000045450 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
RybpQ8CCI5 Syngap1-202ENSMUST00000177932 3927 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
RybpQ8CCI5 Ptp4a2-207ENSMUST00000165853 3382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
RybpQ8CCI5 Jun-201ENSMUST00000107094 3189 ntAPPRIS P1 BASIC13□□□□□ -0.33
RybpQ8CCI5 Gm43951-201ENSMUST00000204457 2889 ntAPPRIS P1 BASIC13□□□□□ -0.33
RybpQ8CCI5 Hes2-201ENSMUST00000030782 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
RybpQ8CCI5 Leng9-201ENSMUST00000058358 2460 ntAPPRIS P1 BASIC13□□□□□ -0.33
RybpQ8CCI5 Pcdh10-203ENSMUST00000171554 7273 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
RybpQ8CCI5 Ppp1r16b-201ENSMUST00000045503 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
RybpQ8CCI5 Plxnb2-202ENSMUST00000109331 6377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
RybpQ8CCI5 Traf1-201ENSMUST00000028234 2069 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
RybpQ8CCI5 Ffar2-202ENSMUST00000163504 1913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
RybpQ8CCI5 Tbc1d10c-201ENSMUST00000045864 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
RybpQ8CCI5 Jaml-204ENSMUST00000215880 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.5 ms