Protein–RNA interactions for Protein: Q8BK35

Nop53, Ribosome biogenesis protein NOP53, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 484 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nop53Q8BK35 1700003M07Rik-202ENSMUST00000147634 564 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Nop53Q8BK35 AA543401-201ENSMUST00000164248 1269 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
Nop53Q8BK35 Arpp19-210ENSMUST00000170308 429 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Nop53Q8BK35 Gm10576-201ENSMUST00000191927 825 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
Nop53Q8BK35 Lmo4-207ENSMUST00000196264 1263 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Nop53Q8BK35 Rnf138rt1-201ENSMUST00000059320 1191 ntAPPRIS P1 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Nop53Q8BK35 Smim4-202ENSMUST00000064032 791 ntTSL 3 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Nop53Q8BK35 Gps1-201ENSMUST00000100134 1925 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Nop53Q8BK35 Ecm1-202ENSMUST00000117507 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Nop53Q8BK35 Src-202ENSMUST00000092576 3887 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Nop53Q8BK35 Gm6018-201ENSMUST00000216090 1306 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
Nop53Q8BK35 Ebf4-201ENSMUST00000110286 2670 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Nop53Q8BK35 Slc52a3-201ENSMUST00000073228 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Nop53Q8BK35 Vwc2-202ENSMUST00000109681 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Nop53Q8BK35 Dlgap3-203ENSMUST00000106094 4207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Nop53Q8BK35 Atxn2l-201ENSMUST00000040202 3853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Nop53Q8BK35 Fam214b-202ENSMUST00000107956 3107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Nop53Q8BK35 Suv39h1-203ENSMUST00000115638 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Nop53Q8BK35 Tsc22d3-203ENSMUST00000112996 1552 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Nop53Q8BK35 Tbx3-203ENSMUST00000121021 4777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Nop53Q8BK35 Cep295nl-202ENSMUST00000168100 1602 ntAPPRIS P1 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Nop53Q8BK35 Cobl-208ENSMUST00000172919 2566 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Nop53Q8BK35 Syngap1-201ENSMUST00000081285 4315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Nop53Q8BK35 Tbc1d16-201ENSMUST00000036113 6986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Nop53Q8BK35 Rapgef6-205ENSMUST00000108895 1829 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Nop53Q8BK35 Wrap53-201ENSMUST00000048139 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Nop53Q8BK35 Tcn2-204ENSMUST00000109990 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Nop53Q8BK35 Gm37133-201ENSMUST00000192705 1922 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Nop53Q8BK35 Pik3cd-201ENSMUST00000038859 4905 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Nop53Q8BK35 Trp73-201ENSMUST00000097762 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Nop53Q8BK35 Prrt3-202ENSMUST00000204134 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Nop53Q8BK35 Pdpk1-204ENSMUST00000115409 4623 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Nop53Q8BK35 Tdg-208ENSMUST00000151390 3502 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Nop53Q8BK35 Gpc2-201ENSMUST00000014089 2514 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Nop53Q8BK35 Gm6222-201ENSMUST00000120787 396 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Nop53Q8BK35 Mpped1-210ENSMUST00000172115 795 ntTSL 3 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Nop53Q8BK35 Mpped1-211ENSMUST00000172398 795 ntTSL 3 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Nop53Q8BK35 Skiv2l-ps1-201ENSMUST00000173935 658 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Nop53Q8BK35 Gm26517-201ENSMUST00000181279 1172 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Nop53Q8BK35 Mir6956-201ENSMUST00000183598 62 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
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Nop53Q8BK35 AA619741-201ENSMUST00000195095 646 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Nop53Q8BK35 Pomc-201ENSMUST00000020990 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Nop53Q8BK35 Ccdc88c-204ENSMUST00000223097 1253 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Nop53Q8BK35 Tssk3-201ENSMUST00000000421 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Nop53Q8BK35 Tppp3-203ENSMUST00000177126 1396 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Nop53Q8BK35 E430024P14Rik-203ENSMUST00000160545 2833 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Nop53Q8BK35 Iws1-206ENSMUST00000212675 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Nop53Q8BK35 Bptf-203ENSMUST00000106763 12036 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Nop53Q8BK35 Pigg-202ENSMUST00000118910 3030 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Nop53Q8BK35 Ap3s1-201ENSMUST00000025357 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Nop53Q8BK35 Gm26604-201ENSMUST00000180926 1766 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Nop53Q8BK35 Dcaf7-201ENSMUST00000058438 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Nop53Q8BK35 Ric8b-202ENSMUST00000095385 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
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Nop53Q8BK35 Gm24932-201ENSMUST00000103763 110 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
Nop53Q8BK35 Gm24115-201ENSMUST00000103799 110 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
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Nop53Q8BK35 Gm28018-201ENSMUST00000103869 110 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
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Nop53Q8BK35 Atf7ip2-203ENSMUST00000117220 1230 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
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Nop53Q8BK35 Gm27359-201ENSMUST00000184153 110 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
Nop53Q8BK35 Gm27785-201ENSMUST00000184268 110 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
Nop53Q8BK35 Gm27466-201ENSMUST00000184396 110 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
Nop53Q8BK35 Gm27703-201ENSMUST00000184836 110 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
Nop53Q8BK35 Gm40123-201ENSMUST00000198175 1027 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Nop53Q8BK35 Gm42560-201ENSMUST00000201216 1023 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Nop53Q8BK35 1700128F08Rik-202ENSMUST00000213708 717 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
Nop53Q8BK35 AC139382.1-201ENSMUST00000221402 498 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
Nop53Q8BK35 Sppl2a-201ENSMUST00000028844 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Nop53Q8BK35 Eif4e3-201ENSMUST00000032151 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
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