Protein–RNA interactions for Protein: Q8BJL0

Smarcal1, SWI/SNF-related matrix-associated actin-dependent regulator of chromatin subfamily A-like protein 1, mousemouse

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Length 910 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smarcal1Q8BJL0 Oprm1-201ENSMUST00000000783 1500 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Smarcal1Q8BJL0 Hpcal4-202ENSMUST00000106246 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Smarcal1Q8BJL0 Tcf19-202ENSMUST00000160885 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Smarcal1Q8BJL0 Maged2-201ENSMUST00000026302 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Smarcal1Q8BJL0 Vps51-204ENSMUST00000159832 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Smarcal1Q8BJL0 Prkcd-207ENSMUST00000112210 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Smarcal1Q8BJL0 Mmp28-203ENSMUST00000108137 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Smarcal1Q8BJL0 Cct4-204ENSMUST00000173867 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Smarcal1Q8BJL0 Vcan-205ENSMUST00000159337 2273 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Smarcal1Q8BJL0 Pex3-202ENSMUST00000105539 1961 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Smarcal1Q8BJL0 Tspan32-206ENSMUST00000105925 1376 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Smarcal1Q8BJL0 Folr1-205ENSMUST00000106986 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Smarcal1Q8BJL0 Gm27206-201ENSMUST00000154038 979 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Smarcal1Q8BJL0 Ssr4-208ENSMUST00000166518 800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Smarcal1Q8BJL0 Gm5370-201ENSMUST00000187187 574 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Smarcal1Q8BJL0 Dnd1-ps-201ENSMUST00000196992 964 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Smarcal1Q8BJL0 Gm43755-201ENSMUST00000200001 408 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Smarcal1Q8BJL0 Gm42303-201ENSMUST00000209960 1170 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Smarcal1Q8BJL0 Itm2b-204ENSMUST00000228637 783 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Smarcal1Q8BJL0 Taldo1-201ENSMUST00000026576 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Smarcal1Q8BJL0 Gm13199-201ENSMUST00000071016 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Smarcal1Q8BJL0 Coro6-203ENSMUST00000079770 1298 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Smarcal1Q8BJL0 Dnm1-217ENSMUST00000202578 2820 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Smarcal1Q8BJL0 Scarf1-202ENSMUST00000118243 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Smarcal1Q8BJL0 St6gal2-202ENSMUST00000086878 2606 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Smarcal1Q8BJL0 Ube2d3-210ENSMUST00000197539 2515 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Smarcal1Q8BJL0 Sema6c-213ENSMUST00000168321 3553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Smarcal1Q8BJL0 Zmynd15-202ENSMUST00000092958 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Smarcal1Q8BJL0 Rreb1-202ENSMUST00000110237 4617 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Smarcal1Q8BJL0 Rasal3-204ENSMUST00000135618 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Smarcal1Q8BJL0 Mypn-202ENSMUST00000218978 1833 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Smarcal1Q8BJL0 Csnk1g2-202ENSMUST00000085435 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Smarcal1Q8BJL0 Ptprv-210ENSMUST00000183317 6108 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Smarcal1Q8BJL0 Ninj1-202ENSMUST00000120733 1321 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Smarcal1Q8BJL0 Olfr61-202ENSMUST00000210241 1348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Smarcal1Q8BJL0 Sez6-202ENSMUST00000093995 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Smarcal1Q8BJL0 Cspp1-205ENSMUST00000122156 2535 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Smarcal1Q8BJL0 Nkx3-1-201ENSMUST00000022646 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Smarcal1Q8BJL0 Gm37019-201ENSMUST00000192133 2134 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Smarcal1Q8BJL0 Pcdh7-202ENSMUST00000094783 3752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Smarcal1Q8BJL0 Las1l-202ENSMUST00000113864 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Smarcal1Q8BJL0 Tmem94-201ENSMUST00000093912 5329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Smarcal1Q8BJL0 Loxl2-202ENSMUST00000100420 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Smarcal1Q8BJL0 4933409G03Rik-201ENSMUST00000102713 1263 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Smarcal1Q8BJL0 1700049J03Rik-201ENSMUST00000011196 421 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Smarcal1Q8BJL0 Rhox2f-201ENSMUST00000115173 799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Smarcal1Q8BJL0 Gm5187-201ENSMUST00000117317 991 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Smarcal1Q8BJL0 Gm16177-201ENSMUST00000120728 718 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Smarcal1Q8BJL0 Tbx3os1-203ENSMUST00000140101 490 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Smarcal1Q8BJL0 Gm2639-201ENSMUST00000156881 1297 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Smarcal1Q8BJL0 Synj2bp-205ENSMUST00000169158 691 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Smarcal1Q8BJL0 Pbx2-205ENSMUST00000183827 1186 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Smarcal1Q8BJL0 Ssr2-202ENSMUST00000192495 620 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Smarcal1Q8BJL0 Gm8598-201ENSMUST00000221184 836 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Smarcal1Q8BJL0 Rrp36-201ENSMUST00000024766 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Smarcal1Q8BJL0 Mal-201ENSMUST00000028853 486 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Smarcal1Q8BJL0 Aspdh-201ENSMUST00000035929 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Smarcal1Q8BJL0 B230118H07Rik-202ENSMUST00000099682 895 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Smarcal1Q8BJL0 Lats2-210ENSMUST00000174694 3287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Smarcal1Q8BJL0 Zfp606-201ENSMUST00000098822 4748 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Smarcal1Q8BJL0 Apbb1-212ENSMUST00000189072 2085 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Smarcal1Q8BJL0 Dis3-201ENSMUST00000042471 5150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Smarcal1Q8BJL0 Trim24-203ENSMUST00000120428 3940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Smarcal1Q8BJL0 Epha2-201ENSMUST00000006614 3913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Smarcal1Q8BJL0 Thumpd1-201ENSMUST00000033236 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Smarcal1Q8BJL0 Eef1e1-201ENSMUST00000001757 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Smarcal1Q8BJL0 Rps13-203ENSMUST00000205490 1317 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Smarcal1Q8BJL0 Col8a2-201ENSMUST00000070132 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Smarcal1Q8BJL0 Rnf180-203ENSMUST00000224662 2734 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.65□□□□□ -0.07
Smarcal1Q8BJL0 Synm-204ENSMUST00000208231 4457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Smarcal1Q8BJL0 Gm9946-202ENSMUST00000162741 1580 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Smarcal1Q8BJL0 Fbxo34-203ENSMUST00000163324 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Smarcal1Q8BJL0 Qsox1-207ENSMUST00000194632 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Smarcal1Q8BJL0 Slc4a4-207ENSMUST00000148750 7931 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Smarcal1Q8BJL0 Ebf4-202ENSMUST00000110287 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Smarcal1Q8BJL0 Mavs-202ENSMUST00000110199 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Smarcal1Q8BJL0 Arhgef2-223ENSMUST00000176804 3086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Smarcal1Q8BJL0 Cct6b-202ENSMUST00000100722 1871 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Smarcal1Q8BJL0 Klk7-201ENSMUST00000032955 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Smarcal1Q8BJL0 Mir1247-201ENSMUST00000116706 82 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Smarcal1Q8BJL0 Cdk4-202ENSMUST00000120226 714 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Smarcal1Q8BJL0 Myadml2os-201ENSMUST00000126642 1044 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Smarcal1Q8BJL0 Gm16229-201ENSMUST00000133270 1232 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Smarcal1Q8BJL0 Gm4219-201ENSMUST00000168140 2143 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Smarcal1Q8BJL0 Proscos-202ENSMUST00000178990 666 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Smarcal1Q8BJL0 Gm8565-201ENSMUST00000183259 1014 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Smarcal1Q8BJL0 Gm36198-201ENSMUST00000217490 416 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Smarcal1Q8BJL0 Gemin7-201ENSMUST00000051364 763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Smarcal1Q8BJL0 Olfr54-201ENSMUST00000072152 942 ntAPPRIS P1 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Smarcal1Q8BJL0 Olfr1375-201ENSMUST00000073543 942 ntAPPRIS P1 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Smarcal1Q8BJL0 Olfr707-201ENSMUST00000088687 924 ntAPPRIS P1 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Smarcal1Q8BJL0 Olfr1532-ps1-201ENSMUST00000098140 924 ntAPPRIS P1 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Smarcal1Q8BJL0 Ccdc33-202ENSMUST00000098681 1093 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Smarcal1Q8BJL0 Slc25a19-212ENSMUST00000178003 2614 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Smarcal1Q8BJL0 Oxtr-201ENSMUST00000053306 4704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Smarcal1Q8BJL0 Olfr317-202ENSMUST00000215513 2769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Smarcal1Q8BJL0 Bag6-202ENSMUST00000166426 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Smarcal1Q8BJL0 Vax2os-201ENSMUST00000123402 1435 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Smarcal1Q8BJL0 Trim26-202ENSMUST00000123715 1406 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Smarcal1Q8BJL0 Ldlrap1-201ENSMUST00000037828 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
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