Protein–RNA interactions for Protein: Q640L5

Ccdc18, Coiled-coil domain-containing protein 18, mousemouse

Predictions only

Length 1,455 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc18Q640L5 Gngt2-207ENSMUST00000107714 558 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ccdc18Q640L5 Gm14263-201ENSMUST00000117955 746 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
Ccdc18Q640L5 AA914427-201ENSMUST00000193194 1166 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
Ccdc18Q640L5 Gm31256-201ENSMUST00000194705 506 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
Ccdc18Q640L5 Gm43947-201ENSMUST00000203019 959 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
Ccdc18Q640L5 Treml1-201ENSMUST00000024792 1235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ccdc18Q640L5 Rpl10a-201ENSMUST00000042334 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ccdc18Q640L5 Itln1-201ENSMUST00000043094 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ccdc18Q640L5 Eif4e2-206ENSMUST00000113233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ccdc18Q640L5 Mphosph8-201ENSMUST00000116468 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ccdc18Q640L5 Gria4-203ENSMUST00000163309 2338 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ccdc18Q640L5 Papd7-201ENSMUST00000044081 3994 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ccdc18Q640L5 Meis2-204ENSMUST00000110906 3229 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ccdc18Q640L5 Ncbp2-201ENSMUST00000023460 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ccdc18Q640L5 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ccdc18Q640L5 Coro1c-201ENSMUST00000004646 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ccdc18Q640L5 Gm26565-201ENSMUST00000181642 1968 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ccdc18Q640L5 2410002F23Rik-218ENSMUST00000188382 2301 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ccdc18Q640L5 Slc5a2-202ENSMUST00000118169 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ccdc18Q640L5 Smarcd1-201ENSMUST00000023759 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ccdc18Q640L5 Gm9867-201ENSMUST00000192212 2647 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
Ccdc18Q640L5 Mfap4-202ENSMUST00000064783 1722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ccdc18Q640L5 Gm14130-201ENSMUST00000118417 987 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
Ccdc18Q640L5 Mrps17-205ENSMUST00000119985 859 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ccdc18Q640L5 Gm13665-201ENSMUST00000120830 528 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
Ccdc18Q640L5 AC069562.3-201ENSMUST00000225387 587 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
Ccdc18Q640L5 Nmnat1-201ENSMUST00000030845 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ccdc18Q640L5 Asb8-201ENSMUST00000059112 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ccdc18Q640L5 Olfr1423-201ENSMUST00000087831 933 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ccdc18Q640L5 Zfp932-201ENSMUST00000099484 451 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ccdc18Q640L5 Slc12a8-202ENSMUST00000117134 2081 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Ccdc18Q640L5 Mpl-201ENSMUST00000006556 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Ccdc18Q640L5 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Ccdc18Q640L5 4833439L19Rik-201ENSMUST00000026989 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ccdc18Q640L5 Alkbh3os1-201ENSMUST00000028621 1549 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ccdc18Q640L5 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ccdc18Q640L5 Men1-203ENSMUST00000079327 2639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ccdc18Q640L5 Cd72-202ENSMUST00000098104 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ccdc18Q640L5 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ccdc18Q640L5 Zbtb20-202ENSMUST00000114690 2759 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ccdc18Q640L5 Zfp566-201ENSMUST00000088785 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ccdc18Q640L5 Bcor-203ENSMUST00000115512 6887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ccdc18Q640L5 Ccdc167-202ENSMUST00000128751 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ccdc18Q640L5 Gm8862-201ENSMUST00000198379 1346 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
Ccdc18Q640L5 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ccdc18Q640L5 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ccdc18Q640L5 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ccdc18Q640L5 Lamtor2-202ENSMUST00000119002 568 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ccdc18Q640L5 AC123857.2-201ENSMUST00000225756 1582 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
Ccdc18Q640L5 Msantd3-201ENSMUST00000061135 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ccdc18Q640L5 Dnajb4-204ENSMUST00000144950 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ccdc18Q640L5 Vav1-203ENSMUST00000112870 2743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ccdc18Q640L5 Faf1-201ENSMUST00000102724 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ccdc18Q640L5 Tekt2-201ENSMUST00000030658 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ccdc18Q640L5 Acot7-202ENSMUST00000075363 1457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ccdc18Q640L5 4932422M17Rik-201ENSMUST00000195992 2639 ntBASIC22■■□□□ 1.11
Ccdc18Q640L5 Atp6ap1-201ENSMUST00000019231 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Ccdc18Q640L5 Evl-203ENSMUST00000109854 1870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Ccdc18Q640L5 Avpr1a-201ENSMUST00000020323 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Ccdc18Q640L5 Prr15l-201ENSMUST00000054311 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Ccdc18Q640L5 Tmem28-201ENSMUST00000096363 3909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Ccdc18Q640L5 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Ccdc18Q640L5 Ccdc188-201ENSMUST00000167061 747 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Ccdc18Q640L5 Gm25732-201ENSMUST00000175168 60 ntBASIC22■■□□□ 1.11
Ccdc18Q640L5 1700065D16Rik-203ENSMUST00000189279 393 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
Ccdc18Q640L5 Tlk2-209ENSMUST00000145048 2776 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Ccdc18Q640L5 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Ccdc18Q640L5 Fbln7-201ENSMUST00000028864 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Ccdc18Q640L5 Papd7-204ENSMUST00000223344 2118 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
Ccdc18Q640L5 Epsti1-201ENSMUST00000022591 1870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Ccdc18Q640L5 Bend7-201ENSMUST00000056914 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Ccdc18Q640L5 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ccdc18Q640L5 Kifc5c-ps-201ENSMUST00000179040 1530 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
Ccdc18Q640L5 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ccdc18Q640L5 Gm15276-201ENSMUST00000145953 498 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
Ccdc18Q640L5 Rps13-201ENSMUST00000170953 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ccdc18Q640L5 Ntan1-201ENSMUST00000023362 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ccdc18Q640L5 Tmem14a-202ENSMUST00000027065 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ccdc18Q640L5 Gm6502-202ENSMUST00000097478 1218 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ccdc18Q640L5 Tsc22d4-203ENSMUST00000100540 2730 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ccdc18Q640L5 Spats2l-203ENSMUST00000164302 2088 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ccdc18Q640L5 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ccdc18Q640L5 Ppp1r3g-201ENSMUST00000132661 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ccdc18Q640L5 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ccdc18Q640L5 Stk38-202ENSMUST00000119274 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ccdc18Q640L5 Yipf1-201ENSMUST00000075693 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ccdc18Q640L5 Cd300lf-202ENSMUST00000106561 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ccdc18Q640L5 Trim45-203ENSMUST00000106980 3337 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ccdc18Q640L5 Rspo4-201ENSMUST00000042217 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ccdc18Q640L5 Gm23270-201ENSMUST00000104055 131 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
Ccdc18Q640L5 Snord83b-201ENSMUST00000104546 94 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
Ccdc18Q640L5 Atp5d-202ENSMUST00000105366 781 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ccdc18Q640L5 Mogat1-202ENSMUST00000113524 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ccdc18Q640L5 Cep97-206ENSMUST00000122280 1057 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ccdc18Q640L5 Gm14809-201ENSMUST00000152025 695 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ccdc18Q640L5 Gm20457-201ENSMUST00000173374 682 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ccdc18Q640L5 1700125G22Rik-201ENSMUST00000181124 861 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ccdc18Q640L5 2610016A17Rik-202ENSMUST00000186768 689 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
Ccdc18Q640L5 Gm29787-201ENSMUST00000222129 849 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
Ccdc18Q640L5 Rsph1-201ENSMUST00000024832 1164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
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