Protein–RNA interactions for Protein: Q61361

Bcan, Brevican core protein, mousemouse

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Length 883 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BcanQ61361 Ccno-201ENSMUST00000038404 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
BcanQ61361 Ric8b-202ENSMUST00000095385 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
BcanQ61361 Ddx27-201ENSMUST00000018143 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
BcanQ61361 Zfp109-203ENSMUST00000206960 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
BcanQ61361 Nt5e-201ENSMUST00000034992 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
BcanQ61361 Ptprs-202ENSMUST00000086828 5608 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
BcanQ61361 Serinc1-201ENSMUST00000020027 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
BcanQ61361 Ldhb-201ENSMUST00000032373 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
BcanQ61361 Pbx3-201ENSMUST00000040638 2587 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
BcanQ61361 Ints14-201ENSMUST00000037504 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
BcanQ61361 Dstyk-204ENSMUST00000188389 3232 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
BcanQ61361 Gm13859-201ENSMUST00000119936 1423 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
BcanQ61361 Serpine3-201ENSMUST00000171692 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
BcanQ61361 C530008M17Rik-205ENSMUST00000121851 1165 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
BcanQ61361 Calhm3-201ENSMUST00000178630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
BcanQ61361 Srgn-201ENSMUST00000020271 938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
BcanQ61361 Gm7287-201ENSMUST00000205267 602 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
BcanQ61361 Degs2-201ENSMUST00000021691 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
BcanQ61361 Lrp8os1-201ENSMUST00000030352 672 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
BcanQ61361 1700018B08Rik-201ENSMUST00000034265 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
BcanQ61361 Rnaseh2a-210ENSMUST00000147812 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
BcanQ61361 Rad51-201ENSMUST00000028795 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
BcanQ61361 Il1r1-202ENSMUST00000114795 4832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
BcanQ61361 Nomo1-201ENSMUST00000033121 4257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
BcanQ61361 Phf23-209ENSMUST00000153684 1797 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
BcanQ61361 Tspan32-206ENSMUST00000105925 1376 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
BcanQ61361 Brix1-201ENSMUST00000022855 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
BcanQ61361 Rad54l2-201ENSMUST00000046502 9305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
BcanQ61361 Hif1a-201ENSMUST00000021530 4724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
BcanQ61361 Lims2-201ENSMUST00000025254 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
BcanQ61361 Gm26576-201ENSMUST00000181018 1977 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
BcanQ61361 Asb18-201ENSMUST00000086882 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
BcanQ61361 Itgb3-201ENSMUST00000021028 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
BcanQ61361 Hells-201ENSMUST00000025965 5868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
BcanQ61361 Rhbdl3-201ENSMUST00000017836 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
BcanQ61361 Rab11fip2-201ENSMUST00000051996 4482 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
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BcanQ61361 Slc41a1-201ENSMUST00000086559 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
BcanQ61361 Nop9-201ENSMUST00000019441 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
BcanQ61361 9930104L06Rik-201ENSMUST00000094769 2911 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
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BcanQ61361 Col1a1-201ENSMUST00000001547 5930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
BcanQ61361 Jakmip1-201ENSMUST00000043794 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
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BcanQ61361 Acox3-204ENSMUST00000114238 2825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
BcanQ61361 Slc25a46-201ENSMUST00000060396 4371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
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BcanQ61361 Msx3-201ENSMUST00000055353 2356 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
BcanQ61361 Tnfrsf11a-201ENSMUST00000027559 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
BcanQ61361 Dhx9-202ENSMUST00000186380 4561 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
BcanQ61361 Fam214b-202ENSMUST00000107956 3107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
BcanQ61361 Atrip-201ENSMUST00000045011 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
BcanQ61361 Kctd20-202ENSMUST00000117672 2219 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
BcanQ61361 Sgo2a-201ENSMUST00000027202 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
BcanQ61361 Elmsan1-202ENSMUST00000110294 7156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
BcanQ61361 Fut7-202ENSMUST00000100320 2076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
BcanQ61361 Med4-201ENSMUST00000022705 1328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
BcanQ61361 Aire-216ENSMUST00000156417 1627 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
BcanQ61361 Tlk2-209ENSMUST00000145048 2776 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
BcanQ61361 Lamc2-201ENSMUST00000027753 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
BcanQ61361 Aifm1-202ENSMUST00000114945 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
BcanQ61361 Kctd14-201ENSMUST00000050732 2343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
BcanQ61361 Otop2-201ENSMUST00000055490 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
BcanQ61361 Rbm33-202ENSMUST00000059644 9510 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
BcanQ61361 Scarf1-202ENSMUST00000118243 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
BcanQ61361 Yod1-201ENSMUST00000049813 6128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
BcanQ61361 Apln-201ENSMUST00000039026 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
BcanQ61361 Synm-202ENSMUST00000074233 7818 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
BcanQ61361 2610306M01Rik-201ENSMUST00000185414 1042 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
BcanQ61361 Bst2-201ENSMUST00000051672 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
BcanQ61361 Nat3-201ENSMUST00000070514 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
BcanQ61361 Map2k6-201ENSMUST00000020949 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
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