Protein–RNA interactions for Protein: Q5SSZ5

Tns3, Tensin-3, mousemouse

Predictions only

Length 1,440 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tns3Q5SSZ5 Gm8546-201ENSMUST00000178288 1264 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
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Tns3Q5SSZ5 Pdlim5-206ENSMUST00000195975 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Tns3Q5SSZ5 AC154680.1-201ENSMUST00000224376 859 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Tns3Q5SSZ5 Lypla1-201ENSMUST00000027036 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Tns3Q5SSZ5 Trex2-201ENSMUST00000033738 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Tns3Q5SSZ5 Olfr283-201ENSMUST00000057386 1102 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
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Tns3Q5SSZ5 Bcor-203ENSMUST00000115512 6887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Tns3Q5SSZ5 A330035P11Rik-202ENSMUST00000144926 3074 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Tns3Q5SSZ5 Pkp3-201ENSMUST00000066873 2848 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Tns3Q5SSZ5 Cdcp1-201ENSMUST00000039229 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Tns3Q5SSZ5 Zfand3-201ENSMUST00000057897 2617 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
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Tns3Q5SSZ5 Cym-201ENSMUST00000029504 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Tns3Q5SSZ5 Coro1c-201ENSMUST00000004646 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
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Tns3Q5SSZ5 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
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Tns3Q5SSZ5 Tmem28-201ENSMUST00000096363 3909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
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Tns3Q5SSZ5 Zbtb9-201ENSMUST00000120016 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
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Tns3Q5SSZ5 Gm20470-201ENSMUST00000174654 331 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
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Tns3Q5SSZ5 Tlk2-209ENSMUST00000145048 2776 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Tns3Q5SSZ5 Pir-201ENSMUST00000033749 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Tns3Q5SSZ5 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Tns3Q5SSZ5 Col18a1-202ENSMUST00000081654 5063 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Tns3Q5SSZ5 Ppp2r5b-201ENSMUST00000025695 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Tns3Q5SSZ5 Brsk2-204ENSMUST00000105989 2149 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Tns3Q5SSZ5 Rgs9-201ENSMUST00000020920 2434 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Tns3Q5SSZ5 Nup62-205ENSMUST00000208626 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Tns3Q5SSZ5 Nup62-201ENSMUST00000057195 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Tns3Q5SSZ5 Iffo2-202ENSMUST00000123827 2036 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Tns3Q5SSZ5 Gm17518-201ENSMUST00000181232 1346 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Tns3Q5SSZ5 Med15-202ENSMUST00000080936 3263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Tns3Q5SSZ5 Troap-201ENSMUST00000039665 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Tns3Q5SSZ5 Hist1h4b-201ENSMUST00000102965 397 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Tns3Q5SSZ5 Unc5a-202ENSMUST00000109994 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Tns3Q5SSZ5 Zfp157-203ENSMUST00000110912 886 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Tns3Q5SSZ5 Odf4-202ENSMUST00000125134 646 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Tns3Q5SSZ5 Gm12348-201ENSMUST00000138915 313 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Tns3Q5SSZ5 Gm13381-202ENSMUST00000177012 640 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Tns3Q5SSZ5 Gm27023-201ENSMUST00000182372 285 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Tns3Q5SSZ5 Gm2546-201ENSMUST00000182630 991 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Tns3Q5SSZ5 Gm4691-202ENSMUST00000182989 885 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Tns3Q5SSZ5 1190007I07Rik-205ENSMUST00000185168 469 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Tns3Q5SSZ5 Gm8099-201ENSMUST00000200510 742 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Tns3Q5SSZ5 Net1-206ENSMUST00000222504 447 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Tns3Q5SSZ5 Treml1-205ENSMUST00000225849 974 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Tns3Q5SSZ5 Gm9826-201ENSMUST00000029124 1299 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Tns3Q5SSZ5 Vmn1r213-201ENSMUST00000076897 1155 ntAPPRIS P2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.6 ms