Protein–RNA interactions for Protein: Q3V036

Ccdc27, Coiled-coil domain-containing protein 27, mousemouse

Predictions only

Length 639 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc27Q3V036 Fbxl19-202ENSMUST00000186116 3641 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ccdc27Q3V036 Nol4-206ENSMUST00000164186 2622 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ccdc27Q3V036 Tacc3-202ENSMUST00000079534 2899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ccdc27Q3V036 Itm2b-201ENSMUST00000022704 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ccdc27Q3V036 Stk38-202ENSMUST00000119274 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ccdc27Q3V036 Gm20465-201ENSMUST00000174768 1932 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ccdc27Q3V036 Prrt3-205ENSMUST00000205170 1903 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ccdc27Q3V036 Map3k20-201ENSMUST00000090824 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ccdc27Q3V036 Apbb1-212ENSMUST00000189072 2085 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ccdc27Q3V036 Hlcs-202ENSMUST00000163193 5371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ccdc27Q3V036 Etfdh-201ENSMUST00000029386 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ccdc27Q3V036 Ncaph-201ENSMUST00000110387 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ccdc27Q3V036 Rreb1-202ENSMUST00000110237 4617 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ccdc27Q3V036 Nek7-201ENSMUST00000027642 3737 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ccdc27Q3V036 Aco1-201ENSMUST00000102973 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ccdc27Q3V036 Gm4995-201ENSMUST00000117247 432 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
Ccdc27Q3V036 Serpinf1-202ENSMUST00000125982 605 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ccdc27Q3V036 Ccnd3-208ENSMUST00000182539 931 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ccdc27Q3V036 March3-201ENSMUST00000035278 860 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ccdc27Q3V036 Epc1-202ENSMUST00000050542 565 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ccdc27Q3V036 Rnaseh2a-201ENSMUST00000065049 1006 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ccdc27Q3V036 Slbp-202ENSMUST00000075670 1027 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ccdc27Q3V036 Crxos-201ENSMUST00000098801 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ccdc27Q3V036 Mrps9-201ENSMUST00000057208 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ccdc27Q3V036 Diaph2-207ENSMUST00000167619 8439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ccdc27Q3V036 Eno1b-201ENSMUST00000076155 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ccdc27Q3V036 AC238940.1-201ENSMUST00000225106 1858 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
Ccdc27Q3V036 Gm38102-201ENSMUST00000192791 1935 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
Ccdc27Q3V036 Il11ra1-203ENSMUST00000108041 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ccdc27Q3V036 Pfkfb3-205ENSMUST00000114845 1971 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ccdc27Q3V036 Gm13305-201ENSMUST00000098121 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ccdc27Q3V036 Kars-203ENSMUST00000164470 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ccdc27Q3V036 Kcnj8-202ENSMUST00000203945 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ccdc27Q3V036 Nr1d1-201ENSMUST00000064941 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ccdc27Q3V036 Mir17hg-201ENSMUST00000134140 3536 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ccdc27Q3V036 Lhx1-201ENSMUST00000018842 3846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ccdc27Q3V036 B3gat1-206ENSMUST00000161431 3858 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ccdc27Q3V036 Ikzf4-201ENSMUST00000133342 5150 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ccdc27Q3V036 Irs1-201ENSMUST00000069799 9144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ccdc27Q3V036 Pbrm1-203ENSMUST00000052239 5065 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ccdc27Q3V036 Wapl-205ENSMUST00000169910 4066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ccdc27Q3V036 Secisbp2-201ENSMUST00000040117 3328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ccdc27Q3V036 Miat-205ENSMUST00000182953 9163 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ccdc27Q3V036 Taf6-201ENSMUST00000048698 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ccdc27Q3V036 Elovl6-202ENSMUST00000197070 2275 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ccdc27Q3V036 Cyfip1-201ENSMUST00000032629 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ccdc27Q3V036 F2-202ENSMUST00000111335 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ccdc27Q3V036 Gm26565-201ENSMUST00000181642 1968 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ccdc27Q3V036 Myog-201ENSMUST00000027730 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ccdc27Q3V036 Sebox-201ENSMUST00000001130 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ccdc27Q3V036 Tmem86b-202ENSMUST00000205360 1344 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ccdc27Q3V036 Gm6018-201ENSMUST00000216090 1306 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
Ccdc27Q3V036 Pex11g-202ENSMUST00000111081 666 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ccdc27Q3V036 Mmab-202ENSMUST00000112245 644 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ccdc27Q3V036 Cnbp-202ENSMUST00000113617 952 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ccdc27Q3V036 Mir1895-201ENSMUST00000122615 79 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
Ccdc27Q3V036 Tmem217-202ENSMUST00000168339 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ccdc27Q3V036 Thap4-205ENSMUST00000189728 713 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ccdc27Q3V036 Pomc-201ENSMUST00000020990 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ccdc27Q3V036 Higd1a-206ENSMUST00000215300 605 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ccdc27Q3V036 Mobp-207ENSMUST00000215512 498 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ccdc27Q3V036 Pphln1-203ENSMUST00000109256 3759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ccdc27Q3V036 Mul1-201ENSMUST00000044058 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ccdc27Q3V036 Dars2-201ENSMUST00000035430 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ccdc27Q3V036 Rps6ka5-209ENSMUST00000222731 5642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ccdc27Q3V036 Csnk1a1-202ENSMUST00000163205 3204 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ccdc27Q3V036 Kcnn1-204ENSMUST00000212086 2964 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ccdc27Q3V036 Plcd1-203ENSMUST00000214470 2706 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ccdc27Q3V036 Zfp583-201ENSMUST00000062765 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ccdc27Q3V036 Cpxm2-201ENSMUST00000033149 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ccdc27Q3V036 Men1-207ENSMUST00000113503 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
Ccdc27Q3V036 Arcn1-201ENSMUST00000034607 4072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Ccdc27Q3V036 Dnmt3b-206ENSMUST00000103151 3956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Ccdc27Q3V036 Dyx1c1-202ENSMUST00000098567 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
Ccdc27Q3V036 Ap3s1-201ENSMUST00000025357 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Ccdc27Q3V036 Cavin1-201ENSMUST00000060792 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Ccdc27Q3V036 Smg5-201ENSMUST00000001451 4448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Ccdc27Q3V036 Gm13332-201ENSMUST00000120451 1398 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
Ccdc27Q3V036 Sema4a-213ENSMUST00000165898 3125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Ccdc27Q3V036 9130024F11Rik-201ENSMUST00000135238 1300 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Ccdc27Q3V036 Tspan5-202ENSMUST00000119993 2107 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Ccdc27Q3V036 Gm12882-201ENSMUST00000121696 517 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
Ccdc27Q3V036 Cdk2ap2-204ENSMUST00000174514 669 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Ccdc27Q3V036 Cyba-202ENSMUST00000212600 638 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Ccdc27Q3V036 Trib2-204ENSMUST00000221518 1192 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Ccdc27Q3V036 Ggn-201ENSMUST00000033886 588 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Ccdc27Q3V036 AW209491-202ENSMUST00000178289 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Ccdc27Q3V036 Slc16a3-208ENSMUST00000168579 4335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Ccdc27Q3V036 1700037C18Rik-202ENSMUST00000115859 2592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Ccdc27Q3V036 Ssr1-203ENSMUST00000225246 1825 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
Ccdc27Q3V036 Fam160a2-202ENSMUST00000074686 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Ccdc27Q3V036 Proser3-206ENSMUST00000215288 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Ccdc27Q3V036 Il4ra-201ENSMUST00000033004 5256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Ccdc27Q3V036 Tdrd5-201ENSMUST00000121146 3759 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Ccdc27Q3V036 Gm9924-202ENSMUST00000192760 2311 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
Ccdc27Q3V036 Rnf4-204ENSMUST00000182047 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Ccdc27Q3V036 AC164702.1-201ENSMUST00000220135 2212 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
Ccdc27Q3V036 Ltbp4-203ENSMUST00000118583 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ccdc27Q3V036 Ptprr-204ENSMUST00000128399 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ccdc27Q3V036 E2f3-203ENSMUST00000221536 4597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 74.3 ms