Protein–RNA interactions for Protein: Q3USS0

Gm6899, Predicted gene 6899, mousemouse

Predictions only

Length 134 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm6899Q3USS0 Anks1b-204ENSMUST00000179337 2692 ntTSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Gm6899Q3USS0 Prkx-202ENSMUST00000114044 2639 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Gm6899Q3USS0 Psmd11-201ENSMUST00000017572 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Gm6899Q3USS0 Rimkla-201ENSMUST00000049994 4097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Gm6899Q3USS0 Bscl2-210ENSMUST00000171649 1962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Gm6899Q3USS0 Rcan1-201ENSMUST00000023672 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Gm6899Q3USS0 Vsig10-202ENSMUST00000111967 4236 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Gm6899Q3USS0 Pcdh1-203ENSMUST00000160721 5416 ntTSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Gm6899Q3USS0 Il17rd-203ENSMUST00000225146 3366 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
Gm6899Q3USS0 N6amt1-203ENSMUST00000118310 1700 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Gm6899Q3USS0 Ngef-201ENSMUST00000027477 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Gm6899Q3USS0 Cog7-201ENSMUST00000057576 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Gm6899Q3USS0 Prkcb-202ENSMUST00000064989 2911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Gm6899Q3USS0 Ap2a1-202ENSMUST00000107857 3301 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Gm6899Q3USS0 Dnajc30-201ENSMUST00000071263 1661 ntAPPRIS P1 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Gm6899Q3USS0 Gm10327-201ENSMUST00000105222 1002 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
Gm6899Q3USS0 Cntf-201ENSMUST00000112933 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Gm6899Q3USS0 Gm13612-201ENSMUST00000119276 390 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
Gm6899Q3USS0 Abhd14a-202ENSMUST00000171678 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Gm6899Q3USS0 Gm6244-201ENSMUST00000178732 841 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
Gm6899Q3USS0 AC087891.2-201ENSMUST00000219293 658 ntTSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Gm6899Q3USS0 Atp5d-201ENSMUST00000003156 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Gm6899Q3USS0 Zfp422-202ENSMUST00000079749 3187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Gm6899Q3USS0 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Gm6899Q3USS0 Ubc-203ENSMUST00000156249 2581 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Gm6899Q3USS0 Chtop-205ENSMUST00000107343 3118 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Gm6899Q3USS0 Eya4-206ENSMUST00000219315 3100 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Gm6899Q3USS0 Spata5-209ENSMUST00000198968 2916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Gm6899Q3USS0 Fbxw17-201ENSMUST00000046974 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Gm6899Q3USS0 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Gm6899Q3USS0 4933435G04Rik-201ENSMUST00000205892 2108 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
Gm6899Q3USS0 Cyb561d1-202ENSMUST00000106654 1914 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Gm6899Q3USS0 Creld2-201ENSMUST00000024042 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Gm6899Q3USS0 Mrs2-201ENSMUST00000021772 7035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Gm6899Q3USS0 Thnsl2-202ENSMUST00000160918 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Gm6899Q3USS0 Samd4b-204ENSMUST00000208199 4391 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Gm6899Q3USS0 4833439L19Rik-201ENSMUST00000026989 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Gm6899Q3USS0 Sgpl1-202ENSMUST00000122259 4102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Gm6899Q3USS0 Gm15684-201ENSMUST00000160605 1814 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Gm6899Q3USS0 Mei4-202ENSMUST00000189391 1817 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Gm6899Q3USS0 Zfp318-201ENSMUST00000113481 7850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Gm6899Q3USS0 Cdh7-206ENSMUST00000137092 2681 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Gm6899Q3USS0 C130073E24Rik-201ENSMUST00000210222 6144 ntTSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Gm6899Q3USS0 Gm10010-201ENSMUST00000071101 2346 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Gm6899Q3USS0 Klc2-203ENSMUST00000113728 2838 ntTSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Gm6899Q3USS0 Erfe-201ENSMUST00000086861 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Gm6899Q3USS0 Selenoh-202ENSMUST00000102647 654 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Gm6899Q3USS0 Klk12-201ENSMUST00000014063 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Gm6899Q3USS0 Slc2a9-207ENSMUST00000143758 1296 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Gm6899Q3USS0 Pmepa1os-201ENSMUST00000150185 680 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Gm6899Q3USS0 Rpl18a-ps1-201ENSMUST00000161190 523 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
Gm6899Q3USS0 Gm8598-201ENSMUST00000221184 836 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
Gm6899Q3USS0 Hdhd3-201ENSMUST00000037820 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Gm6899Q3USS0 Kcnk9-201ENSMUST00000044624 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Gm6899Q3USS0 Slc22a2-201ENSMUST00000046959 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Gm6899Q3USS0 Il27-201ENSMUST00000058429 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Gm6899Q3USS0 Gm10371-201ENSMUST00000127429 1411 ntTSL 2 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Gm6899Q3USS0 Hoxd3-202ENSMUST00000111982 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Gm6899Q3USS0 Got1-201ENSMUST00000026196 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Gm6899Q3USS0 Gtf2e2-201ENSMUST00000167264 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Gm6899Q3USS0 Brinp1-201ENSMUST00000030036 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Gm6899Q3USS0 Stau2-215ENSMUST00000162435 2735 ntTSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Gm6899Q3USS0 Bmp3-202ENSMUST00000197143 2739 ntTSL 2 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Gm6899Q3USS0 Morc4-202ENSMUST00000087401 3862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Gm6899Q3USS0 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Gm6899Q3USS0 Ranbp3-201ENSMUST00000002445 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Gm6899Q3USS0 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Gm6899Q3USS0 E430024P14Rik-203ENSMUST00000160545 2833 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Gm6899Q3USS0 Btrc-201ENSMUST00000065601 2978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Gm6899Q3USS0 Tmem260-201ENSMUST00000111735 5485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Gm6899Q3USS0 Noct-201ENSMUST00000023849 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Gm6899Q3USS0 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Gm6899Q3USS0 Il12rb1-205ENSMUST00000212657 2741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Gm6899Q3USS0 Gm44291-201ENSMUST00000203102 2865 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
Gm6899Q3USS0 Commd1-201ENSMUST00000057843 1459 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Gm6899Q3USS0 Apaf1-202ENSMUST00000159110 6433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Gm6899Q3USS0 Lrp2bp-202ENSMUST00000110380 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Gm6899Q3USS0 Il6ra-201ENSMUST00000029559 3343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Gm6899Q3USS0 E530011L22Rik-201ENSMUST00000181325 5282 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
Gm6899Q3USS0 Bag6-203ENSMUST00000172571 3599 ntTSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Gm6899Q3USS0 Selenoh-203ENSMUST00000117299 747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Gm6899Q3USS0 Ift20-203ENSMUST00000128788 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Gm6899Q3USS0 Gm11684-201ENSMUST00000144975 757 ntTSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Gm6899Q3USS0 4930407G08Rik-201ENSMUST00000145831 698 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Gm6899Q3USS0 4932443L11Rik-201ENSMUST00000148353 414 ntTSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Gm6899Q3USS0 1700092C10Rik-201ENSMUST00000172547 585 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Gm6899Q3USS0 Gm42929-201ENSMUST00000198374 1286 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
Gm6899Q3USS0 Lamtor1-201ENSMUST00000033131 1119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Gm6899Q3USS0 Ccl24-201ENSMUST00000004936 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Gm6899Q3USS0 Atpif1-201ENSMUST00000067496 539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Gm6899Q3USS0 Ppil3-201ENSMUST00000081677 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Gm6899Q3USS0 Tada3-203ENSMUST00000099118 1282 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Gm6899Q3USS0 Lmtk2-201ENSMUST00000041804 8114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Gm6899Q3USS0 Gm43273-201ENSMUST00000199649 2594 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
Gm6899Q3USS0 Ociad1-201ENSMUST00000031038 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Gm6899Q3USS0 Abl2-201ENSMUST00000027888 3549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
Gm6899Q3USS0 Pgm5-201ENSMUST00000047666 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
Gm6899Q3USS0 Kcnh2-201ENSMUST00000036092 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
Gm6899Q3USS0 Zfp385b-203ENSMUST00000111830 2642 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
Gm6899Q3USS0 Chp1-201ENSMUST00000014221 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.8 ms