Protein–RNA interactions for Protein: Q3U3Q1

Ulk3, Serine/threonine-protein kinase ULK3, mousemouse

Predictions only

Length 472 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ulk3Q3U3Q1 Tmem262-201ENSMUST00000143303 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ulk3Q3U3Q1 Tsen15-205ENSMUST00000162371 431 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ulk3Q3U3Q1 Gm9824-201ENSMUST00000178707 561 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Ulk3Q3U3Q1 Gm27397-201ENSMUST00000184997 107 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Ulk3Q3U3Q1 Gm44608-201ENSMUST00000206827 855 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Ulk3Q3U3Q1 Il31-201ENSMUST00000031389 806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ulk3Q3U3Q1 Intu-202ENSMUST00000091186 6387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ulk3Q3U3Q1 Tmem176b-203ENSMUST00000166247 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ulk3Q3U3Q1 Clstn2-202ENSMUST00000162295 4174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ulk3Q3U3Q1 Hapln4-201ENSMUST00000007738 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ulk3Q3U3Q1 2010300F17Rik-202ENSMUST00000181758 2493 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ulk3Q3U3Q1 Ptpn1-201ENSMUST00000029053 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ulk3Q3U3Q1 Slitrk5-201ENSMUST00000042767 4831 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ulk3Q3U3Q1 9930014A18Rik-201ENSMUST00000180730 3074 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ulk3Q3U3Q1 Tdg-208ENSMUST00000151390 3502 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ulk3Q3U3Q1 Sh3bgr-201ENSMUST00000048770 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ulk3Q3U3Q1 Sergef-201ENSMUST00000033127 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ulk3Q3U3Q1 Ywhag-205ENSMUST00000198270 1610 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ulk3Q3U3Q1 Sfn-201ENSMUST00000057311 1613 ntAPPRIS P1 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ulk3Q3U3Q1 Jakmip1-201ENSMUST00000043794 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ulk3Q3U3Q1 Ifnlr1-201ENSMUST00000074408 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ulk3Q3U3Q1 Madd-212ENSMUST00000111375 5706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ulk3Q3U3Q1 Rassf5-201ENSMUST00000027688 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ulk3Q3U3Q1 Pax6-201ENSMUST00000090391 2869 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ulk3Q3U3Q1 A3galt2-202ENSMUST00000106077 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ulk3Q3U3Q1 Gm29530-201ENSMUST00000187556 1956 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ulk3Q3U3Q1 Rrp1-201ENSMUST00000062678 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ulk3Q3U3Q1 Plch2-208ENSMUST00000145662 1818 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ulk3Q3U3Q1 Lpcat1-201ENSMUST00000022099 3675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ulk3Q3U3Q1 Mmp14-206ENSMUST00000225641 3238 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Ulk3Q3U3Q1 Pfkl-201ENSMUST00000020522 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ulk3Q3U3Q1 Iah1-204ENSMUST00000223345 1890 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ulk3Q3U3Q1 Phgdh-201ENSMUST00000065793 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ulk3Q3U3Q1 Pitpnm3-201ENSMUST00000075258 6555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ulk3Q3U3Q1 Sorl1-201ENSMUST00000060989 10715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ulk3Q3U3Q1 Gm13613-201ENSMUST00000126240 1444 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ulk3Q3U3Q1 Twf1-201ENSMUST00000023087 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ulk3Q3U3Q1 Rph3al-203ENSMUST00000108420 695 ntTSL 3 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ulk3Q3U3Q1 Gm6222-201ENSMUST00000120787 396 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Ulk3Q3U3Q1 Gm24513-201ENSMUST00000174964 138 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Ulk3Q3U3Q1 AA619741-201ENSMUST00000195095 646 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Ulk3Q3U3Q1 Gm43125-201ENSMUST00000201724 730 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Ulk3Q3U3Q1 Cdipt-205ENSMUST00000206450 951 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ulk3Q3U3Q1 AC121598.1-201ENSMUST00000228224 1019 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Ulk3Q3U3Q1 Tlcd2-201ENSMUST00000043598 1153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ulk3Q3U3Q1 H2bfm-201ENSMUST00000059808 1052 ntAPPRIS P1 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ulk3Q3U3Q1 Pappa-201ENSMUST00000084501 11027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ulk3Q3U3Q1 Speg-205ENSMUST00000113590 3393 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ulk3Q3U3Q1 Egfem1-201ENSMUST00000118531 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ulk3Q3U3Q1 Slc34a1-201ENSMUST00000057167 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ulk3Q3U3Q1 Eme2-201ENSMUST00000119848 5226 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ulk3Q3U3Q1 Fn1-213ENSMUST00000188674 7680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ulk3Q3U3Q1 Fn1-217ENSMUST00000190780 7694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ulk3Q3U3Q1 Ntf3-201ENSMUST00000050484 1483 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ulk3Q3U3Q1 Gm42872-201ENSMUST00000200026 1967 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Ulk3Q3U3Q1 Ppp4r3b-201ENSMUST00000020755 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ulk3Q3U3Q1 Usp19-203ENSMUST00000166103 4473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ulk3Q3U3Q1 Prrt3-203ENSMUST00000204268 3741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ulk3Q3U3Q1 Afdn-216ENSMUST00000170827 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.27
Ulk3Q3U3Q1 Trim52-201ENSMUST00000022708 3075 ntAPPRIS P1 BASIC13.33□□□□□ -0.27
Ulk3Q3U3Q1 Fut9-202ENSMUST00000108199 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
Ulk3Q3U3Q1 2610028D06Rik-201ENSMUST00000215216 1713 ntBASIC13.33□□□□□ -0.27
Ulk3Q3U3Q1 Dmkn-205ENSMUST00000165887 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
Ulk3Q3U3Q1 Itga3-203ENSMUST00000120375 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
Ulk3Q3U3Q1 Sphk2-201ENSMUST00000072836 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Ulk3Q3U3Q1 Atp8a1-202ENSMUST00000072971 7154 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Ulk3Q3U3Q1 Runx1t1-204ENSMUST00000105566 6090 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Ulk3Q3U3Q1 AC126549.2-201ENSMUST00000223997 1976 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Ulk3Q3U3Q1 P4hb-201ENSMUST00000026122 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Ulk3Q3U3Q1 Pdlim3-201ENSMUST00000034053 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Ulk3Q3U3Q1 Bmp3-202ENSMUST00000197143 2739 ntTSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Ulk3Q3U3Q1 Arfip2-206ENSMUST00000131446 3275 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Ulk3Q3U3Q1 Hist1h4d-201ENSMUST00000102968 1138 ntAPPRIS P1 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Ulk3Q3U3Q1 Gm15440-201ENSMUST00000110042 1231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Ulk3Q3U3Q1 Abhd11-202ENSMUST00000111216 972 ntTSL 3 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Ulk3Q3U3Q1 Gm13015-201ENSMUST00000118674 204 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Ulk3Q3U3Q1 AC155937.1-202ENSMUST00000156229 621 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Ulk3Q3U3Q1 Gm20481-201ENSMUST00000173680 564 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Ulk3Q3U3Q1 Gm2213-201ENSMUST00000197485 688 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Ulk3Q3U3Q1 Ftl1-ps1-202ENSMUST00000222435 938 ntAPPRIS P1 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Ulk3Q3U3Q1 Gnmt-201ENSMUST00000002846 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Ulk3Q3U3Q1 Chchd10-201ENSMUST00000058906 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Ulk3Q3U3Q1 Wasl-201ENSMUST00000031695 4352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Ulk3Q3U3Q1 Gm6198-201ENSMUST00000191337 2929 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Ulk3Q3U3Q1 Psrc1-202ENSMUST00000102629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Ulk3Q3U3Q1 Tssk4-202ENSMUST00000164809 1686 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Ulk3Q3U3Q1 Ncdn-202ENSMUST00000106116 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Ulk3Q3U3Q1 Arhgef1-202ENSMUST00000098683 3375 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Ulk3Q3U3Q1 Txnrd3-201ENSMUST00000000828 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Ulk3Q3U3Q1 Sgms1-212ENSMUST00000151289 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Ulk3Q3U3Q1 Fam192a-201ENSMUST00000034226 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Ulk3Q3U3Q1 AC115735.4-201ENSMUST00000227460 1944 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Ulk3Q3U3Q1 Pcdhac1-201ENSMUST00000007584 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Ulk3Q3U3Q1 Pik3cd-201ENSMUST00000038859 4905 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Ulk3Q3U3Q1 Gcat-201ENSMUST00000006544 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Ulk3Q3U3Q1 Tfap2c-206ENSMUST00000170744 2776 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Ulk3Q3U3Q1 Fgfr1-203ENSMUST00000119398 3789 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Ulk3Q3U3Q1 Brwd1-201ENSMUST00000023631 8209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Ulk3Q3U3Q1 Trappc2-203ENSMUST00000116495 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Ulk3Q3U3Q1 Spidr-201ENSMUST00000040248 3279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.3 ms