Protein–RNA interactions for Protein: Q3U2K5

Kdm4d, Lysine-specific demethylase 4D, mousemouse

Predictions only

Length 510 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kdm4dQ3U2K5 Spon2-201ENSMUST00000046186 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Kdm4dQ3U2K5 Cnksr2-202ENSMUST00000112513 4471 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Kdm4dQ3U2K5 Cchcr1-202ENSMUST00000164242 2656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
Kdm4dQ3U2K5 Mapk9-210ENSMUST00000178543 4677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.31
Kdm4dQ3U2K5 Cpeb3-212ENSMUST00000154376 5671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
Kdm4dQ3U2K5 Dhrs3-207ENSMUST00000171001 1349 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Kdm4dQ3U2K5 Hp-201ENSMUST00000074898 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Kdm4dQ3U2K5 Gins3-201ENSMUST00000034094 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Kdm4dQ3U2K5 Galnt2-201ENSMUST00000034458 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Kdm4dQ3U2K5 Ywhag-205ENSMUST00000198270 1610 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Kdm4dQ3U2K5 Trf-201ENSMUST00000035158 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Kdm4dQ3U2K5 Slc8a3-203ENSMUST00000182208 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Kdm4dQ3U2K5 Rsbn1-202ENSMUST00000068879 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Kdm4dQ3U2K5 Tmtc3-202ENSMUST00000099318 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Kdm4dQ3U2K5 Cpne6-202ENSMUST00000163767 2004 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Kdm4dQ3U2K5 Mast3-201ENSMUST00000166004 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Kdm4dQ3U2K5 Tmem53-202ENSMUST00000106433 913 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Kdm4dQ3U2K5 Ift20-203ENSMUST00000128788 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Kdm4dQ3U2K5 Gm45711-202ENSMUST00000164175 979 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Kdm4dQ3U2K5 Ly6g6e-203ENSMUST00000172678 750 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Kdm4dQ3U2K5 Mir7085-201ENSMUST00000184353 66 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Kdm4dQ3U2K5 2810429I04Rik-210ENSMUST00000189464 868 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Kdm4dQ3U2K5 Gm37667-201ENSMUST00000193103 752 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Kdm4dQ3U2K5 Ncs1-201ENSMUST00000000199 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Kdm4dQ3U2K5 Ccdc159-204ENSMUST00000216710 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Kdm4dQ3U2K5 Pomc-202ENSMUST00000218089 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Kdm4dQ3U2K5 Duoxa1-201ENSMUST00000028653 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Kdm4dQ3U2K5 Elane-201ENSMUST00000046091 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Kdm4dQ3U2K5 A730061H03Rik-201ENSMUST00000066106 465 ntAPPRIS P1 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Kdm4dQ3U2K5 Gm11946-201ENSMUST00000123459 3941 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Kdm4dQ3U2K5 Plcb3-201ENSMUST00000025912 4201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Kdm4dQ3U2K5 4632428C04Rik-201ENSMUST00000181485 2430 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Kdm4dQ3U2K5 Kif1c-203ENSMUST00000102554 6684 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Kdm4dQ3U2K5 Muc20-201ENSMUST00000041123 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Kdm4dQ3U2K5 Pias3-203ENSMUST00000107077 2695 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Kdm4dQ3U2K5 Clec4g-201ENSMUST00000058040 1441 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Kdm4dQ3U2K5 Tead1-201ENSMUST00000059768 9964 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Kdm4dQ3U2K5 Alkbh4-202ENSMUST00000100568 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Kdm4dQ3U2K5 Mypn-202ENSMUST00000218978 1833 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Kdm4dQ3U2K5 Atat1-201ENSMUST00000056034 1930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Kdm4dQ3U2K5 Cd3eap-201ENSMUST00000047036 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Kdm4dQ3U2K5 Camsap1-202ENSMUST00000114167 7981 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Kdm4dQ3U2K5 Prkcb-202ENSMUST00000064989 2911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Kdm4dQ3U2K5 Cpeb3-208ENSMUST00000132580 3148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Kdm4dQ3U2K5 Camk2b-209ENSMUST00000109813 4023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Kdm4dQ3U2K5 Camk2b-204ENSMUST00000090443 4004 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Kdm4dQ3U2K5 Hykk-201ENSMUST00000039742 5110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Kdm4dQ3U2K5 Ulk1-211ENSMUST00000200299 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Kdm4dQ3U2K5 Lats2-210ENSMUST00000174694 3287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Kdm4dQ3U2K5 Tacc3-201ENSMUST00000074849 2669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Kdm4dQ3U2K5 Etnk2-201ENSMUST00000129213 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Kdm4dQ3U2K5 Gm26565-201ENSMUST00000181642 1968 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Kdm4dQ3U2K5 Fggy-202ENSMUST00000079223 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Kdm4dQ3U2K5 Trim15-203ENSMUST00000174195 1778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Kdm4dQ3U2K5 AI480526-202ENSMUST00000159637 1697 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Kdm4dQ3U2K5 Knop1-203ENSMUST00000106549 1467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Kdm4dQ3U2K5 Gh-201ENSMUST00000103071 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Kdm4dQ3U2K5 Gm13689-201ENSMUST00000119360 685 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Kdm4dQ3U2K5 Ankzf1-201ENSMUST00000127625 1167 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
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Kdm4dQ3U2K5 Otx2os1-202ENSMUST00000183803 743 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Kdm4dQ3U2K5 Hsph1-211ENSMUST00000202361 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
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Kdm4dQ3U2K5 Cradd-202ENSMUST00000217809 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Kdm4dQ3U2K5 CT030161.3-201ENSMUST00000218235 367 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
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Kdm4dQ3U2K5 Dctn6-201ENSMUST00000033913 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Kdm4dQ3U2K5 Nanos3-201ENSMUST00000070102 730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Kdm4dQ3U2K5 Mmp14-206ENSMUST00000225641 3238 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Kdm4dQ3U2K5 Kdm7a-201ENSMUST00000002305 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Kdm4dQ3U2K5 Cxcr5-201ENSMUST00000062215 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Kdm4dQ3U2K5 Atp2a3-207ENSMUST00000163326 4606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Kdm4dQ3U2K5 Nfyc-201ENSMUST00000043429 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Kdm4dQ3U2K5 Egln3-201ENSMUST00000039516 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Kdm4dQ3U2K5 Gm37015-201ENSMUST00000192763 1521 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Kdm4dQ3U2K5 Gna13-201ENSMUST00000020930 6160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Kdm4dQ3U2K5 Tm9sf1-201ENSMUST00000002391 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Kdm4dQ3U2K5 Scube1-201ENSMUST00000016907 3991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Kdm4dQ3U2K5 Mfsd1-201ENSMUST00000029344 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Kdm4dQ3U2K5 Arl11-202ENSMUST00000224727 2095 ntAPPRIS P1 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Kdm4dQ3U2K5 Mpl-201ENSMUST00000006556 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Kdm4dQ3U2K5 Ctps-201ENSMUST00000030381 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Kdm4dQ3U2K5 Ankrd34b-203ENSMUST00000168871 3397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Kdm4dQ3U2K5 Nfe2-207ENSMUST00000134554 1761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Kdm4dQ3U2K5 Sgce-205ENSMUST00000115579 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Kdm4dQ3U2K5 St8sia6-201ENSMUST00000003509 7618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Kdm4dQ3U2K5 Slc13a3-201ENSMUST00000029208 3524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Kdm4dQ3U2K5 Foxi2-201ENSMUST00000060356 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Kdm4dQ3U2K5 Ppp1r18-206ENSMUST00000190496 1395 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Kdm4dQ3U2K5 Gm38102-201ENSMUST00000192791 1935 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Kdm4dQ3U2K5 Gm21038-201ENSMUST00000222205 1383 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Kdm4dQ3U2K5 Gm16122-201ENSMUST00000142625 1158 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Kdm4dQ3U2K5 Gm12840-201ENSMUST00000156081 627 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Kdm4dQ3U2K5 Gm17232-201ENSMUST00000164515 453 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Kdm4dQ3U2K5 Srgn-201ENSMUST00000020271 938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Kdm4dQ3U2K5 Gm7067-201ENSMUST00000207698 1249 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.4 ms