Protein–RNA interactions for Protein: Q3TRM4

Pnpla6, Neuropathy target esterase, mousemouse

Predictions only

Length 1,355 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pnpla6Q3TRM4 Fau-201ENSMUST00000043074 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pnpla6Q3TRM4 Rps21-201ENSMUST00000059080 394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pnpla6Q3TRM4 Zfp451-201ENSMUST00000019861 3958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pnpla6Q3TRM4 Osm-201ENSMUST00000075221 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pnpla6Q3TRM4 Oxr1-206ENSMUST00000170127 4251 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pnpla6Q3TRM4 Amhr2-201ENSMUST00000023809 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pnpla6Q3TRM4 Adamts14-201ENSMUST00000092486 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pnpla6Q3TRM4 Tmx4-201ENSMUST00000038228 5488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pnpla6Q3TRM4 Gm17705-201ENSMUST00000172285 1555 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pnpla6Q3TRM4 Saraf-201ENSMUST00000033933 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Pnpla6Q3TRM4 Egr1-201ENSMUST00000064795 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Pnpla6Q3TRM4 Gm28182-201ENSMUST00000188354 2477 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Pnpla6Q3TRM4 Ccdc185-201ENSMUST00000060041 2055 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Pnpla6Q3TRM4 Gm11261-203ENSMUST00000132470 838 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Pnpla6Q3TRM4 Gm38230-201ENSMUST00000193572 1159 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Pnpla6Q3TRM4 Gm867-202ENSMUST00000219979 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Pnpla6Q3TRM4 Fkbp7-201ENSMUST00000002809 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Pnpla6Q3TRM4 Ccl24-201ENSMUST00000004936 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Pnpla6Q3TRM4 Tmem107-201ENSMUST00000075980 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Pnpla6Q3TRM4 D6Ertd527e-204ENSMUST00000204927 2218 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Pnpla6Q3TRM4 Rtf1-201ENSMUST00000028767 4664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Pnpla6Q3TRM4 Vill-203ENSMUST00000126251 1411 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Pnpla6Q3TRM4 Prss47-204ENSMUST00000222769 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Pnpla6Q3TRM4 Pja1-205ENSMUST00000167246 2666 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Pnpla6Q3TRM4 Cdsn-201ENSMUST00000044804 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Pnpla6Q3TRM4 Dnmt3b-210ENSMUST00000109774 4320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Pnpla6Q3TRM4 9030612E09Rik-201ENSMUST00000053792 1859 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Pnpla6Q3TRM4 Synj2-210ENSMUST00000115791 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Pnpla6Q3TRM4 Prg4-207ENSMUST00000162367 1480 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Pnpla6Q3TRM4 Unc5d-204ENSMUST00000210785 3404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Pnpla6Q3TRM4 Sf1-204ENSMUST00000113489 2863 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Pnpla6Q3TRM4 Pfkfb3-203ENSMUST00000100411 2008 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Pnpla6Q3TRM4 Cpsf4l-203ENSMUST00000106617 1123 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Pnpla6Q3TRM4 Timm10b-202ENSMUST00000106780 671 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Pnpla6Q3TRM4 Nmi-202ENSMUST00000112705 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Pnpla6Q3TRM4 Gm14660-201ENSMUST00000119809 575 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Pnpla6Q3TRM4 Gm11400-201ENSMUST00000120853 1214 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Pnpla6Q3TRM4 Trim26-202ENSMUST00000123715 1406 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Pnpla6Q3TRM4 AW209491-202ENSMUST00000178289 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Pnpla6Q3TRM4 Gm9124-201ENSMUST00000191789 1092 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Pnpla6Q3TRM4 Gm9113-201ENSMUST00000192510 1018 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Pnpla6Q3TRM4 Gm9131-201ENSMUST00000193557 1089 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Pnpla6Q3TRM4 Gm9121-201ENSMUST00000193749 1071 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Pnpla6Q3TRM4 Il31-203ENSMUST00000198901 984 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Pnpla6Q3TRM4 1700123K08Rik-201ENSMUST00000031501 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Pnpla6Q3TRM4 Leng9-201ENSMUST00000058358 2460 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Pnpla6Q3TRM4 Xlr-202ENSMUST00000067782 1860 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Pnpla6Q3TRM4 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Pnpla6Q3TRM4 Col8a2-201ENSMUST00000070132 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Pnpla6Q3TRM4 Ano7-201ENSMUST00000058682 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Pnpla6Q3TRM4 Tmem8b-203ENSMUST00000107866 4998 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Pnpla6Q3TRM4 Fam57b-203ENSMUST00000205324 1915 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Pnpla6Q3TRM4 Slc24a3-202ENSMUST00000110007 4048 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Pnpla6Q3TRM4 Cyth2-208ENSMUST00000211783 1983 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Pnpla6Q3TRM4 Golim4-208ENSMUST00000167078 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Pnpla6Q3TRM4 Gm16793-201ENSMUST00000181322 1680 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Pnpla6Q3TRM4 1300002E11Rik-202ENSMUST00000181780 1650 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Pnpla6Q3TRM4 Usp27x-203ENSMUST00000191497 4273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Pnpla6Q3TRM4 N6amt1-203ENSMUST00000118310 1700 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Pnpla6Q3TRM4 Rdx-201ENSMUST00000000590 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Pnpla6Q3TRM4 Las1l-202ENSMUST00000113864 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Pnpla6Q3TRM4 Irf2bpl-201ENSMUST00000038422 4098 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Pnpla6Q3TRM4 Entpd2-201ENSMUST00000028328 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Pnpla6Q3TRM4 Ap5m1-205ENSMUST00000227431 3757 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Pnpla6Q3TRM4 Itgb4-201ENSMUST00000021107 6014 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Pnpla6Q3TRM4 Cntf-201ENSMUST00000112933 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Pnpla6Q3TRM4 Lsm2-202ENSMUST00000114011 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Pnpla6Q3TRM4 Mir1982-201ENSMUST00000157368 74 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Pnpla6Q3TRM4 Neurl3-202ENSMUST00000188666 1206 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Pnpla6Q3TRM4 Myl10-202ENSMUST00000196068 911 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Pnpla6Q3TRM4 Myl10-203ENSMUST00000196436 598 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Pnpla6Q3TRM4 Myl10-204ENSMUST00000197186 607 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Pnpla6Q3TRM4 Chd3os-203ENSMUST00000218008 1026 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Pnpla6Q3TRM4 AC122459.1-201ENSMUST00000228373 885 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Pnpla6Q3TRM4 Asb16-201ENSMUST00000036467 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Pnpla6Q3TRM4 Atp2b2-201ENSMUST00000089003 7067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Pnpla6Q3TRM4 Pbx3-202ENSMUST00000113132 2734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Pnpla6Q3TRM4 Gm35721-201ENSMUST00000220294 2014 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Pnpla6Q3TRM4 Emd-202ENSMUST00000088313 1338 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Pnpla6Q3TRM4 Bcr-201ENSMUST00000164107 6839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Pnpla6Q3TRM4 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Pnpla6Q3TRM4 B230219D22Rik-201ENSMUST00000057844 4652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Pnpla6Q3TRM4 Trip4-201ENSMUST00000117083 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Pnpla6Q3TRM4 Gm8108-202ENSMUST00000170207 1961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Pnpla6Q3TRM4 Lime1-201ENSMUST00000048077 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Pnpla6Q3TRM4 Ssfa2-202ENSMUST00000111785 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Pnpla6Q3TRM4 Ano8-201ENSMUST00000093450 3653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Pnpla6Q3TRM4 Cacna1b-201ENSMUST00000041342 6984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Pnpla6Q3TRM4 Lrp2bp-202ENSMUST00000110380 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Pnpla6Q3TRM4 Tmem19-203ENSMUST00000217884 2799 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Pnpla6Q3TRM4 Ebf3-208ENSMUST00000210774 2994 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Pnpla6Q3TRM4 Gckr-201ENSMUST00000072228 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Pnpla6Q3TRM4 Midn-202ENSMUST00000099492 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Pnpla6Q3TRM4 Ralbp1-201ENSMUST00000024905 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Pnpla6Q3TRM4 Tial1-203ENSMUST00000106228 2835 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Pnpla6Q3TRM4 Tomm5-204ENSMUST00000107810 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Pnpla6Q3TRM4 Rasgrp2-207ENSMUST00000113475 573 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Pnpla6Q3TRM4 Hypk-204ENSMUST00000126764 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Pnpla6Q3TRM4 Pcgf1-202ENSMUST00000165164 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Pnpla6Q3TRM4 Ccdc70-201ENSMUST00000017193 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.4 ms