Protein–RNA interactions for Protein: Q3TA59

Jmjd8, JmjC domain-containing protein 8, mousemouse

Predictions only

Length 316 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Jmjd8Q3TA59 Gm5089-201ENSMUST00000081580 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Jmjd8Q3TA59 Nutf2-201ENSMUST00000008594 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Jmjd8Q3TA59 Sh2b3-202ENSMUST00000086310 4195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Jmjd8Q3TA59 Vdac3-201ENSMUST00000009036 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Jmjd8Q3TA59 Gpr157-201ENSMUST00000094451 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Jmjd8Q3TA59 Mcpt9-201ENSMUST00000095798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Jmjd8Q3TA59 Foxs1-201ENSMUST00000099200 1311 ntAPPRIS P1 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Jmjd8Q3TA59 Ptbp2-201ENSMUST00000029780 3364 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Jmjd8Q3TA59 B230206H07Rik-202ENSMUST00000134845 3269 ntTSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Jmjd8Q3TA59 Slco4a1-202ENSMUST00000038259 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Jmjd8Q3TA59 Gm20633-201ENSMUST00000176742 2831 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
Jmjd8Q3TA59 Ccdc22-201ENSMUST00000033483 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Jmjd8Q3TA59 AC116503.1-201ENSMUST00000215445 2192 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Jmjd8Q3TA59 Gm37105-201ENSMUST00000192251 2085 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Jmjd8Q3TA59 Lmntd2-201ENSMUST00000026573 2095 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Jmjd8Q3TA59 Tspyl5-201ENSMUST00000042021 4010 ntAPPRIS P1 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Jmjd8Q3TA59 Nup62cl-201ENSMUST00000101212 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Jmjd8Q3TA59 Tmem237-201ENSMUST00000087475 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Jmjd8Q3TA59 Alkbh4-202ENSMUST00000100568 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Jmjd8Q3TA59 Spo11-201ENSMUST00000050442 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Jmjd8Q3TA59 Kcnj3-203ENSMUST00000112633 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Jmjd8Q3TA59 Blzf1-202ENSMUST00000086032 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Jmjd8Q3TA59 Slc25a47-201ENSMUST00000057026 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Jmjd8Q3TA59 Zfp296-201ENSMUST00000108453 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Jmjd8Q3TA59 Olah-201ENSMUST00000027955 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Jmjd8Q3TA59 Hgs-202ENSMUST00000106203 2901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Jmjd8Q3TA59 4931414P19Rik-201ENSMUST00000022786 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Jmjd8Q3TA59 Coq10a-205ENSMUST00000220027 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Jmjd8Q3TA59 Col4a1-201ENSMUST00000033898 6615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Jmjd8Q3TA59 Trem2-202ENSMUST00000113237 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Jmjd8Q3TA59 1700045H11Rik-201ENSMUST00000128056 593 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Jmjd8Q3TA59 Cmc2-202ENSMUST00000128304 394 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Jmjd8Q3TA59 Nnat-209ENSMUST00000173793 386 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Jmjd8Q3TA59 Prr29-205ENSMUST00000190268 1141 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Jmjd8Q3TA59 Gm43474-201ENSMUST00000196415 774 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Jmjd8Q3TA59 Gm43125-201ENSMUST00000201724 730 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Jmjd8Q3TA59 Gm29683-202ENSMUST00000208511 720 ntTSL 3 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Jmjd8Q3TA59 Gm5628-201ENSMUST00000222318 1049 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Jmjd8Q3TA59 AC140397.2-201ENSMUST00000224213 834 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Jmjd8Q3TA59 Trem2-201ENSMUST00000024791 1088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Jmjd8Q3TA59 Pecr-201ENSMUST00000027381 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Jmjd8Q3TA59 Gpr146-202ENSMUST00000053120 1040 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Jmjd8Q3TA59 D930028M14Rik-201ENSMUST00000098678 1003 ntTSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Jmjd8Q3TA59 Lmbr1l-202ENSMUST00000109127 2548 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Jmjd8Q3TA59 Dnajc27-201ENSMUST00000020986 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Jmjd8Q3TA59 Gm20700-201ENSMUST00000176749 2206 ntTSL 3 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Jmjd8Q3TA59 Gm14342-201ENSMUST00000137629 2119 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Jmjd8Q3TA59 Pigq-201ENSMUST00000026823 3173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Jmjd8Q3TA59 Wnt7a-201ENSMUST00000032180 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Jmjd8Q3TA59 Prkce-201ENSMUST00000097274 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Jmjd8Q3TA59 Mpp3-204ENSMUST00000107168 3094 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Jmjd8Q3TA59 Arhgef2-208ENSMUST00000175911 2030 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Jmjd8Q3TA59 D630014O11Rik-201ENSMUST00000160562 3019 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Jmjd8Q3TA59 Arid4b-203ENSMUST00000110534 5864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Jmjd8Q3TA59 Ttyh1-202ENSMUST00000079415 2882 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Jmjd8Q3TA59 Prss44-201ENSMUST00000098345 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Jmjd8Q3TA59 Slc19a2-201ENSMUST00000044021 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Jmjd8Q3TA59 Drc1-201ENSMUST00000101448 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Jmjd8Q3TA59 Tmed8-201ENSMUST00000037418 7409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Jmjd8Q3TA59 Fbxo41-201ENSMUST00000159062 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Jmjd8Q3TA59 Nmral1-204ENSMUST00000120056 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Jmjd8Q3TA59 Klhl30-201ENSMUST00000027533 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Jmjd8Q3TA59 Mterf4-202ENSMUST00000112942 1525 ntTSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Jmjd8Q3TA59 1700010B13Rik-202ENSMUST00000189435 1549 ntTSL 3 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Jmjd8Q3TA59 Ap5z1-202ENSMUST00000196055 2965 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Jmjd8Q3TA59 Tspan5-202ENSMUST00000119993 2107 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Jmjd8Q3TA59 Rab3a-202ENSMUST00000110090 1375 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Jmjd8Q3TA59 Hipk3-202ENSMUST00000111124 4125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Jmjd8Q3TA59 Sbk1-201ENSMUST00000056028 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Jmjd8Q3TA59 Gm5069-201ENSMUST00000050581 1328 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Jmjd8Q3TA59 Ralgapb-201ENSMUST00000046274 8366 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Jmjd8Q3TA59 Park7-204ENSMUST00000105675 882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Jmjd8Q3TA59 Hoxa13-202ENSMUST00000114416 769 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Jmjd8Q3TA59 Eef1akmt4-201ENSMUST00000115522 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Jmjd8Q3TA59 Gm25948-201ENSMUST00000175334 112 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
Jmjd8Q3TA59 Rpl28-201ENSMUST00000032597 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Jmjd8Q3TA59 Sall2-202ENSMUST00000135523 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Jmjd8Q3TA59 Itga6-202ENSMUST00000112101 4156 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Jmjd8Q3TA59 Gstcd-202ENSMUST00000080583 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Jmjd8Q3TA59 Tcf21-202ENSMUST00000218002 1788 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
Jmjd8Q3TA59 Npepps-219ENSMUST00000172108 2924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Jmjd8Q3TA59 Col3a1-201ENSMUST00000087883 5564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Jmjd8Q3TA59 Idh3b-201ENSMUST00000028892 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Jmjd8Q3TA59 BC030867-201ENSMUST00000100392 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Jmjd8Q3TA59 AC154725.1-201ENSMUST00000224826 1961 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
Jmjd8Q3TA59 Sike1-201ENSMUST00000029447 7375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Jmjd8Q3TA59 Amdhd2-201ENSMUST00000040735 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Jmjd8Q3TA59 Tmc6-201ENSMUST00000026659 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Jmjd8Q3TA59 Oprm1-215ENSMUST00000105607 2369 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Jmjd8Q3TA59 Klrg1-201ENSMUST00000032207 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Jmjd8Q3TA59 Sema7a-201ENSMUST00000043059 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Jmjd8Q3TA59 Gm20683-201ENSMUST00000176751 2790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Jmjd8Q3TA59 Nr1i3-203ENSMUST00000111328 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Jmjd8Q3TA59 Ercc1-201ENSMUST00000003645 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Jmjd8Q3TA59 Capn5-202ENSMUST00000107112 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Jmjd8Q3TA59 Pcsk5-201ENSMUST00000025618 6675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Jmjd8Q3TA59 Zfyve28-201ENSMUST00000094868 3983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Jmjd8Q3TA59 Pla2g15-204ENSMUST00000212963 2578 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Jmjd8Q3TA59 Dnajc8-206ENSMUST00000105940 772 ntTSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Jmjd8Q3TA59 Il15ra-206ENSMUST00000114834 784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.4 ms