Protein–RNA interactions for Protein: Q2LKU9

Nlrp1a, NACHT, LRR and PYD domains-containing protein 1a, mousemouse

Predictions only

Length 1,182 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nlrp1aQ2LKU9 AC073947.2-201ENSMUST00000215888 1130 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Nlrp1aQ2LKU9 Cct3-ps1-201ENSMUST00000118023 1647 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Nlrp1aQ2LKU9 Fmnl2-205ENSMUST00000155586 3939 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Nlrp1aQ2LKU9 Fubp1-206ENSMUST00000196739 2526 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Nlrp1aQ2LKU9 Cln3-203ENSMUST00000098036 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Nlrp1aQ2LKU9 Fam167a-201ENSMUST00000121288 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Nlrp1aQ2LKU9 Kif21a-201ENSMUST00000067205 6307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Nlrp1aQ2LKU9 Entpd2-201ENSMUST00000028328 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Nlrp1aQ2LKU9 Gm29455-201ENSMUST00000186504 2659 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Nlrp1aQ2LKU9 Gm37912-201ENSMUST00000191895 3076 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Nlrp1aQ2LKU9 Gm43738-201ENSMUST00000200659 2635 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Nlrp1aQ2LKU9 Clcnka-202ENSMUST00000105790 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Nlrp1aQ2LKU9 Rlbp1-201ENSMUST00000053718 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Nlrp1aQ2LKU9 Ell3-202ENSMUST00000116432 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Nlrp1aQ2LKU9 Neil1-203ENSMUST00000190245 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Nlrp1aQ2LKU9 Gckr-201ENSMUST00000072228 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Nlrp1aQ2LKU9 Six4-201ENSMUST00000043208 6402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Nlrp1aQ2LKU9 Ngf-202ENSMUST00000106925 1187 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Nlrp1aQ2LKU9 Mrps10-202ENSMUST00000119841 1113 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Nlrp1aQ2LKU9 Gm16175-201ENSMUST00000128181 248 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Nlrp1aQ2LKU9 Slc2a9-207ENSMUST00000143758 1296 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Nlrp1aQ2LKU9 Pmepa1os-201ENSMUST00000150185 680 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Nlrp1aQ2LKU9 Abhd14a-202ENSMUST00000171678 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Nlrp1aQ2LKU9 Srgn-201ENSMUST00000020271 938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Nlrp1aQ2LKU9 Pemt-201ENSMUST00000000310 953 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Nlrp1aQ2LKU9 Olfr373-201ENSMUST00000074540 945 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Nlrp1aQ2LKU9 Nck1-202ENSMUST00000116522 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Nlrp1aQ2LKU9 Cdhr5-202ENSMUST00000167263 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Nlrp1aQ2LKU9 Slc41a1-201ENSMUST00000086559 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Nlrp1aQ2LKU9 Commd7-201ENSMUST00000071852 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Nlrp1aQ2LKU9 Arhgef25-202ENSMUST00000167353 2189 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Nlrp1aQ2LKU9 AL645783.1-201ENSMUST00000221416 1832 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Nlrp1aQ2LKU9 Mesd-201ENSMUST00000094215 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Nlrp1aQ2LKU9 Paqr8-202ENSMUST00000167119 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Nlrp1aQ2LKU9 Efs-201ENSMUST00000022813 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Nlrp1aQ2LKU9 Mdfic-203ENSMUST00000125326 3635 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Nlrp1aQ2LKU9 Peli3-202ENSMUST00000120475 2988 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Nlrp1aQ2LKU9 Gm33195-201ENSMUST00000220827 2337 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Nlrp1aQ2LKU9 Rnf34-201ENSMUST00000031434 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Nlrp1aQ2LKU9 Epb41l1-204ENSMUST00000103137 6490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Nlrp1aQ2LKU9 Trim80-201ENSMUST00000093914 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Nlrp1aQ2LKU9 Gm8775-201ENSMUST00000170943 1327 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Nlrp1aQ2LKU9 Selenoh-202ENSMUST00000102647 654 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Nlrp1aQ2LKU9 Far2os1-201ENSMUST00000162391 555 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Nlrp1aQ2LKU9 Gm6244-201ENSMUST00000178732 841 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Nlrp1aQ2LKU9 Gm27892-201ENSMUST00000185017 106 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Nlrp1aQ2LKU9 Gm43691-201ENSMUST00000196625 697 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Nlrp1aQ2LKU9 Mpv17-207ENSMUST00000201491 923 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Nlrp1aQ2LKU9 Gm7287-201ENSMUST00000205267 602 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Nlrp1aQ2LKU9 4930438A08Rik-202ENSMUST00000208022 918 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Nlrp1aQ2LKU9 Gm5035-201ENSMUST00000215581 927 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Nlrp1aQ2LKU9 AC110817.1-201ENSMUST00000225706 605 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Nlrp1aQ2LKU9 Ano7-201ENSMUST00000058682 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Nlrp1aQ2LKU9 Ppp1r14d-201ENSMUST00000076084 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Nlrp1aQ2LKU9 Emilin3-201ENSMUST00000057169 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Nlrp1aQ2LKU9 Prrg4-201ENSMUST00000028593 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Nlrp1aQ2LKU9 Galnt13-203ENSMUST00000112635 7531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Nlrp1aQ2LKU9 Dsel-201ENSMUST00000035462 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Nlrp1aQ2LKU9 Cdc42ep1-201ENSMUST00000059619 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Nlrp1aQ2LKU9 Krt35-201ENSMUST00000103127 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Nlrp1aQ2LKU9 Ncf1-201ENSMUST00000016094 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Nlrp1aQ2LKU9 Ap4b1-201ENSMUST00000047285 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Nlrp1aQ2LKU9 Trim10-201ENSMUST00000060524 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Nlrp1aQ2LKU9 Mms22l-201ENSMUST00000050446 4261 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Nlrp1aQ2LKU9 Arhgef1-203ENSMUST00000117419 3214 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Nlrp1aQ2LKU9 Riox2-201ENSMUST00000023407 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Nlrp1aQ2LKU9 Atp5f1-201ENSMUST00000118209 1604 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Nlrp1aQ2LKU9 Kcnc2-201ENSMUST00000092175 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Nlrp1aQ2LKU9 Ilvbl-203ENSMUST00000218215 2331 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Nlrp1aQ2LKU9 Prox1-201ENSMUST00000010319 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Nlrp1aQ2LKU9 Fam187a-201ENSMUST00000100369 1563 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Nlrp1aQ2LKU9 Pitpnm2-209ENSMUST00000161938 5866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Nlrp1aQ2LKU9 Fbxw17-201ENSMUST00000046974 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Nlrp1aQ2LKU9 Proser2-202ENSMUST00000114942 4398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Nlrp1aQ2LKU9 Tmem33-204ENSMUST00000161369 6164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Nlrp1aQ2LKU9 Olfm1-202ENSMUST00000100244 2686 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Nlrp1aQ2LKU9 Slc35c2-202ENSMUST00000109298 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Nlrp1aQ2LKU9 Mir692-1-201ENSMUST00000102263 109 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Nlrp1aQ2LKU9 Dlk1-202ENSMUST00000109841 879 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Nlrp1aQ2LKU9 Mir1894-201ENSMUST00000122802 81 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Nlrp1aQ2LKU9 Ift20-203ENSMUST00000128788 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Nlrp1aQ2LKU9 Klk12-201ENSMUST00000014063 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Nlrp1aQ2LKU9 9330198N18Rik-201ENSMUST00000146702 1247 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Nlrp1aQ2LKU9 Oaz1-203ENSMUST00000179172 744 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Nlrp1aQ2LKU9 Lrcol1-202ENSMUST00000185691 764 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Nlrp1aQ2LKU9 Gm29608-201ENSMUST00000190444 463 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Nlrp1aQ2LKU9 1810059H22Rik-208ENSMUST00000204941 642 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Nlrp1aQ2LKU9 9230020A06Rik-204ENSMUST00000215201 1116 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Nlrp1aQ2LKU9 Gm5186-201ENSMUST00000218781 920 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Nlrp1aQ2LKU9 Gm5519-201ENSMUST00000042061 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Nlrp1aQ2LKU9 Oaz1-ps-201ENSMUST00000052440 681 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Nlrp1aQ2LKU9 Gm5129-201ENSMUST00000065372 300 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Nlrp1aQ2LKU9 Wdr5-201ENSMUST00000113952 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Nlrp1aQ2LKU9 Kdm4b-202ENSMUST00000086835 4360 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Nlrp1aQ2LKU9 Cyp2f2-201ENSMUST00000003100 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Nlrp1aQ2LKU9 Ap5z1-202ENSMUST00000196055 2965 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Nlrp1aQ2LKU9 Mrpl44-201ENSMUST00000027464 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Nlrp1aQ2LKU9 Tmem26-201ENSMUST00000080995 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Nlrp1aQ2LKU9 Rinl-206ENSMUST00000209035 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Nlrp1aQ2LKU9 Arid3a-203ENSMUST00000105377 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.4 ms