Protein–RNA interactions for Protein: Q149C2

Traf3ip1, TRAF3-interacting protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 625 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Traf3ip1Q149C2 Erp29-201ENSMUST00000052590 1123 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Traf3ip1Q149C2 Car5a-201ENSMUST00000057653 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Traf3ip1Q149C2 Ano7-201ENSMUST00000058682 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Traf3ip1Q149C2 Cldn13-201ENSMUST00000008987 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Traf3ip1Q149C2 Olfr1214-201ENSMUST00000099804 936 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Traf3ip1Q149C2 Asb16-201ENSMUST00000036467 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Traf3ip1Q149C2 Nr2f1-205ENSMUST00000150498 2588 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Traf3ip1Q149C2 Gm13055-201ENSMUST00000127875 1961 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Traf3ip1Q149C2 F2-201ENSMUST00000028681 1988 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Traf3ip1Q149C2 Palld-203ENSMUST00000121493 5445 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Traf3ip1Q149C2 Gm29358-201ENSMUST00000186510 1734 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Traf3ip1Q149C2 Zfp566-201ENSMUST00000088785 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Traf3ip1Q149C2 Atp13a2-201ENSMUST00000037055 3956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Traf3ip1Q149C2 Dimt1-201ENSMUST00000022203 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Traf3ip1Q149C2 Slc46a3-201ENSMUST00000031655 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Traf3ip1Q149C2 Riox2-201ENSMUST00000023407 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Traf3ip1Q149C2 Msantd3-201ENSMUST00000061135 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Traf3ip1Q149C2 Cfap45-201ENSMUST00000085894 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Traf3ip1Q149C2 Gm37912-201ENSMUST00000191895 3076 ntBASIC15.96■□□□□ 0.14
Traf3ip1Q149C2 Erc1-207ENSMUST00000183911 3865 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Traf3ip1Q149C2 Rufy3-203ENSMUST00000196894 3703 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Traf3ip1Q149C2 Cdsn-201ENSMUST00000044804 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Traf3ip1Q149C2 Rnf168-201ENSMUST00000014218 3932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Traf3ip1Q149C2 Syngap1-202ENSMUST00000177932 3927 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Traf3ip1Q149C2 Ccdc106-201ENSMUST00000045543 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Traf3ip1Q149C2 Nphp4-202ENSMUST00000081393 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Traf3ip1Q149C2 Sphk2-201ENSMUST00000072836 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Traf3ip1Q149C2 Keap1-202ENSMUST00000164812 3614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Traf3ip1Q149C2 Degs2-202ENSMUST00000167978 1729 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Traf3ip1Q149C2 1700022A21Rik-201ENSMUST00000182745 1051 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Traf3ip1Q149C2 Lcmt1-204ENSMUST00000206574 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Traf3ip1Q149C2 AC131997.1-201ENSMUST00000228611 1229 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Traf3ip1Q149C2 Smim11-201ENSMUST00000063641 517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Traf3ip1Q149C2 Epha2-201ENSMUST00000006614 3913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Traf3ip1Q149C2 Ptpn11-202ENSMUST00000100770 5599 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Traf3ip1Q149C2 Cyp4x1os-201ENSMUST00000153951 2003 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Traf3ip1Q149C2 Cyp2ab1-205ENSMUST00000182741 1497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Traf3ip1Q149C2 Anks1b-205ENSMUST00000179694 2663 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Traf3ip1Q149C2 Cyp11a1-201ENSMUST00000034874 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Traf3ip1Q149C2 Serinc1-201ENSMUST00000020027 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Traf3ip1Q149C2 Mfrp-202ENSMUST00000161381 4254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Traf3ip1Q149C2 Gak-201ENSMUST00000046603 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Traf3ip1Q149C2 Epha1-201ENSMUST00000073387 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Traf3ip1Q149C2 Usp42-201ENSMUST00000053287 5151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Traf3ip1Q149C2 Nfatc1-202ENSMUST00000078049 4607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Traf3ip1Q149C2 Stip1-201ENSMUST00000025918 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Traf3ip1Q149C2 Rps7-ps2-201ENSMUST00000219719 1347 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Traf3ip1Q149C2 Creg2-201ENSMUST00000053355 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Traf3ip1Q149C2 Cchcr1-202ENSMUST00000164242 2656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Traf3ip1Q149C2 Ylpm1-207ENSMUST00000168977 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Traf3ip1Q149C2 Cep164-204ENSMUST00000213154 6105 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Traf3ip1Q149C2 Mff-201ENSMUST00000073025 1706 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Traf3ip1Q149C2 Stk38-202ENSMUST00000119274 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Traf3ip1Q149C2 Umad1-208ENSMUST00000162034 2015 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Traf3ip1Q149C2 Samd4-203ENSMUST00000125113 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Traf3ip1Q149C2 Ric8b-202ENSMUST00000095385 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Traf3ip1Q149C2 Hist1h2br-202ENSMUST00000110476 381 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Traf3ip1Q149C2 Gm15491-201ENSMUST00000133963 751 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Traf3ip1Q149C2 Xrcc2-204ENSMUST00000134972 464 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Traf3ip1Q149C2 B9d2-202ENSMUST00000205325 593 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Traf3ip1Q149C2 AI463170-203ENSMUST00000219353 430 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Traf3ip1Q149C2 Gm30906-201ENSMUST00000219578 535 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Traf3ip1Q149C2 1700018B08Rik-201ENSMUST00000034265 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Traf3ip1Q149C2 Slc12a4-201ENSMUST00000034370 3811 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Traf3ip1Q149C2 Hist1h2bq-201ENSMUST00000078156 381 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Traf3ip1Q149C2 Eif4g1-203ENSMUST00000115457 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Traf3ip1Q149C2 Lin54-201ENSMUST00000046154 4451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Traf3ip1Q149C2 Ubxn4-201ENSMUST00000027592 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Traf3ip1Q149C2 Vwa2-201ENSMUST00000026068 4049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Traf3ip1Q149C2 Ccne2-207ENSMUST00000170901 3006 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Traf3ip1Q149C2 Hcrtr1-202ENSMUST00000119423 2439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Traf3ip1Q149C2 Clcnka-201ENSMUST00000042617 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Traf3ip1Q149C2 Rab37-201ENSMUST00000021076 2210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Traf3ip1Q149C2 Ccdc160-201ENSMUST00000101588 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Traf3ip1Q149C2 Nomo1-201ENSMUST00000033121 4257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Traf3ip1Q149C2 Kcnma1-228ENSMUST00000224468 3753 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Traf3ip1Q149C2 Gm28539-201ENSMUST00000190050 2982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Traf3ip1Q149C2 Mief1-201ENSMUST00000023048 5081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Traf3ip1Q149C2 Wrap53-201ENSMUST00000048139 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Traf3ip1Q149C2 Itpripl1-203ENSMUST00000154021 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Traf3ip1Q149C2 Ttll9-202ENSMUST00000103155 1552 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Traf3ip1Q149C2 Gm43738-201ENSMUST00000200659 2635 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Traf3ip1Q149C2 Srsf10-204ENSMUST00000105853 3058 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Traf3ip1Q149C2 Ldha-ps-201ENSMUST00000119390 995 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Traf3ip1Q149C2 Gm15222-201ENSMUST00000127359 344 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Traf3ip1Q149C2 C430049B03Rik-201ENSMUST00000129764 868 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Traf3ip1Q149C2 Gnb2-209ENSMUST00000143495 1285 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Traf3ip1Q149C2 AL593843.1-201ENSMUST00000195891 145 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Traf3ip1Q149C2 Gm34866-201ENSMUST00000196146 515 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Traf3ip1Q149C2 AC155258.1-201ENSMUST00000219303 253 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Traf3ip1Q149C2 Rps11-201ENSMUST00000003521 661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Traf3ip1Q149C2 Arhgap28-201ENSMUST00000024840 5322 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Traf3ip1Q149C2 4931428F04Rik-203ENSMUST00000212219 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Traf3ip1Q149C2 Hadhb-201ENSMUST00000026841 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Traf3ip1Q149C2 Slc39a11-203ENSMUST00000106633 2688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Traf3ip1Q149C2 Madd-201ENSMUST00000066420 3753 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Traf3ip1Q149C2 Dgki-202ENSMUST00000090314 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Traf3ip1Q149C2 Gm996-203ENSMUST00000188161 2925 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Traf3ip1Q149C2 Zfp574-202ENSMUST00000179556 4140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Traf3ip1Q149C2 Atp6ap1-201ENSMUST00000019231 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.5 ms