Protein–RNA interactions for Protein: Q148B6

Spatc1, Speriolin, mousemouse

Predictions only

Length 480 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Spatc1Q148B6 Cadm2-202ENSMUST00000120594 3248 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Spatc1Q148B6 Brsk1-202ENSMUST00000120836 2867 ntTSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Spatc1Q148B6 Srsf10-205ENSMUST00000126641 3754 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Spatc1Q148B6 Sned1-201ENSMUST00000062202 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Spatc1Q148B6 Prrt3-202ENSMUST00000204134 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Spatc1Q148B6 Pdlim3-201ENSMUST00000034053 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Spatc1Q148B6 Ube2g1-203ENSMUST00000138247 3931 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Spatc1Q148B6 Stip1-201ENSMUST00000025918 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Spatc1Q148B6 A530072M11Rik-201ENSMUST00000151122 1852 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Spatc1Q148B6 Adgrg3-201ENSMUST00000051259 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Spatc1Q148B6 Tnfrsf13b-202ENSMUST00000101103 750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Spatc1Q148B6 Brwd3-202ENSMUST00000101283 1066 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Spatc1Q148B6 Gm22065-201ENSMUST00000103753 110 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
Spatc1Q148B6 Gm22066-201ENSMUST00000103761 110 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
Spatc1Q148B6 Gm24932-201ENSMUST00000103763 110 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
Spatc1Q148B6 Gm24115-201ENSMUST00000103799 110 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
Spatc1Q148B6 Gm22190-201ENSMUST00000103827 110 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
Spatc1Q148B6 Gm22191-201ENSMUST00000103831 110 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
Spatc1Q148B6 Gm24721-201ENSMUST00000103849 110 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
Spatc1Q148B6 Gm28018-201ENSMUST00000103869 110 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
Spatc1Q148B6 Gm26399-201ENSMUST00000103937 110 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
Spatc1Q148B6 2210408F21Rik-210ENSMUST00000151076 539 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Spatc1Q148B6 Tgfb1i1-203ENSMUST00000163609 1053 ntTSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Spatc1Q148B6 Hsf4-207ENSMUST00000174837 1251 ntTSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Spatc1Q148B6 Gm25349-201ENSMUST00000177728 110 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
Spatc1Q148B6 Gm23616-201ENSMUST00000177797 110 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
Spatc1Q148B6 Gm25871-201ENSMUST00000177816 110 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
Spatc1Q148B6 Gm24752-201ENSMUST00000178240 110 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
Spatc1Q148B6 Gm24496-201ENSMUST00000178287 110 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
Spatc1Q148B6 Gm25649-201ENSMUST00000178476 110 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
Spatc1Q148B6 Gm25548-201ENSMUST00000178681 110 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
Spatc1Q148B6 Gm23147-201ENSMUST00000178841 110 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
Spatc1Q148B6 Gm26095-201ENSMUST00000179270 110 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
Spatc1Q148B6 Gm22171-201ENSMUST00000179283 110 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
Spatc1Q148B6 Gm23936-201ENSMUST00000179354 110 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
Spatc1Q148B6 Gm22619-201ENSMUST00000179516 110 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
Spatc1Q148B6 Gm25255-201ENSMUST00000179579 110 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
Spatc1Q148B6 Gm24755-201ENSMUST00000179691 110 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
Spatc1Q148B6 Gm26506-201ENSMUST00000179692 110 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
Spatc1Q148B6 Gm25086-201ENSMUST00000179931 110 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
Spatc1Q148B6 Gm23243-201ENSMUST00000180047 110 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
Spatc1Q148B6 Gm24659-201ENSMUST00000180212 110 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
Spatc1Q148B6 Gm24169-201ENSMUST00000180244 110 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
Spatc1Q148B6 Gm23689-201ENSMUST00000180354 110 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
Spatc1Q148B6 Prss47-201ENSMUST00000182457 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Spatc1Q148B6 Gm27359-201ENSMUST00000184153 110 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
Spatc1Q148B6 Gm27785-201ENSMUST00000184268 110 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
Spatc1Q148B6 Gm27466-201ENSMUST00000184396 110 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
Spatc1Q148B6 Gm27703-201ENSMUST00000184836 110 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
Spatc1Q148B6 AA619741-201ENSMUST00000195095 646 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
Spatc1Q148B6 Gm5186-201ENSMUST00000218781 920 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
Spatc1Q148B6 Wdyhv1-206ENSMUST00000227142 786 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
Spatc1Q148B6 Krtap19-4-201ENSMUST00000051103 304 ntAPPRIS P1 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Spatc1Q148B6 Gpbar1-201ENSMUST00000077985 1075 ntAPPRIS P1 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Spatc1Q148B6 1810030O07Rik-201ENSMUST00000060108 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Spatc1Q148B6 Nfic-207ENSMUST00000221817 1531 ntTSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Spatc1Q148B6 Gm13288-201ENSMUST00000094977 2850 ntAPPRIS P1 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Spatc1Q148B6 Ilvbl-201ENSMUST00000105384 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Spatc1Q148B6 Ilvbl-203ENSMUST00000218215 2331 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Spatc1Q148B6 Taf6-201ENSMUST00000048698 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Spatc1Q148B6 Slc37a1-201ENSMUST00000165149 3354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Spatc1Q148B6 Spock2-201ENSMUST00000121820 5238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Spatc1Q148B6 Muc20-201ENSMUST00000041123 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Spatc1Q148B6 St8sia3-201ENSMUST00000025477 6282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Spatc1Q148B6 Ppt2-209ENSMUST00000171121 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Spatc1Q148B6 Samd4b-204ENSMUST00000208199 4391 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Spatc1Q148B6 Adgrb2-202ENSMUST00000097868 4635 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Spatc1Q148B6 Klf4-201ENSMUST00000107619 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Spatc1Q148B6 2810408A11Rik-202ENSMUST00000100969 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Spatc1Q148B6 4930425O10Rik-201ENSMUST00000197761 1418 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Spatc1Q148B6 Tssk4-202ENSMUST00000164809 1686 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Spatc1Q148B6 Cpne1-201ENSMUST00000079312 1683 ntTSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Spatc1Q148B6 9130008F23Rik-201ENSMUST00000068258 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Spatc1Q148B6 Gak-201ENSMUST00000046603 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Spatc1Q148B6 Hgs-202ENSMUST00000106203 2901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Spatc1Q148B6 Hgs-201ENSMUST00000026900 2908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Spatc1Q148B6 Hspa12b-201ENSMUST00000099349 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Spatc1Q148B6 Pcgf5-211ENSMUST00000225920 6443 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
Spatc1Q148B6 Hspa4-201ENSMUST00000020630 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Spatc1Q148B6 Wdr70-201ENSMUST00000045766 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Spatc1Q148B6 Prrt3-201ENSMUST00000101059 3304 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Spatc1Q148B6 Spidr-201ENSMUST00000040248 3279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Spatc1Q148B6 Thap6-204ENSMUST00000193925 1337 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Spatc1Q148B6 Gpsm1-204ENSMUST00000114134 2043 ntTSL 3 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Spatc1Q148B6 Rbmx-203ENSMUST00000114730 2019 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Spatc1Q148B6 Gsdmd-201ENSMUST00000023238 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Spatc1Q148B6 Ythdf2-203ENSMUST00000152796 4129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Spatc1Q148B6 Cpeb3-210ENSMUST00000136286 5260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Spatc1Q148B6 Tmub2-205ENSMUST00000156326 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Spatc1Q148B6 Sp6-202ENSMUST00000107622 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Spatc1Q148B6 Stag1-206ENSMUST00000129269 6186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Spatc1Q148B6 Gm25287-201ENSMUST00000103846 110 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
Spatc1Q148B6 Gm22918-201ENSMUST00000103855 110 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
Spatc1Q148B6 Gm14104-201ENSMUST00000135990 356 ntTSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Spatc1Q148B6 Abhd11os-201ENSMUST00000136022 604 ntTSL 2 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Spatc1Q148B6 Tmem262-201ENSMUST00000143303 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Spatc1Q148B6 Pbx2-205ENSMUST00000183827 1186 ntTSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Spatc1Q148B6 Gm8239-201ENSMUST00000204094 444 ntTSL 2 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Spatc1Q148B6 Gm18041-201ENSMUST00000218210 618 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
Spatc1Q148B6 Tssk3-201ENSMUST00000000421 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.1 ms