Protein–RNA interactions for Protein: Q0VBD0

Itgb8, Integrin beta, mousemouse

Predictions only

Length 767 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Itgb8Q0VBD0 Lrig2-205ENSMUST00000198332 3946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
Itgb8Q0VBD0 Pja1-203ENSMUST00000113792 3038 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.35
Itgb8Q0VBD0 Samd4-203ENSMUST00000125113 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
Itgb8Q0VBD0 Pfkfb3-205ENSMUST00000114845 1971 ntTSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.35
Itgb8Q0VBD0 Sgk1-204ENSMUST00000120509 3096 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Itgb8Q0VBD0 Xrcc1-201ENSMUST00000063249 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Itgb8Q0VBD0 Hars2-201ENSMUST00000019287 2002 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Itgb8Q0VBD0 Col1a1-201ENSMUST00000001547 5930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Itgb8Q0VBD0 Begain-204ENSMUST00000209829 3272 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Itgb8Q0VBD0 Gm26688-201ENSMUST00000181176 1568 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Itgb8Q0VBD0 Map1lc3b-201ENSMUST00000034270 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Itgb8Q0VBD0 Cavin1-201ENSMUST00000060792 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Itgb8Q0VBD0 Atp6v1c2-208ENSMUST00000221129 1425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Itgb8Q0VBD0 Apip-201ENSMUST00000011055 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Itgb8Q0VBD0 Gm12017-201ENSMUST00000122453 1003 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
Itgb8Q0VBD0 Mir1895-201ENSMUST00000122615 79 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
Itgb8Q0VBD0 Xrcc2-204ENSMUST00000134972 464 ntTSL 3 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Itgb8Q0VBD0 Rprl2-201ENSMUST00000157150 290 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
Itgb8Q0VBD0 Gm5628-201ENSMUST00000222318 1049 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
Itgb8Q0VBD0 Trem2-201ENSMUST00000024791 1088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Itgb8Q0VBD0 Rgs10-201ENSMUST00000033133 880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Itgb8Q0VBD0 Nfatc1-202ENSMUST00000078049 4607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Itgb8Q0VBD0 Tapbp-201ENSMUST00000025161 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Itgb8Q0VBD0 Tmem30a-201ENSMUST00000034878 3658 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Itgb8Q0VBD0 BC026585-201ENSMUST00000046743 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Itgb8Q0VBD0 Krt74-201ENSMUST00000088018 1648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Itgb8Q0VBD0 Pcdhgb1-201ENSMUST00000192931 4723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Itgb8Q0VBD0 Pcdhga9-201ENSMUST00000091935 4724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Itgb8Q0VBD0 Gnai1-201ENSMUST00000074694 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Itgb8Q0VBD0 Tnfrsf21-201ENSMUST00000024708 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Itgb8Q0VBD0 Gm37795-201ENSMUST00000194216 2459 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
Itgb8Q0VBD0 Rreb1-202ENSMUST00000110237 4617 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Itgb8Q0VBD0 Ascc3-201ENSMUST00000035606 7760 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Itgb8Q0VBD0 Trim27-206ENSMUST00000222544 4312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Itgb8Q0VBD0 AU040320-202ENSMUST00000102607 4191 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Itgb8Q0VBD0 Ppig-201ENSMUST00000040915 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Itgb8Q0VBD0 Sipa1-201ENSMUST00000071857 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Itgb8Q0VBD0 Tpr-201ENSMUST00000119161 7480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Itgb8Q0VBD0 Rtn4-205ENSMUST00000102843 4618 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Itgb8Q0VBD0 Egfl7-212ENSMUST00000166920 1391 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Itgb8Q0VBD0 Ercc1-201ENSMUST00000003645 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Itgb8Q0VBD0 Tepsin-202ENSMUST00000093901 2770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Itgb8Q0VBD0 Tmem163-205ENSMUST00000185560 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Itgb8Q0VBD0 Top1mt-201ENSMUST00000000958 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Itgb8Q0VBD0 Ylpm1-201ENSMUST00000021670 7003 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Itgb8Q0VBD0 E2f3-203ENSMUST00000221536 4597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Itgb8Q0VBD0 E2f3-204ENSMUST00000222730 4579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Itgb8Q0VBD0 Col1a2-201ENSMUST00000031668 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Itgb8Q0VBD0 Anks1b-221ENSMUST00000182786 3042 ntTSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Itgb8Q0VBD0 Gm13233-201ENSMUST00000118760 1443 ntBASIC12.82□□□□□ -0.36
Itgb8Q0VBD0 Gm13244-201ENSMUST00000118855 1446 ntBASIC12.82□□□□□ -0.36
Itgb8Q0VBD0 Id2-202ENSMUST00000221761 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Itgb8Q0VBD0 Egr2-202ENSMUST00000105438 2864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Itgb8Q0VBD0 Arid1b-202ENSMUST00000115797 11325 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Itgb8Q0VBD0 Snx22-201ENSMUST00000044711 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Itgb8Q0VBD0 Setd1b-204ENSMUST00000163030 8857 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Itgb8Q0VBD0 Trav3-1-201ENSMUST00000103569 385 ntAPPRIS P1 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Itgb8Q0VBD0 Trav3-4-201ENSMUST00000103670 458 ntAPPRIS P1 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Itgb8Q0VBD0 Ntpcr-205ENSMUST00000143504 520 ntTSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Itgb8Q0VBD0 Slc36a3os-201ENSMUST00000155883 520 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Itgb8Q0VBD0 Umad1-206ENSMUST00000160705 624 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Itgb8Q0VBD0 Gm17455-201ENSMUST00000164428 855 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Itgb8Q0VBD0 Mpped1-210ENSMUST00000172115 795 ntTSL 3 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Itgb8Q0VBD0 Mpped1-211ENSMUST00000172398 795 ntTSL 3 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Itgb8Q0VBD0 Ube2i-208ENSMUST00000173084 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Itgb8Q0VBD0 Gm18889-201ENSMUST00000174284 929 ntBASIC12.82□□□□□ -0.36
Itgb8Q0VBD0 Gm20949-201ENSMUST00000206478 952 ntBASIC12.82□□□□□ -0.36
Itgb8Q0VBD0 Gm45612-201ENSMUST00000211320 160 ntBASIC12.82□□□□□ -0.36
Itgb8Q0VBD0 9230110C19Rik-202ENSMUST00000215478 533 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Itgb8Q0VBD0 AC154595.3-201ENSMUST00000224579 384 ntBASIC12.82□□□□□ -0.36
Itgb8Q0VBD0 Dmrt1-202ENSMUST00000087525 1130 ntTSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Itgb8Q0VBD0 Erich4-201ENSMUST00000098663 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Itgb8Q0VBD0 Rapgef6-205ENSMUST00000108895 1829 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Itgb8Q0VBD0 Mcpt9-201ENSMUST00000095798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Itgb8Q0VBD0 Adgrb2-202ENSMUST00000097868 4635 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Itgb8Q0VBD0 Sf3a2-203ENSMUST00000148665 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Itgb8Q0VBD0 Teddm2-202ENSMUST00000123490 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Itgb8Q0VBD0 Ldlrad3-201ENSMUST00000058790 3833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Itgb8Q0VBD0 Tmem39a-201ENSMUST00000002924 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Itgb8Q0VBD0 Gm9924-202ENSMUST00000192760 2311 ntBASIC12.82□□□□□ -0.36
Itgb8Q0VBD0 Lancl1-202ENSMUST00000113979 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Itgb8Q0VBD0 Sh3bp2-207ENSMUST00000179943 2935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Itgb8Q0VBD0 2410002F23Rik-206ENSMUST00000107950 3336 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Itgb8Q0VBD0 Ntf3-202ENSMUST00000112244 1399 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Itgb8Q0VBD0 Gm36745-201ENSMUST00000213455 1594 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Itgb8Q0VBD0 Plk4-203ENSMUST00000203295 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Itgb8Q0VBD0 Aldh6a1-201ENSMUST00000085192 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Itgb8Q0VBD0 Gga3-202ENSMUST00000106508 3582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Itgb8Q0VBD0 Serpinh1-201ENSMUST00000094154 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Itgb8Q0VBD0 Aph1a-202ENSMUST00000056710 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Itgb8Q0VBD0 Gid4-201ENSMUST00000070681 4283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Itgb8Q0VBD0 Rnf4-204ENSMUST00000182047 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Itgb8Q0VBD0 Dcun1d3-203ENSMUST00000106519 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Itgb8Q0VBD0 Mllt10-203ENSMUST00000114671 5063 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Itgb8Q0VBD0 Kir3dl1-201ENSMUST00000113104 1031 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Itgb8Q0VBD0 Meig1-204ENSMUST00000115083 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Itgb8Q0VBD0 Mecp2-204ENSMUST00000140399 1168 ntTSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Itgb8Q0VBD0 Cebpzos-202ENSMUST00000180077 602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Itgb8Q0VBD0 Gm27920-201ENSMUST00000183953 96 ntBASIC12.81□□□□□ -0.36
Itgb8Q0VBD0 Pxn-213ENSMUST00000202564 2126 ntTSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.4 ms