Protein–RNA interactions for Protein: Q07646

Mest, Mesoderm-specific transcript protein, mousemouse

Predictions only

Length 335 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MestQ07646 Hnrnph2-201ENSMUST00000050331 1701 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
MestQ07646 Ero1lb-202ENSMUST00000220811 3341 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
MestQ07646 Chaf1a-201ENSMUST00000002914 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
MestQ07646 Gm12462-201ENSMUST00000140826 3056 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
MestQ07646 Stag1-206ENSMUST00000129269 6186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
MestQ07646 Kansl2-ps-201ENSMUST00000181818 1461 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
MestQ07646 Yes1-201ENSMUST00000072311 4586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
MestQ07646 Sirt3-210ENSMUST00000211179 1606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
MestQ07646 Ankrd50-201ENSMUST00000094300 1944 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
MestQ07646 Gm14752-201ENSMUST00000120719 2075 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
MestQ07646 Litaf-201ENSMUST00000023143 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
MestQ07646 Gpc2-201ENSMUST00000014089 2514 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
MestQ07646 Slc52a3-201ENSMUST00000073228 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
MestQ07646 Gm20488-201ENSMUST00000201641 2996 ntTSL 2 BASIC12.33□□□□□ -0.44
MestQ07646 Nrd1-202ENSMUST00000102736 4179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
MestQ07646 Spock2-201ENSMUST00000121820 5238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
MestQ07646 Dnajc6-204ENSMUST00000106930 5127 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
MestQ07646 Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 2739 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
MestQ07646 Rasgef1c-202ENSMUST00000093141 2120 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
MestQ07646 Hoxc4-201ENSMUST00000100164 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
MestQ07646 Shc4-203ENSMUST00000110480 3671 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
MestQ07646 Kcnk13-204ENSMUST00000177549 3075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
MestQ07646 Eif1ad-201ENSMUST00000025759 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
MestQ07646 Dnm1-203ENSMUST00000113350 3258 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
MestQ07646 Lamc2-201ENSMUST00000027753 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
MestQ07646 Agap1-201ENSMUST00000027521 11921 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
MestQ07646 Fbxl19-202ENSMUST00000186116 3641 ntTSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
MestQ07646 Lrrc56-202ENSMUST00000070458 2502 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
MestQ07646 Pnn-201ENSMUST00000021381 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
MestQ07646 Gcsh-201ENSMUST00000040484 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
MestQ07646 Pcdha1-202ENSMUST00000193839 4925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
MestQ07646 Gucy1a2-201ENSMUST00000115733 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.32□□□□□ -0.44
MestQ07646 Trappc6a-202ENSMUST00000108455 651 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
MestQ07646 Shf-202ENSMUST00000110530 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
MestQ07646 Taf3-202ENSMUST00000114906 583 ntTSL 2 BASIC12.32□□□□□ -0.44
MestQ07646 Gm11557-201ENSMUST00000120200 1008 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
MestQ07646 Cd63-ps-201ENSMUST00000145417 875 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
MestQ07646 9530003J23Rik-202ENSMUST00000159193 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
MestQ07646 Gm8927-201ENSMUST00000181978 981 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
MestQ07646 Gm11214-201ENSMUST00000184252 552 ntAPPRIS P1 BASIC12.32□□□□□ -0.44
MestQ07646 Gm36536-201ENSMUST00000194241 959 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
MestQ07646 Gm30191-201ENSMUST00000205501 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
MestQ07646 Hes5-201ENSMUST00000049621 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
MestQ07646 Clec4g-202ENSMUST00000062037 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
MestQ07646 Aym1-201ENSMUST00000066573 528 ntAPPRIS P1 BASIC12.32□□□□□ -0.44
MestQ07646 Gm3222-201ENSMUST00000071282 990 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
MestQ07646 H2-Q6-202ENSMUST00000174699 2085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
MestQ07646 Entpd2-201ENSMUST00000028328 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
MestQ07646 Bnc2-215ENSMUST00000176691 3385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
MestQ07646 Mocs1-204ENSMUST00000173033 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
MestQ07646 Src-202ENSMUST00000092576 3887 ntTSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
MestQ07646 Spata5-209ENSMUST00000198968 2916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
MestQ07646 Gtf2a1l-201ENSMUST00000024970 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
MestQ07646 Chd4-203ENSMUST00000112392 6652 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
MestQ07646 Aptx-201ENSMUST00000030119 5250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
MestQ07646 Arhgef5-201ENSMUST00000031750 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
MestQ07646 Cpeb4-201ENSMUST00000020543 2312 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
MestQ07646 Atp9b-213ENSMUST00000225980 5150 ntAPPRIS P2 BASIC12.32□□□□□ -0.44
MestQ07646 Dhx29-201ENSMUST00000038574 4682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
MestQ07646 Axdnd1-204ENSMUST00000178036 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
MestQ07646 Poli-205ENSMUST00000161542 2736 ntTSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
MestQ07646 Mpped1-203ENSMUST00000109470 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
MestQ07646 Abhd14b-201ENSMUST00000048527 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
MestQ07646 Kyat1-204ENSMUST00000113661 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
MestQ07646 CT030684.3-201ENSMUST00000227308 2445 ntBASIC12.31□□□□□ -0.44
MestQ07646 Prr33-201ENSMUST00000054910 2251 ntTSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
MestQ07646 Uba3-201ENSMUST00000089287 2257 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
MestQ07646 CT025610.1-201ENSMUST00000224552 1786 ntBASIC12.31□□□□□ -0.44
MestQ07646 Adgrb2-202ENSMUST00000097868 4635 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
MestQ07646 Cnnm2-202ENSMUST00000099373 3558 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
MestQ07646 Ilvbl-203ENSMUST00000218215 2331 ntTSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
MestQ07646 Lrfn2-201ENSMUST00000046254 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
MestQ07646 Wdr5-201ENSMUST00000113952 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
MestQ07646 Mcoln2-201ENSMUST00000011152 2520 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
MestQ07646 Tmed8-201ENSMUST00000037418 7409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
MestQ07646 Kmt5c-203ENSMUST00000108583 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
MestQ07646 Stau2-215ENSMUST00000162435 2735 ntTSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
MestQ07646 Wfdc3-201ENSMUST00000103096 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
MestQ07646 Gm12585-201ENSMUST00000117307 290 ntBASIC12.31□□□□□ -0.44
MestQ07646 Gm13385-201ENSMUST00000121089 220 ntBASIC12.31□□□□□ -0.44
MestQ07646 H60b-202ENSMUST00000131558 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
MestQ07646 Btf3-204ENSMUST00000134542 780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.31□□□□□ -0.44
MestQ07646 Cenpa-206ENSMUST00000149759 346 ntTSL 3 BASIC12.31□□□□□ -0.44
MestQ07646 Gnb2-215ENSMUST00000170293 993 ntTSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
MestQ07646 Gm4804-201ENSMUST00000182234 999 ntBASIC12.31□□□□□ -0.44
MestQ07646 Gm10766-202ENSMUST00000194123 606 ntBASIC12.31□□□□□ -0.44
MestQ07646 Tmem129-204ENSMUST00000200849 657 ntTSL 3 BASIC12.31□□□□□ -0.44
MestQ07646 Gm44719-201ENSMUST00000206404 149 ntBASIC12.31□□□□□ -0.44
MestQ07646 4930408O17Rik-202ENSMUST00000222624 1131 ntTSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
MestQ07646 AC126408.1-201ENSMUST00000225184 523 ntBASIC12.31□□□□□ -0.44
MestQ07646 Nanos3-201ENSMUST00000070102 730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
MestQ07646 Krtap6-5-201ENSMUST00000074637 600 ntAPPRIS P1 BASIC12.31□□□□□ -0.44
MestQ07646 Gm37691-201ENSMUST00000192147 2573 ntBASIC12.31□□□□□ -0.44
MestQ07646 Gucy2e-202ENSMUST00000108664 4415 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
MestQ07646 Nek8-201ENSMUST00000017549 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
MestQ07646 Cpeb3-210ENSMUST00000136286 5260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
MestQ07646 Dnmt3b-206ENSMUST00000103151 3956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
MestQ07646 Ttc8-202ENSMUST00000085109 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
MestQ07646 Uqcrq-201ENSMUST00000061326 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
MestQ07646 Taf2-201ENSMUST00000041733 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28 ms