Protein–RNA interactions for Protein: Q06986

Siah2, E3 ubiquitin-protein ligase SIAH2, mousemouse

Predictions only

Length 325 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Siah2Q06986 Syce1l-202ENSMUST00000095173 791 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Siah2Q06986 Men1-208ENSMUST00000113504 2663 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Siah2Q06986 Ptprn2-201ENSMUST00000070733 3201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Siah2Q06986 Ociad2-204ENSMUST00000200830 2384 ntTSL 3 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Siah2Q06986 Myef2-207ENSMUST00000147105 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Siah2Q06986 Gm10125-203ENSMUST00000161096 3493 ntTSL 3 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Siah2Q06986 Mtus2-204ENSMUST00000110514 1532 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Siah2Q06986 Pus1-207ENSMUST00000170468 1510 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Siah2Q06986 Cep170b-204ENSMUST00000220627 5395 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Siah2Q06986 Ywhab-201ENSMUST00000018470 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Siah2Q06986 Gm5357-201ENSMUST00000212720 1924 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Siah2Q06986 Iffo2-201ENSMUST00000040023 5227 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Siah2Q06986 Palm3-201ENSMUST00000055077 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Siah2Q06986 Gm45638-201ENSMUST00000211507 2878 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Siah2Q06986 Plcb3-201ENSMUST00000025912 4201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Siah2Q06986 Mgat1-202ENSMUST00000101293 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Siah2Q06986 Ccdc117-201ENSMUST00000020776 3372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Siah2Q06986 Ncln-202ENSMUST00000118498 2841 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Siah2Q06986 Pqlc1-204ENSMUST00000129043 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Siah2Q06986 9930014A18Rik-201ENSMUST00000180730 3074 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Siah2Q06986 Pcyox1-201ENSMUST00000032065 4295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Siah2Q06986 AC159621.2-201ENSMUST00000223519 1326 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Siah2Q06986 Rnf123-214ENSMUST00000162355 4727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Siah2Q06986 Kat8-201ENSMUST00000033070 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Siah2Q06986 Arl6-202ENSMUST00000099646 1554 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Siah2Q06986 Lrwd1-201ENSMUST00000006301 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Siah2Q06986 Clic6-201ENSMUST00000023670 3758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Siah2Q06986 Ube3a-216ENSMUST00000202945 3889 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Siah2Q06986 Cbl-206ENSMUST00000206147 3452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Siah2Q06986 Zfr2-201ENSMUST00000117798 3349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Siah2Q06986 Hspb11-202ENSMUST00000106749 607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Siah2Q06986 Diablo-202ENSMUST00000111586 719 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Siah2Q06986 Eef1akmt4-201ENSMUST00000115522 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Siah2Q06986 Mir1192-201ENSMUST00000116976 121 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Siah2Q06986 Gm11510-201ENSMUST00000120278 347 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Siah2Q06986 Hras-203ENSMUST00000124314 1073 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Siah2Q06986 Gm28050-201ENSMUST00000124394 449 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Siah2Q06986 A230072E10Rik-201ENSMUST00000146161 676 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Siah2Q06986 Esd-207ENSMUST00000176957 1117 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Siah2Q06986 Gm7967-201ENSMUST00000190991 399 ntTSL 3 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Siah2Q06986 Tpi-rs5-201ENSMUST00000216947 774 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Siah2Q06986 AC153801.1-201ENSMUST00000217904 947 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Siah2Q06986 AC134860.5-201ENSMUST00000225071 1249 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Siah2Q06986 Exosc7-201ENSMUST00000026891 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Siah2Q06986 Diablo-201ENSMUST00000031385 681 ntTSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Siah2Q06986 Rpl28-201ENSMUST00000032597 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Siah2Q06986 Olfr1410-201ENSMUST00000079790 969 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Siah2Q06986 Rpl10-ps2-201ENSMUST00000098432 645 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Siah2Q06986 Sirt5-206ENSMUST00000221481 1548 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Siah2Q06986 Aatk-201ENSMUST00000064307 5336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Siah2Q06986 Fbxo27-202ENSMUST00000108280 2031 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Siah2Q06986 Rnaseh2a-203ENSMUST00000109738 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Siah2Q06986 Nptn-201ENSMUST00000085651 2024 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Siah2Q06986 Gm15512-201ENSMUST00000137359 2257 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Siah2Q06986 Teddm2-202ENSMUST00000123490 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Siah2Q06986 Nlrx1-203ENSMUST00000169651 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Siah2Q06986 Jade1-204ENSMUST00000170711 2896 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Siah2Q06986 Zfp13-201ENSMUST00000057029 2139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Siah2Q06986 Fam76b-201ENSMUST00000059579 3702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Siah2Q06986 B430305J03Rik-201ENSMUST00000066298 3702 ntAPPRIS P1 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Siah2Q06986 Csrnp1-204ENSMUST00000215916 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Siah2Q06986 Ccp110-202ENSMUST00000106557 5073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Siah2Q06986 Zfp707-202ENSMUST00000109967 1703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Siah2Q06986 Cldn14-204ENSMUST00000169391 1456 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Siah2Q06986 Sh2b2-201ENSMUST00000005188 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Siah2Q06986 Prickle3-201ENSMUST00000033485 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Siah2Q06986 Grm6-201ENSMUST00000000631 4291 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Siah2Q06986 Ccdc103-201ENSMUST00000021307 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Siah2Q06986 4930459C07Rik-202ENSMUST00000219638 1805 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Siah2Q06986 Notch1-201ENSMUST00000028288 9488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Siah2Q06986 Cyfip1-201ENSMUST00000032629 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Siah2Q06986 Esrrb-206ENSMUST00000167891 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Siah2Q06986 Tmem199-201ENSMUST00000052566 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Siah2Q06986 Pigg-203ENSMUST00000119014 4573 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Siah2Q06986 Tbrg4-201ENSMUST00000000394 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Siah2Q06986 Rbfox2-209ENSMUST00000228087 1694 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Siah2Q06986 Guca1b-201ENSMUST00000024774 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Siah2Q06986 Zfand3-201ENSMUST00000057897 2617 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Siah2Q06986 Erg-206ENSMUST00000122199 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Siah2Q06986 Ydjc-203ENSMUST00000115706 3097 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Siah2Q06986 Atp2b3-202ENSMUST00000088429 4483 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Siah2Q06986 Iws1-201ENSMUST00000025243 9613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Siah2Q06986 2610011E03Rik-201ENSMUST00000200128 2235 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Siah2Q06986 Ncor2-206ENSMUST00000111402 8862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Siah2Q06986 Emc7-201ENSMUST00000069747 5826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Siah2Q06986 Rhbdl3-201ENSMUST00000017836 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Siah2Q06986 Taf6-201ENSMUST00000048698 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Siah2Q06986 1010001N08Rik-201ENSMUST00000180789 1967 ntTSL 2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Siah2Q06986 Apip-201ENSMUST00000011055 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Siah2Q06986 Cops9-202ENSMUST00000112999 653 ntTSL 3 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Siah2Q06986 Rhox2d-201ENSMUST00000115179 685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Siah2Q06986 1700045H11Rik-201ENSMUST00000128056 593 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Siah2Q06986 Ncr3-ps-201ENSMUST00000134687 525 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Siah2Q06986 Gm11682-201ENSMUST00000144689 516 ntTSL 3 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Siah2Q06986 Snu13-203ENSMUST00000166578 1061 ntTSL 2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Siah2Q06986 9330185C12Rik-201ENSMUST00000180837 1009 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Siah2Q06986 1700122D07Rik-201ENSMUST00000186973 421 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Siah2Q06986 Panct2-202ENSMUST00000188631 625 ntTSL 3 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Siah2Q06986 Gm28455-201ENSMUST00000189105 1290 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Siah2Q06986 Gm18766-201ENSMUST00000189811 808 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.4 ms