Protein–RNA interactions for Protein: P97452

Bop1, Ribosome biogenesis protein BOP1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 732 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bop1P97452 Abhd11os-201ENSMUST00000136022 604 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Bop1P97452 Zfp511-201ENSMUST00000168194 1076 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Bop1P97452 Gm28277-201ENSMUST00000187450 885 ntTSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Bop1P97452 Mir124-2hg-206ENSMUST00000189754 525 ntTSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Bop1P97452 Mcee-203ENSMUST00000206194 532 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Bop1P97452 Tmem86b-204ENSMUST00000206610 522 ntTSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Bop1P97452 Pecr-201ENSMUST00000027381 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Bop1P97452 Rab33a-201ENSMUST00000033430 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Bop1P97452 Olfr324-201ENSMUST00000054683 1122 ntAPPRIS P2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Bop1P97452 Gm6594-201ENSMUST00000097278 288 ntAPPRIS P1 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Bop1P97452 Gpr132-201ENSMUST00000021729 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Bop1P97452 Elf4-202ENSMUST00000114958 6088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Bop1P97452 Diaph1-202ENSMUST00000080033 4378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Bop1P97452 Gm26576-201ENSMUST00000181018 1977 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Bop1P97452 Asb10-201ENSMUST00000048302 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Bop1P97452 Arhgef2-229ENSMUST00000177303 3000 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Bop1P97452 Tbl1xr1-203ENSMUST00000193734 8237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Bop1P97452 Myog-201ENSMUST00000027730 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Bop1P97452 Kcnf1-201ENSMUST00000170580 4789 ntAPPRIS P1 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Bop1P97452 Zfp365-201ENSMUST00000064656 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Bop1P97452 Tmem51os1-203ENSMUST00000150202 1667 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Bop1P97452 AC154767.3-201ENSMUST00000225150 1342 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Bop1P97452 Tmub2-205ENSMUST00000156326 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Bop1P97452 Samd7-201ENSMUST00000108262 3144 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Bop1P97452 Hipk4-202ENSMUST00000108353 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Bop1P97452 Stpg2-202ENSMUST00000106239 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Bop1P97452 Tcf4-210ENSMUST00000128706 2066 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Bop1P97452 Ecm1-202ENSMUST00000117507 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Bop1P97452 Egfl7-212ENSMUST00000166920 1391 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Bop1P97452 Ntrk2-204ENSMUST00000224259 3049 ntBASIC13.58□□□□□ -0.23
Bop1P97452 Fbxo15-204ENSMUST00000224467 1908 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.58□□□□□ -0.23
Bop1P97452 Alg2-201ENSMUST00000044148 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Bop1P97452 Tbx3-201ENSMUST00000018748 4856 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Bop1P97452 Scara5-201ENSMUST00000022610 3794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Bop1P97452 Igfals-201ENSMUST00000050714 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Bop1P97452 Rbm33-201ENSMUST00000030920 3955 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Bop1P97452 Larp1b-205ENSMUST00000191805 1581 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.23
Bop1P97452 Galt-201ENSMUST00000084695 1595 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Bop1P97452 Fam192a-201ENSMUST00000034226 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Bop1P97452 Dolpp1-202ENSMUST00000113612 1958 ntTSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Bop1P97452 Tsku-205ENSMUST00000167405 2597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Bop1P97452 Phka1-204ENSMUST00000119229 6025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Bop1P97452 Rbm47-206ENSMUST00000200775 3180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Bop1P97452 Gm38577-201ENSMUST00000221531 4545 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Bop1P97452 Fbxo25-201ENSMUST00000043520 2012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Bop1P97452 Tbc1d22a-201ENSMUST00000063414 3229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Bop1P97452 Apip-201ENSMUST00000011055 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Bop1P97452 Gm17613-201ENSMUST00000138893 669 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Bop1P97452 5830408C22Rik-201ENSMUST00000210072 1115 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Bop1P97452 Vps25-202ENSMUST00000042477 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Bop1P97452 Klk1-201ENSMUST00000075162 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Bop1P97452 Sema6c-202ENSMUST00000090823 4029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Bop1P97452 Atg7-207ENSMUST00000182428 2264 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Bop1P97452 R3hdm2-212ENSMUST00000166820 4281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Bop1P97452 Dnmt3b-204ENSMUST00000088976 4130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Bop1P97452 Kctd11-201ENSMUST00000050555 3146 ntAPPRIS P1 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Bop1P97452 Sec61a2-209ENSMUST00000193792 2110 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Bop1P97452 Dnmt3b-206ENSMUST00000103151 3956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Bop1P97452 1810032O08Rik-201ENSMUST00000106378 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Bop1P97452 Pax6-202ENSMUST00000090397 3069 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Bop1P97452 Aspm-205ENSMUST00000200083 6072 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Bop1P97452 Mdm2-202ENSMUST00000105263 3145 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Bop1P97452 Gpr157-201ENSMUST00000094451 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Bop1P97452 Hsd17b14-201ENSMUST00000107752 1400 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Bop1P97452 Gapdh-203ENSMUST00000118875 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Bop1P97452 3110082I17Rik-201ENSMUST00000066052 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Bop1P97452 Plch2-210ENSMUST00000176194 5619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Bop1P97452 Ifi47-201ENSMUST00000046704 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Bop1P97452 Ltc4s-202ENSMUST00000102772 649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Bop1P97452 Gamt-202ENSMUST00000105363 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Bop1P97452 Gm7336-201ENSMUST00000107041 1232 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Bop1P97452 Styxl1-204ENSMUST00000111163 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Bop1P97452 Gm14057-201ENSMUST00000120631 482 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Bop1P97452 Gm18737-201ENSMUST00000173594 937 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Bop1P97452 Gm20509-201ENSMUST00000174203 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Bop1P97452 Gm27430-201ENSMUST00000184585 107 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Bop1P97452 Gm44333-201ENSMUST00000197168 107 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Bop1P97452 1700128F08Rik-202ENSMUST00000213708 717 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Bop1P97452 Gm33785-201ENSMUST00000222961 886 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Bop1P97452 G430095P16Rik-201ENSMUST00000098571 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Bop1P97452 Dgke-201ENSMUST00000000285 5208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Bop1P97452 Epb41l1-205ENSMUST00000109574 5904 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Bop1P97452 Elfn2-201ENSMUST00000088592 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Bop1P97452 C5ar1-201ENSMUST00000050770 2481 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Bop1P97452 Troap-201ENSMUST00000039665 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Bop1P97452 Pcdh10-204ENSMUST00000193252 4638 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Bop1P97452 Gm10729-202ENSMUST00000193403 1375 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Bop1P97452 Xrcc1-201ENSMUST00000063249 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Bop1P97452 Gm17396-201ENSMUST00000172075 1655 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Bop1P97452 Fam222b-201ENSMUST00000073705 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Bop1P97452 Ptcd2-201ENSMUST00000022153 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Bop1P97452 Grin2a-202ENSMUST00000115835 5023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Bop1P97452 Atp6v1h-204ENSMUST00000192698 1811 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Bop1P97452 Tcirg1-201ENSMUST00000001801 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Bop1P97452 Oprl1-203ENSMUST00000108766 1241 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Bop1P97452 Ppil3-203ENSMUST00000114348 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Bop1P97452 Gm13883-202ENSMUST00000151310 1156 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Bop1P97452 AC155937.1-202ENSMUST00000156229 621 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Bop1P97452 Gm16163-201ENSMUST00000161868 1119 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Bop1P97452 Gm10044-204ENSMUST00000170177 659 ntTSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.8 ms