Protein–RNA interactions for Protein: P70662

Ldb1, LIM domain-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 411 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ldb1P70662 Gm14767-201ENSMUST00000121559 586 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Ldb1P70662 A930015D03Rik-201ENSMUST00000173900 1111 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ldb1P70662 Panct2-202ENSMUST00000188631 625 ntTSL 3 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ldb1P70662 Cxcl17-202ENSMUST00000200880 760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ldb1P70662 Gm6566-201ENSMUST00000221468 1171 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ldb1P70662 AC126408.1-201ENSMUST00000225184 523 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Ldb1P70662 Lcn5-201ENSMUST00000028306 696 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ldb1P70662 Polr2j-201ENSMUST00000041366 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ldb1P70662 Cxcl17-201ENSMUST00000074040 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ldb1P70662 Tcf12-202ENSMUST00000183404 6299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ldb1P70662 Pfkl-201ENSMUST00000020522 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ldb1P70662 Gm26525-201ENSMUST00000180666 3616 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ldb1P70662 Gm26867-201ENSMUST00000180963 3615 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ldb1P70662 P4ha1-202ENSMUST00000092512 2387 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ldb1P70662 Atp6ap1-201ENSMUST00000019231 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ldb1P70662 Pja1-202ENSMUST00000113790 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ldb1P70662 Ksr1-207ENSMUST00000226282 5260 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Ldb1P70662 Gm28539-201ENSMUST00000190050 2982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ldb1P70662 Car7-202ENSMUST00000159416 1943 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ldb1P70662 Aff2-201ENSMUST00000033532 4523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ldb1P70662 Spin1-201ENSMUST00000095797 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ldb1P70662 Ptprk-201ENSMUST00000166468 6177 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ldb1P70662 Pip5k1c-201ENSMUST00000045469 4323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ldb1P70662 Ppt2-209ENSMUST00000171121 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ldb1P70662 Mff-201ENSMUST00000073025 1706 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ldb1P70662 Obsl1-201ENSMUST00000113565 3379 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ldb1P70662 Gm13589-201ENSMUST00000146404 1675 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ldb1P70662 B230319C09Rik-201ENSMUST00000063376 1689 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ldb1P70662 Awat2-201ENSMUST00000033567 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ldb1P70662 Pdlim2-210ENSMUST00000153735 1578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ldb1P70662 Cyp2d11-201ENSMUST00000170255 1590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ldb1P70662 Hsph1-205ENSMUST00000201452 3140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ldb1P70662 Ube2g1-201ENSMUST00000021148 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ldb1P70662 Twf2-204ENSMUST00000188650 1508 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ldb1P70662 2810402E24Rik-201ENSMUST00000190699 3040 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Ldb1P70662 Dnmt3b-209ENSMUST00000109773 4148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ldb1P70662 Arhgap4-204ENSMUST00000114406 2749 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ldb1P70662 Gm8337-201ENSMUST00000187358 1938 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Ldb1P70662 Mcfd2-202ENSMUST00000129616 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ldb1P70662 Gm27680-201ENSMUST00000184192 160 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Ldb1P70662 AC153872.1-201ENSMUST00000199539 128 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Ldb1P70662 Gm8239-201ENSMUST00000204094 444 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ldb1P70662 Gm7775-201ENSMUST00000218871 853 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Ldb1P70662 Gm9063-201ENSMUST00000223299 582 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Ldb1P70662 Lin37-201ENSMUST00000043975 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ldb1P70662 Olfr975-201ENSMUST00000054067 933 ntAPPRIS P1 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ldb1P70662 Iqcf3-201ENSMUST00000062917 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ldb1P70662 Syce1l-202ENSMUST00000095173 791 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ldb1P70662 Polr2g-201ENSMUST00000096261 868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ldb1P70662 Slc4a4-207ENSMUST00000148750 7931 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ldb1P70662 Hipk4-202ENSMUST00000108353 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ldb1P70662 Bag6-203ENSMUST00000172571 3599 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ldb1P70662 Pde4a-203ENSMUST00000115458 2962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ldb1P70662 Gars-201ENSMUST00000003572 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ldb1P70662 Rbmx2-201ENSMUST00000033433 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ldb1P70662 Abhd14b-201ENSMUST00000048527 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ldb1P70662 Steap2-203ENSMUST00000115425 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ldb1P70662 Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 2739 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ldb1P70662 Ate1-202ENSMUST00000035458 4685 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ldb1P70662 Clec16a-205ENSMUST00000115827 2949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ldb1P70662 Slc25a18-201ENSMUST00000112682 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ldb1P70662 Prrt3-201ENSMUST00000101059 3304 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ldb1P70662 Slc6a4-202ENSMUST00000108402 2796 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ldb1P70662 Ythdf2-203ENSMUST00000152796 4129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ldb1P70662 Mmp11-202ENSMUST00000120281 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ldb1P70662 Itpripl1-203ENSMUST00000154021 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ldb1P70662 Apc-202ENSMUST00000079362 8867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ldb1P70662 Grin3a-202ENSMUST00000093859 7491 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ldb1P70662 Rnpc3-202ENSMUST00000106535 2616 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ldb1P70662 Mfap4-202ENSMUST00000064783 1722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ldb1P70662 Tex30-213ENSMUST00000156392 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ldb1P70662 Baiap2l2-205ENSMUST00000170955 1058 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ldb1P70662 Gm27321-201ENSMUST00000185021 205 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Ldb1P70662 4930502C17Rik-201ENSMUST00000200282 948 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Ldb1P70662 Ccdc88c-204ENSMUST00000223097 1253 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ldb1P70662 Pim2-204ENSMUST00000223553 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ldb1P70662 AC149294.4-201ENSMUST00000227870 882 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Ldb1P70662 Ldlrad3-201ENSMUST00000058790 3833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ldb1P70662 Lrrc56-202ENSMUST00000070458 2502 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ldb1P70662 Gm42769-201ENSMUST00000198576 1659 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Ldb1P70662 Nol9-201ENSMUST00000084116 3722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ldb1P70662 Sbk1-201ENSMUST00000056028 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ldb1P70662 Disp1-205ENSMUST00000195372 4901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ldb1P70662 Aire-207ENSMUST00000140636 1615 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ldb1P70662 Opa1-201ENSMUST00000038867 3230 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ldb1P70662 Gm10406-202ENSMUST00000170738 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ldb1P70662 Rtraf-201ENSMUST00000022341 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ldb1P70662 Gm37133-201ENSMUST00000192705 1922 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Ldb1P70662 March8-213ENSMUST00000203193 4245 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ldb1P70662 Gale-201ENSMUST00000102540 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ldb1P70662 Lrrc8a-202ENSMUST00000113654 4194 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ldb1P70662 Gtf2i-206ENSMUST00000172715 4114 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ldb1P70662 Sun1-202ENSMUST00000078690 2608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ldb1P70662 Nup98-206ENSMUST00000211235 3748 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ldb1P70662 Mpp4-210ENSMUST00000191200 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ldb1P70662 Dnm1-201ENSMUST00000078352 3246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ldb1P70662 Trim32-202ENSMUST00000107366 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ldb1P70662 Gtf2ird1-229ENSMUST00000202554 3514 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ldb1P70662 Chtop-205ENSMUST00000107343 3118 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ldb1P70662 Rplp0-201ENSMUST00000086519 1358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 65.6 ms