Protein–RNA interactions for Protein: P68368

Tuba4a, Tubulin alpha-4A chain, mousemouse

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Length 448 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tuba4aP68368 H2af-ps-201ENSMUST00000119066 295 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Tuba4aP68368 Fam241b-208ENSMUST00000142796 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Tuba4aP68368 Nmi-205ENSMUST00000145481 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Tuba4aP68368 Grip1os3-202ENSMUST00000146294 957 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Tuba4aP68368 Sirpa-213ENSMUST00000163034 677 ntTSL 3 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Tuba4aP68368 Mir8117-201ENSMUST00000184773 107 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Tuba4aP68368 Gm2213-201ENSMUST00000197485 688 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Tuba4aP68368 Gm44123-201ENSMUST00000204662 577 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Tuba4aP68368 Tpd52l1-202ENSMUST00000213528 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Tuba4aP68368 AC159295.1-201ENSMUST00000225326 940 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Tuba4aP68368 Nek4-204ENSMUST00000226833 1252 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Tuba4aP68368 Mrpl20-201ENSMUST00000030942 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Tuba4aP68368 Gm10175-201ENSMUST00000086013 645 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Tuba4aP68368 Fbxl19-202ENSMUST00000186116 3641 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Tuba4aP68368 Lsp1-203ENSMUST00000105966 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Tuba4aP68368 Gm28539-201ENSMUST00000190050 2982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Tuba4aP68368 Ntm-203ENSMUST00000115237 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Tuba4aP68368 Gm12020-201ENSMUST00000119030 2042 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Tuba4aP68368 Gm5069-201ENSMUST00000050581 1328 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Tuba4aP68368 Epha8-201ENSMUST00000030420 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Tuba4aP68368 Gm16244-201ENSMUST00000159313 2327 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Tuba4aP68368 Dgcr14-201ENSMUST00000003621 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Tuba4aP68368 Rps6ka4-202ENSMUST00000170516 3105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Tuba4aP68368 Parp16-205ENSMUST00000216702 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Tuba4aP68368 Rps6ka4-201ENSMUST00000025903 3105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Tuba4aP68368 Gm4981-201ENSMUST00000099726 1854 ntAPPRIS P1 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Tuba4aP68368 Grin1-203ENSMUST00000114308 4165 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Tuba4aP68368 Fuca2-203ENSMUST00000121465 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Tuba4aP68368 Timp3-201ENSMUST00000020234 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Tuba4aP68368 Rec8-201ENSMUST00000002395 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Tuba4aP68368 Gm18263-201ENSMUST00000220846 1928 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Tuba4aP68368 Rtkn2-203ENSMUST00000117086 2246 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Tuba4aP68368 Wwox-201ENSMUST00000004756 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Tuba4aP68368 Zfp319-201ENSMUST00000057717 7232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Tuba4aP68368 Sgtb-201ENSMUST00000044385 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Tuba4aP68368 Armc8-201ENSMUST00000035043 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Tuba4aP68368 Il34-204ENSMUST00000150680 1796 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Tuba4aP68368 Gm5939-201ENSMUST00000119613 2874 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Tuba4aP68368 Podn-201ENSMUST00000044248 2885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Tuba4aP68368 Per1-203ENSMUST00000102605 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Tuba4aP68368 Elf3-201ENSMUST00000003135 2095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Tuba4aP68368 Park7-204ENSMUST00000105675 882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Tuba4aP68368 Dnajc8-206ENSMUST00000105940 772 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Tuba4aP68368 Dlk1-203ENSMUST00000109842 1129 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Tuba4aP68368 Gm14822-201ENSMUST00000122247 291 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Tuba4aP68368 1810062O18Rik-203ENSMUST00000129237 647 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Tuba4aP68368 Gm25911-201ENSMUST00000157621 56 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Tuba4aP68368 Ccnd3-208ENSMUST00000182539 931 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Tuba4aP68368 1700030N18Rik-201ENSMUST00000202497 966 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Tuba4aP68368 Gm38948-201ENSMUST00000210035 688 ntTSL 3 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Tuba4aP68368 Thap2-203ENSMUST00000218989 527 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Tuba4aP68368 AC154572.2-201ENSMUST00000225105 997 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Tuba4aP68368 Pold4-201ENSMUST00000025773 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Tuba4aP68368 Tspo-201ENSMUST00000047419 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Tuba4aP68368 Ntng2-204ENSMUST00000102873 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Tuba4aP68368 Sp9-201ENSMUST00000090813 4514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Tuba4aP68368 Dct-201ENSMUST00000022725 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Tuba4aP68368 Pex12-207ENSMUST00000176518 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Tuba4aP68368 Plekhg2-203ENSMUST00000121085 4649 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Tuba4aP68368 Klc2-204ENSMUST00000116563 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Tuba4aP68368 Prr33-201ENSMUST00000054910 2251 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Tuba4aP68368 Rab3d-201ENSMUST00000115351 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Tuba4aP68368 Mb21d1-201ENSMUST00000034898 3231 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Tuba4aP68368 Dusp13-201ENSMUST00000075040 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Tuba4aP68368 Got1-201ENSMUST00000026196 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Tuba4aP68368 Prkce-202ENSMUST00000097275 6254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Tuba4aP68368 Mmp11-202ENSMUST00000120281 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Tuba4aP68368 Hcrtr1-202ENSMUST00000119423 2439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Tuba4aP68368 Omp-201ENSMUST00000098281 2144 ntAPPRIS P1 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Tuba4aP68368 Gm36995-201ENSMUST00000126170 5727 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Tuba4aP68368 Ralgds-202ENSMUST00000100241 3102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Tuba4aP68368 Ppp1r13l-201ENSMUST00000047621 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Tuba4aP68368 BC030867-201ENSMUST00000100392 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Tuba4aP68368 Kcnj8-202ENSMUST00000203945 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Tuba4aP68368 Olah-201ENSMUST00000027955 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Tuba4aP68368 Slc22a20-201ENSMUST00000041827 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Tuba4aP68368 Hk1-202ENSMUST00000099691 4278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Tuba4aP68368 Gm44891-201ENSMUST00000208817 2223 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Tuba4aP68368 Cacna2d2-208ENSMUST00000170737 5332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Tuba4aP68368 B230206H07Rik-202ENSMUST00000134845 3269 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Tuba4aP68368 Ptpru-203ENSMUST00000105987 5484 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Tuba4aP68368 AW822073-202ENSMUST00000204003 1959 ntAPPRIS P1 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Tuba4aP68368 Vrtn-202ENSMUST00000166772 3098 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Tuba4aP68368 Usf2-202ENSMUST00000108119 849 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Tuba4aP68368 Siva1-202ENSMUST00000109755 333 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Tuba4aP68368 Cops9-202ENSMUST00000112999 653 ntTSL 3 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Tuba4aP68368 Chchd6-202ENSMUST00000113550 1042 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Tuba4aP68368 Gm4913-201ENSMUST00000117075 1290 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Tuba4aP68368 Gm12892-201ENSMUST00000117367 1146 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Tuba4aP68368 Gm9385-201ENSMUST00000117563 472 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Tuba4aP68368 Gm16198-201ENSMUST00000118766 670 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Tuba4aP68368 Cdkn1a-203ENSMUST00000122348 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Tuba4aP68368 Gm16151-201ENSMUST00000129696 639 ntTSL 3 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Tuba4aP68368 Gm15758-201ENSMUST00000161681 695 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Tuba4aP68368 Rac3-201ENSMUST00000018156 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Tuba4aP68368 5430405H02Rik-203ENSMUST00000185402 904 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Tuba4aP68368 Gm36972-201ENSMUST00000194000 676 ntTSL 3 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Tuba4aP68368 H2-Bl-211ENSMUST00000195838 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Tuba4aP68368 CT943659.1-201ENSMUST00000215459 326 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Tuba4aP68368 Tspyl-ps-201ENSMUST00000220692 1117 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.4 ms