Protein–RNA interactions for Protein: P43117

Ptgfr, Prostaglandin F2-alpha receptor, mousemouse

Predictions only

Length 366 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtgfrP43117 Sipa1-201ENSMUST00000071857 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
PtgfrP43117 Armcx1-204ENSMUST00000113198 2085 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
PtgfrP43117 Gm14752-201ENSMUST00000120719 2075 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
PtgfrP43117 Plekhb1-201ENSMUST00000079176 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
PtgfrP43117 Exoc6b-203ENSMUST00000160197 5439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
PtgfrP43117 Qsox1-202ENSMUST00000111764 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
PtgfrP43117 Kif16bos-201ENSMUST00000124774 495 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
PtgfrP43117 AC155937.1-202ENSMUST00000156229 621 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
PtgfrP43117 Gm42560-201ENSMUST00000201216 1023 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
PtgfrP43117 AC149294.4-201ENSMUST00000227870 882 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
PtgfrP43117 Slc12a4-201ENSMUST00000034370 3811 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
PtgfrP43117 Smc6-208ENSMUST00000218866 3373 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
PtgfrP43117 Steap2-203ENSMUST00000115425 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
PtgfrP43117 Nphs2-201ENSMUST00000027896 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
PtgfrP43117 Atxn7l1-202ENSMUST00000090597 2563 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
PtgfrP43117 Dnm1-201ENSMUST00000078352 3246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
PtgfrP43117 R3hcc1-206ENSMUST00000216152 1467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
PtgfrP43117 Phactr3-203ENSMUST00000108915 2694 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
PtgfrP43117 Phactr3-204ENSMUST00000108916 2656 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
PtgfrP43117 Hspa12b-201ENSMUST00000099349 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
PtgfrP43117 Msantd3-201ENSMUST00000061135 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
PtgfrP43117 Litaf-201ENSMUST00000023143 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
PtgfrP43117 Dhx57-201ENSMUST00000038166 4918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
PtgfrP43117 Krt36-201ENSMUST00000107416 1671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
PtgfrP43117 Nup98-206ENSMUST00000211235 3748 ntTSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
PtgfrP43117 Yipf6-201ENSMUST00000054697 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
PtgfrP43117 Aatk-201ENSMUST00000064307 5336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
PtgfrP43117 Eml6-201ENSMUST00000058902 8083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
PtgfrP43117 Stau2-215ENSMUST00000162435 2735 ntTSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
PtgfrP43117 Il11ra1-203ENSMUST00000108041 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
PtgfrP43117 Gm13305-201ENSMUST00000098121 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
PtgfrP43117 Snph-201ENSMUST00000028951 4730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
PtgfrP43117 Cyp1b1-201ENSMUST00000024894 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
PtgfrP43117 Vldlr-207ENSMUST00000167487 7971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
PtgfrP43117 Krt18-201ENSMUST00000023803 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
PtgfrP43117 Fahd1-201ENSMUST00000049642 1407 ntAPPRIS P1 BASIC11.86□□□□□ -0.51
PtgfrP43117 Zfp296-201ENSMUST00000108453 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
PtgfrP43117 Gm14371-201ENSMUST00000138925 1518 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
PtgfrP43117 Sbds-201ENSMUST00000026387 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
PtgfrP43117 Tcirg1-201ENSMUST00000001801 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
PtgfrP43117 C530008M17Rik-202ENSMUST00000120639 6826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
PtgfrP43117 C530008M17Rik-211ENSMUST00000163347 6835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
PtgfrP43117 Gm13848-201ENSMUST00000130777 2047 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
PtgfrP43117 Prickle3-201ENSMUST00000033485 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
PtgfrP43117 Trim59-201ENSMUST00000107802 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
PtgfrP43117 Il1rapl2-202ENSMUST00000113063 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
PtgfrP43117 Prrt3-202ENSMUST00000204134 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
PtgfrP43117 Tmsb10-203ENSMUST00000114050 570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
PtgfrP43117 Gm5566-201ENSMUST00000116118 459 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
PtgfrP43117 Gm12264-201ENSMUST00000123949 500 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
PtgfrP43117 1700003M07Rik-202ENSMUST00000147634 564 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
PtgfrP43117 Cyb561d2-205ENSMUST00000195235 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
PtgfrP43117 Gm44719-201ENSMUST00000206404 149 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
PtgfrP43117 Stard3nl-209ENSMUST00000221380 1268 ntTSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
PtgfrP43117 Ndufc2-201ENSMUST00000032882 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
PtgfrP43117 Krtap9-3-201ENSMUST00000062683 759 ntAPPRIS P1 BASIC11.86□□□□□ -0.51
PtgfrP43117 Rxfp4-201ENSMUST00000063119 1245 ntAPPRIS P1 BASIC11.86□□□□□ -0.51
PtgfrP43117 Tspan32-206ENSMUST00000105925 1376 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
PtgfrP43117 Pld5-202ENSMUST00000111166 1370 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
PtgfrP43117 Sirt5-211ENSMUST00000223194 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
PtgfrP43117 Ak1-202ENSMUST00000113277 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
PtgfrP43117 AC154262.2-201ENSMUST00000224310 2293 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
PtgfrP43117 Kcnd3-203ENSMUST00000118360 2668 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
PtgfrP43117 Tfap2c-206ENSMUST00000170744 2776 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
PtgfrP43117 Btrc-201ENSMUST00000065601 2978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
PtgfrP43117 Syt12-201ENSMUST00000059295 3581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
PtgfrP43117 Mau2-202ENSMUST00000168013 5323 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
PtgfrP43117 Slc19a2-202ENSMUST00000159230 3432 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
PtgfrP43117 Mettl14-201ENSMUST00000029759 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
PtgfrP43117 Kdm2b-204ENSMUST00000118027 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
PtgfrP43117 Trappc2-203ENSMUST00000116495 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
PtgfrP43117 Pus1-207ENSMUST00000170468 1510 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
PtgfrP43117 Tmem37-201ENSMUST00000056089 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
PtgfrP43117 Gtf2ird1-205ENSMUST00000100654 3156 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
PtgfrP43117 Sntb1-201ENSMUST00000039769 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
PtgfrP43117 Tlk2-209ENSMUST00000145048 2776 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
PtgfrP43117 Hdac7-202ENSMUST00000088402 4223 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
PtgfrP43117 Usf1-208ENSMUST00000161241 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
PtgfrP43117 Leo1-201ENSMUST00000048937 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
PtgfrP43117 Mcm9-206ENSMUST00000220007 3513 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
PtgfrP43117 Kyat1-204ENSMUST00000113661 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
PtgfrP43117 Prrg3-203ENSMUST00000170096 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
PtgfrP43117 Pisd-202ENSMUST00000071829 1986 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
PtgfrP43117 Grtp1-206ENSMUST00000210317 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
PtgfrP43117 Dmrta1-201ENSMUST00000052478 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
PtgfrP43117 Slc25a54-201ENSMUST00000029478 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
PtgfrP43117 Nob1-201ENSMUST00000003946 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
PtgfrP43117 Plcd1-203ENSMUST00000214470 2706 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
PtgfrP43117 Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 2739 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
PtgfrP43117 Clcn4-203ENSMUST00000210061 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
PtgfrP43117 Mir449b-201ENSMUST00000104833 80 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
PtgfrP43117 Uqcrq-203ENSMUST00000109021 405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
PtgfrP43117 Zfp715-201ENSMUST00000012796 907 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
PtgfrP43117 Gm36236-201ENSMUST00000220780 701 ntTSL 3 BASIC11.85□□□□□ -0.51
PtgfrP43117 Tssk3-201ENSMUST00000000421 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
PtgfrP43117 Rarg-201ENSMUST00000043172 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
PtgfrP43117 Ldlrad3-201ENSMUST00000058790 3833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
PtgfrP43117 Polr2g-201ENSMUST00000096261 868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
PtgfrP43117 Top1mt-201ENSMUST00000000958 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
PtgfrP43117 Gtf3c5-202ENSMUST00000113889 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.7 ms