Protein–RNA interactions for Protein: P41105

Rpl28, 60S ribosomal protein L28, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 137 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpl28P41105 Klk15-201ENSMUST00000068625 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
Rpl28P41105 Rnf7-202ENSMUST00000071301 334 ntTSL 2 BASIC9.28□□□□□ -0.92
Rpl28P41105 Trib1-202ENSMUST00000118228 3081 ntTSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
Rpl28P41105 Hnrnpf-210ENSMUST00000180341 1922 ntAPPRIS P1 BASIC9.28□□□□□ -0.92
Rpl28P41105 Man1a2-201ENSMUST00000008907 7969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
Rpl28P41105 Gpc2-205ENSMUST00000161827 2586 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
Rpl28P41105 Guca1b-201ENSMUST00000024774 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
Rpl28P41105 Tnks1bp1-201ENSMUST00000048400 4799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
Rpl28P41105 Cant1-202ENSMUST00000092378 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
Rpl28P41105 Pik3cd-201ENSMUST00000038859 4905 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
Rpl28P41105 Lrriq4-201ENSMUST00000108265 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
Rpl28P41105 Gm8237-201ENSMUST00000164484 2051 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC9.28□□□□□ -0.92
Rpl28P41105 Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 2739 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
Rpl28P41105 Ptbp2-201ENSMUST00000029780 3364 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
Rpl28P41105 Tmem237-201ENSMUST00000087475 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
Rpl28P41105 Tacc3-202ENSMUST00000079534 2899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
Rpl28P41105 Fmnl2-205ENSMUST00000155586 3939 ntTSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
Rpl28P41105 Chpf2-201ENSMUST00000088295 5371 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.28□□□□□ -0.92
Rpl28P41105 Rbm47-204ENSMUST00000113726 4703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
Rpl28P41105 Galt-201ENSMUST00000084695 1595 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
Rpl28P41105 Ilvbl-212ENSMUST00000220430 2350 ntTSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
Rpl28P41105 Nrros-208ENSMUST00000143682 3577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
Rpl28P41105 Gm11611-201ENSMUST00000134289 1326 ntTSL 3 BASIC9.28□□□□□ -0.92
Rpl28P41105 Esrrb-206ENSMUST00000167891 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
Rpl28P41105 Zfp707-202ENSMUST00000109967 1703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
Rpl28P41105 Maged2-204ENSMUST00000112700 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
Rpl28P41105 Ahsg-201ENSMUST00000023583 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
Rpl28P41105 Bcas3-201ENSMUST00000074875 2814 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.27□□□□□ -0.92
Rpl28P41105 Clmp-201ENSMUST00000034522 4154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.27□□□□□ -0.92
Rpl28P41105 Micu1-204ENSMUST00000165563 2442 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.27□□□□□ -0.92
Rpl28P41105 Ahcyl2-205ENSMUST00000125911 2039 ntTSL 5 BASIC9.27□□□□□ -0.92
Rpl28P41105 Krt74-201ENSMUST00000088018 1648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.27□□□□□ -0.92
Rpl28P41105 Ubap2l-202ENSMUST00000064639 4073 ntTSL 1 (best) BASIC9.27□□□□□ -0.92
Rpl28P41105 Gm14812-201ENSMUST00000156494 1794 ntTSL 1 (best) BASIC9.27□□□□□ -0.92
Rpl28P41105 Rab3d-201ENSMUST00000115351 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.27□□□□□ -0.92
Rpl28P41105 Mettl27-203ENSMUST00000111218 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.27□□□□□ -0.93
Rpl28P41105 Ecm1-202ENSMUST00000117507 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.27□□□□□ -0.93
Rpl28P41105 Acin1-221ENSMUST00000150371 2494 ntTSL 1 (best) BASIC9.27□□□□□ -0.93
Rpl28P41105 Adprhl1-201ENSMUST00000033825 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.27□□□□□ -0.93
Rpl28P41105 Ubqln5-201ENSMUST00000053743 1915 ntAPPRIS P1 BASIC9.27□□□□□ -0.93
Rpl28P41105 Cavin1-201ENSMUST00000060792 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.27□□□□□ -0.93
Rpl28P41105 Gm43061-201ENSMUST00000198850 2241 ntBASIC9.27□□□□□ -0.93
Rpl28P41105 Ahdc1-201ENSMUST00000044521 6105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.27□□□□□ -0.93
Rpl28P41105 Mtus2-203ENSMUST00000085558 7543 ntTSL 1 (best) BASIC9.27□□□□□ -0.93
Rpl28P41105 Sema3f-204ENSMUST00000192727 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.27□□□□□ -0.93
Rpl28P41105 Scg3-201ENSMUST00000034699 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.27□□□□□ -0.93
Rpl28P41105 Tspyl3-201ENSMUST00000099194 3072 ntAPPRIS P1 BASIC9.27□□□□□ -0.93
Rpl28P41105 Arhgef1-203ENSMUST00000117419 3214 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.27□□□□□ -0.93
Rpl28P41105 Ap4b1-207ENSMUST00000200377 1823 ntTSL 5 BASIC9.27□□□□□ -0.93
Rpl28P41105 Colgalt2-201ENSMUST00000044311 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.27□□□□□ -0.93
Rpl28P41105 Otud7b-201ENSMUST00000035519 8043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.27□□□□□ -0.93
Rpl28P41105 Acox3-204ENSMUST00000114238 2825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.27□□□□□ -0.93
Rpl28P41105 Bcl2l13-201ENSMUST00000009256 6925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.27□□□□□ -0.93
Rpl28P41105 Park7-204ENSMUST00000105675 882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.27□□□□□ -0.93
Rpl28P41105 Cpt2-203ENSMUST00000106720 1015 ntTSL 2 BASIC9.27□□□□□ -0.93
Rpl28P41105 Dlk1-203ENSMUST00000109842 1129 ntTSL 1 (best) BASIC9.27□□□□□ -0.93
Rpl28P41105 Gm13830-202ENSMUST00000144202 381 ntTSL 3 BASIC9.27□□□□□ -0.93
Rpl28P41105 Gm16026-204ENSMUST00000162652 683 ntBASIC9.27□□□□□ -0.93
Rpl28P41105 Olfr1344-201ENSMUST00000168341 1061 ntAPPRIS P1 BASIC9.27□□□□□ -0.93
Rpl28P41105 Fau-202ENSMUST00000178310 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.27□□□□□ -0.93
Rpl28P41105 AC154572.2-201ENSMUST00000225105 997 ntBASIC9.27□□□□□ -0.93
Rpl28P41105 AC102291.3-201ENSMUST00000226566 405 ntBASIC9.27□□□□□ -0.93
Rpl28P41105 Khk-201ENSMUST00000031053 1257 ntTSL 5 BASIC9.27□□□□□ -0.93
Rpl28P41105 Calcb-201ENSMUST00000032902 962 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.27□□□□□ -0.93
Rpl28P41105 Nphs2-201ENSMUST00000027896 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.27□□□□□ -0.93
Rpl28P41105 Brd4-201ENSMUST00000003726 5955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.27□□□□□ -0.93
Rpl28P41105 Fam222b-201ENSMUST00000073705 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.27□□□□□ -0.93
Rpl28P41105 Inip-202ENSMUST00000107526 1438 ntTSL 1 (best) BASIC9.27□□□□□ -0.93
Rpl28P41105 Samd4-203ENSMUST00000125113 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.27□□□□□ -0.93
Rpl28P41105 Gnb1l-211ENSMUST00000167778 3569 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.27□□□□□ -0.93
Rpl28P41105 Gm26777-201ENSMUST00000181852 2573 ntTSL 1 (best) BASIC9.27□□□□□ -0.93
Rpl28P41105 Trf-201ENSMUST00000035158 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.27□□□□□ -0.93
Rpl28P41105 Otub1-201ENSMUST00000025679 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.27□□□□□ -0.93
Rpl28P41105 Pcdh8-201ENSMUST00000039568 4000 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.27□□□□□ -0.93
Rpl28P41105 Camk2b-208ENSMUST00000109812 1875 ntTSL 1 (best) BASIC9.27□□□□□ -0.93
Rpl28P41105 Slc33a1-201ENSMUST00000029402 3150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.27□□□□□ -0.93
Rpl28P41105 Pla2g4c-204ENSMUST00000167232 2154 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.27□□□□□ -0.93
Rpl28P41105 Gm26867-201ENSMUST00000180963 3615 ntTSL 1 (best) BASIC9.27□□□□□ -0.93
Rpl28P41105 Acap1-201ENSMUST00000001631 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.27□□□□□ -0.93
Rpl28P41105 Cpeb3-204ENSMUST00000126188 4224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.27□□□□□ -0.93
Rpl28P41105 Pgm5-201ENSMUST00000047666 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.27□□□□□ -0.93
Rpl28P41105 Inpp5e-205ENSMUST00000145701 4147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.27□□□□□ -0.93
Rpl28P41105 Rp2-201ENSMUST00000033372 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.27□□□□□ -0.93
Rpl28P41105 Tpi1-205ENSMUST00000172132 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.27□□□□□ -0.93
Rpl28P41105 Gm9252-201ENSMUST00000172364 1602 ntBASIC9.27□□□□□ -0.93
Rpl28P41105 Phykpl-201ENSMUST00000020625 1609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.27□□□□□ -0.93
Rpl28P41105 Ddx39b-202ENSMUST00000172549 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.27□□□□□ -0.93
Rpl28P41105 Cplx4-201ENSMUST00000025397 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.27□□□□□ -0.93
Rpl28P41105 Kyat1-204ENSMUST00000113661 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.27□□□□□ -0.93
Rpl28P41105 Chrna10-201ENSMUST00000084830 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.27□□□□□ -0.93
Rpl28P41105 Mest-202ENSMUST00000124665 2665 ntTSL 1 (best) BASIC9.27□□□□□ -0.93
Rpl28P41105 Eef1d-206ENSMUST00000109975 2842 ntTSL 5 BASIC9.27□□□□□ -0.93
Rpl28P41105 Dnpep-203ENSMUST00000185419 2833 ntTSL 1 (best) BASIC9.27□□□□□ -0.93
Rpl28P41105 Kmt5b-205ENSMUST00000113972 4159 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.27□□□□□ -0.93
Rpl28P41105 St6gal1-201ENSMUST00000023601 4506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.26□□□□□ -0.93
Rpl28P41105 Tbx4-201ENSMUST00000000096 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.26□□□□□ -0.93
Rpl28P41105 Gimap3-202ENSMUST00000204036 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.26□□□□□ -0.93
Rpl28P41105 Pfas-201ENSMUST00000021282 6373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.26□□□□□ -0.93
Rpl28P41105 Mccc2-201ENSMUST00000022148 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.26□□□□□ -0.93
Rpl28P41105 Cdx4-201ENSMUST00000033689 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.26□□□□□ -0.93
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