Protein–RNA interactions for Protein: P30285

Cdk4, Cyclin-dependent kinase 4, mousemouse

Predictions only

Length 303 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdk4P30285 Mcpt9-201ENSMUST00000095798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cdk4P30285 Pik3cd-204ENSMUST00000105690 4921 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cdk4P30285 Pcgf2-201ENSMUST00000018681 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Cdk4P30285 Ap1s2-201ENSMUST00000033734 1785 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Cdk4P30285 Ccdc85a-201ENSMUST00000042534 5332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Cdk4P30285 Snx12-202ENSMUST00000120389 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Cdk4P30285 Sarm1-201ENSMUST00000061174 4083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Cdk4P30285 Tlr9-201ENSMUST00000062241 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Cdk4P30285 Tbata-201ENSMUST00000035894 1506 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Cdk4P30285 Erg-201ENSMUST00000077773 2232 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cdk4P30285 Gngt2-201ENSMUST00000036088 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cdk4P30285 2310007B03Rik-201ENSMUST00000043718 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cdk4P30285 Gm5124-201ENSMUST00000127554 1970 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Cdk4P30285 Slc8a2-202ENSMUST00000211649 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cdk4P30285 Slpi-201ENSMUST00000109367 876 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cdk4P30285 Gm15957-201ENSMUST00000118893 974 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Cdk4P30285 Bola3-202ENSMUST00000120040 583 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
Cdk4P30285 Gm5678-201ENSMUST00000120115 939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Cdk4P30285 Gm13597-201ENSMUST00000121239 375 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Cdk4P30285 Tex30-213ENSMUST00000156392 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Cdk4P30285 Mir3113-201ENSMUST00000175478 76 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Cdk4P30285 Hddc3-206ENSMUST00000206074 565 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Cdk4P30285 Gm44719-201ENSMUST00000206404 149 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Cdk4P30285 Cyba-202ENSMUST00000212600 638 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cdk4P30285 9430038I01Rik-201ENSMUST00000068996 1126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cdk4P30285 Frzb-201ENSMUST00000028389 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cdk4P30285 Sqle-201ENSMUST00000022977 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cdk4P30285 Mael-202ENSMUST00000194057 1691 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Cdk4P30285 Chfr-202ENSMUST00000112519 3159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cdk4P30285 Gm20633-201ENSMUST00000176742 2831 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Cdk4P30285 Asl-202ENSMUST00000159619 2088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Cdk4P30285 Sfxn4-203ENSMUST00000135808 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cdk4P30285 Echdc2-201ENSMUST00000052999 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cdk4P30285 Cdc45-201ENSMUST00000000028 2143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cdk4P30285 Syne4-201ENSMUST00000054594 1355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cdk4P30285 Srms-201ENSMUST00000016498 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cdk4P30285 Sh3bp2-202ENSMUST00000101316 3031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cdk4P30285 Ppip5k2-201ENSMUST00000042509 5882 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cdk4P30285 Ube3a-216ENSMUST00000202945 3889 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cdk4P30285 1810030O07Rik-201ENSMUST00000060108 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cdk4P30285 Usf1-207ENSMUST00000160486 1878 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Cdk4P30285 2310022A10Rik-204ENSMUST00000187032 1871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cdk4P30285 Gm10044-203ENSMUST00000166813 1471 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cdk4P30285 Micu1-201ENSMUST00000020311 2336 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Cdk4P30285 Kdm6b-201ENSMUST00000094077 6654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Cdk4P30285 Cnot3-201ENSMUST00000038913 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cdk4P30285 Ulk3-201ENSMUST00000053230 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cdk4P30285 Gjb1-203ENSMUST00000119190 1585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Cdk4P30285 Hgs-201ENSMUST00000026900 2908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cdk4P30285 Map2k6-202ENSMUST00000100260 2088 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cdk4P30285 Gtf2a1l-201ENSMUST00000024970 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cdk4P30285 Scn4b-201ENSMUST00000060125 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cdk4P30285 Rcbtb2-202ENSMUST00000110952 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cdk4P30285 Tead1-201ENSMUST00000059768 9964 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cdk4P30285 Per1-201ENSMUST00000021271 4671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cdk4P30285 Hoxd3os1-202ENSMUST00000139005 1701 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cdk4P30285 Gm7049-201ENSMUST00000223520 1712 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Cdk4P30285 Zkscan14-203ENSMUST00000198959 2243 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Cdk4P30285 Rab11fip1-201ENSMUST00000033878 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cdk4P30285 Gm42878-202ENSMUST00000200170 4783 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Cdk4P30285 Lgals12-202ENSMUST00000099729 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cdk4P30285 Gm36356-201ENSMUST00000209224 2277 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cdk4P30285 Gm9951-202ENSMUST00000149618 1772 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Cdk4P30285 Rpl36-ps8-201ENSMUST00000121187 315 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Cdk4P30285 Gm29456-201ENSMUST00000189894 768 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Cdk4P30285 Rpl31-205ENSMUST00000194746 703 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cdk4P30285 Klk2-ps-201ENSMUST00000205342 571 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Cdk4P30285 AC131709.1-201ENSMUST00000224731 1180 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Cdk4P30285 AC225888.1-201ENSMUST00000227184 728 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Cdk4P30285 Slc39a8-206ENSMUST00000180196 3383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Cdk4P30285 Fer-202ENSMUST00000038080 2365 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cdk4P30285 Renbp-209ENSMUST00000155597 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Cdk4P30285 Adprhl1-201ENSMUST00000033825 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cdk4P30285 Slc12a8-202ENSMUST00000117134 2081 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cdk4P30285 Bmp4-201ENSMUST00000074077 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cdk4P30285 Egr1-201ENSMUST00000064795 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cdk4P30285 Pck2-205ENSMUST00000226352 2784 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Cdk4P30285 Aldh9a1-201ENSMUST00000028004 2835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cdk4P30285 Zyg11b-201ENSMUST00000043616 8691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cdk4P30285 R3hdm2-212ENSMUST00000166820 4281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Cdk4P30285 Klhdc4-210ENSMUST00000174717 1662 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Cdk4P30285 Rbm48-201ENSMUST00000042753 2368 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cdk4P30285 Pard3-222ENSMUST00000162536 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Cdk4P30285 Alox12e-201ENSMUST00000019051 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cdk4P30285 E230029C05Rik-205ENSMUST00000208362 2444 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Cdk4P30285 Mfsd14b-201ENSMUST00000054730 3251 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Cdk4P30285 Cenpt-201ENSMUST00000040776 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cdk4P30285 Grin1-203ENSMUST00000114308 4165 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Cdk4P30285 Plekhb1-206ENSMUST00000107047 1926 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cdk4P30285 Max-201ENSMUST00000082136 1926 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cdk4P30285 Crhr2-208ENSMUST00000212633 2041 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cdk4P30285 Lpgat1-201ENSMUST00000110855 7233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cdk4P30285 Pex11g-202ENSMUST00000111081 666 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cdk4P30285 Fis1-202ENSMUST00000111094 948 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Cdk4P30285 Tmem217-201ENSMUST00000114683 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cdk4P30285 Sgsm3-208ENSMUST00000139517 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cdk4P30285 Fau-202ENSMUST00000178310 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cdk4P30285 Gm27300-201ENSMUST00000184085 97 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Cdk4P30285 Gm27335-201ENSMUST00000184758 97 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Cdk4P30285 Hcrt-201ENSMUST00000055083 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.8 ms