Protein–RNA interactions for Protein: P28236

Gja8, Gap junction alpha-8 protein, mousemouse

Predictions only

Length 440 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gja8P28236 Mir433-201ENSMUST00000093564 124 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Gja8P28236 6430531B16Rik-201ENSMUST00000097970 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gja8P28236 Lman2l-204ENSMUST00000125304 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gja8P28236 Phldb1-212ENSMUST00000138356 5600 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gja8P28236 Lrp11-201ENSMUST00000019931 3386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gja8P28236 Luc7l3-201ENSMUST00000021226 3373 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gja8P28236 Rrp1b-201ENSMUST00000081339 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gja8P28236 Gm7324-201ENSMUST00000094051 1647 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gja8P28236 Papd7-204ENSMUST00000223344 2118 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gja8P28236 Gm11946-201ENSMUST00000123459 3941 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gja8P28236 Dhrs3-207ENSMUST00000171001 1349 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gja8P28236 Ncmap-204ENSMUST00000105859 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gja8P28236 Etv3-202ENSMUST00000119109 5309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gja8P28236 Snx29-207ENSMUST00000180792 2667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gja8P28236 Sall2-202ENSMUST00000135523 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gja8P28236 Poc1b-204ENSMUST00000159990 3449 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gja8P28236 Spo11-201ENSMUST00000050442 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gja8P28236 Sh2b3-204ENSMUST00000122426 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gja8P28236 Cep295nl-201ENSMUST00000103024 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gja8P28236 Zfr2-201ENSMUST00000117798 3349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gja8P28236 Zfp385a-201ENSMUST00000168828 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gja8P28236 Gm26840-201ENSMUST00000180784 2980 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gja8P28236 Mylk2-201ENSMUST00000028970 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gja8P28236 Ttll11-201ENSMUST00000028248 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gja8P28236 Rad51-201ENSMUST00000028795 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gja8P28236 Ccnj-202ENSMUST00000119316 3763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gja8P28236 Zbtb7b-204ENSMUST00000107435 4333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gja8P28236 Nfe2-205ENSMUST00000133600 1605 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gja8P28236 Ins2-205ENSMUST00000105933 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gja8P28236 Ins2-206ENSMUST00000105934 480 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gja8P28236 Fam110a-202ENSMUST00000109863 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gja8P28236 Gm1335-201ENSMUST00000121653 386 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Gja8P28236 Gm12347-201ENSMUST00000127883 470 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gja8P28236 4930412M03Rik-201ENSMUST00000130746 1111 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gja8P28236 Tmem205-202ENSMUST00000178988 862 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gja8P28236 Gm26728-201ENSMUST00000185268 595 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gja8P28236 Gm38000-201ENSMUST00000192390 1215 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Gja8P28236 Gm37444-201ENSMUST00000193605 439 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Gja8P28236 1700045I11Rik-201ENSMUST00000194752 493 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Gja8P28236 Gm18935-201ENSMUST00000212692 664 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Gja8P28236 AC153144.2-201ENSMUST00000221766 451 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gja8P28236 AC166997.1-201ENSMUST00000225122 572 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Gja8P28236 Cts7-204ENSMUST00000225321 1257 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Gja8P28236 Mea1-201ENSMUST00000002845 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gja8P28236 Mrap-201ENSMUST00000038197 1001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gja8P28236 Isoc2b-201ENSMUST00000064547 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gja8P28236 Klhl11-201ENSMUST00000056665 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gja8P28236 Dmkn-202ENSMUST00000054427 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gja8P28236 Hoxd3-203ENSMUST00000111983 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gja8P28236 Gatd1-201ENSMUST00000106008 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gja8P28236 Dok7-201ENSMUST00000050709 2498 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gja8P28236 Mcrs1-201ENSMUST00000041190 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gja8P28236 Esco1-203ENSMUST00000115864 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gja8P28236 Ptk7-201ENSMUST00000044442 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gja8P28236 Mapt-201ENSMUST00000100347 1362 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gja8P28236 Fam71f1-204ENSMUST00000166462 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gja8P28236 Large2-203ENSMUST00000111284 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gja8P28236 Usp51-201ENSMUST00000095755 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gja8P28236 Dao-203ENSMUST00000161610 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gja8P28236 Col2a1-202ENSMUST00000088355 4862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gja8P28236 Gtf2ird1-208ENSMUST00000167084 3283 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gja8P28236 Kdf1-203ENSMUST00000121797 2256 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gja8P28236 Ppef2-201ENSMUST00000031359 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gja8P28236 Knop1-203ENSMUST00000106549 1467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gja8P28236 Gm12485-201ENSMUST00000119641 291 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Gja8P28236 Gm42791-202ENSMUST00000147473 727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gja8P28236 Gm16315-201ENSMUST00000163009 783 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gja8P28236 Gm27772-201ENSMUST00000184900 187 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Gja8P28236 Tm2d2-202ENSMUST00000210536 727 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gja8P28236 Gm45418-202ENSMUST00000210693 649 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gja8P28236 Gm11149-204ENSMUST00000216483 1275 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gja8P28236 Gm9368-201ENSMUST00000219348 831 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Gja8P28236 AC155237.1-201ENSMUST00000226196 1279 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Gja8P28236 Gng8-201ENSMUST00000078182 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gja8P28236 Tldc2-201ENSMUST00000099140 608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gja8P28236 Tsc2-217ENSMUST00000227745 5598 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gja8P28236 H13-202ENSMUST00000089059 1743 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gja8P28236 Hps5-201ENSMUST00000014562 4953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gja8P28236 Amz2-202ENSMUST00000092500 2816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gja8P28236 Grin3a-201ENSMUST00000076674 7431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gja8P28236 Sptlc1-201ENSMUST00000021920 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gja8P28236 Slc4a4-207ENSMUST00000148750 7931 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gja8P28236 Arid3a-202ENSMUST00000105376 4892 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gja8P28236 Tbc1d4-209ENSMUST00000161991 6483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gja8P28236 Kctd3-201ENSMUST00000085678 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gja8P28236 Miip-202ENSMUST00000119975 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gja8P28236 4933435G04Rik-201ENSMUST00000205892 2108 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Gja8P28236 Fgd1-201ENSMUST00000026296 4001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gja8P28236 Sapcd2-201ENSMUST00000028329 3121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gja8P28236 Fbxo41-203ENSMUST00000161546 6357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gja8P28236 Rph3al-203ENSMUST00000108420 695 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gja8P28236 Gm12216-202ENSMUST00000120776 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gja8P28236 Gm13385-201ENSMUST00000121089 220 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Gja8P28236 Tpt1-ps6-201ENSMUST00000121768 523 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Gja8P28236 Rpl27a-203ENSMUST00000143107 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gja8P28236 Cryaa-201ENSMUST00000019192 1176 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gja8P28236 Gm44127-201ENSMUST00000203565 291 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gja8P28236 Rad18-201ENSMUST00000068487 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gja8P28236 Mindy1-212ENSMUST00000168223 1812 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gja8P28236 Gatm-201ENSMUST00000028624 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.4 ms