Protein–RNA interactions for Protein: P19253

Rpl13a, 60S ribosomal protein L13a, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 203 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpl13aP19253 Kcna5-201ENSMUST00000060972 2862 ntAPPRIS P1 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Rpl13aP19253 Gcat-201ENSMUST00000006544 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Rpl13aP19253 Runx1-202ENSMUST00000113956 4738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Rpl13aP19253 Pcdhga9-201ENSMUST00000091935 4724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Rpl13aP19253 Tpm3-201ENSMUST00000029549 2230 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Rpl13aP19253 Sept8-207ENSMUST00000147912 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Rpl13aP19253 Rasa3-201ENSMUST00000117551 4404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Rpl13aP19253 Fgfr3-209ENSMUST00000164207 4150 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Rpl13aP19253 Ptgfr-201ENSMUST00000029670 6624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Rpl13aP19253 Raet1e-204ENSMUST00000181645 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Rpl13aP19253 Iqcd-201ENSMUST00000069259 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Rpl13aP19253 Sfxn4-203ENSMUST00000135808 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Rpl13aP19253 Phb2-201ENSMUST00000004375 1318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Rpl13aP19253 Slc35c2-203ENSMUST00000109299 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Rpl13aP19253 Slc25a18-201ENSMUST00000112682 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Rpl13aP19253 Fam161a-205ENSMUST00000172602 1935 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Rpl13aP19253 Gins3-201ENSMUST00000034094 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Rpl13aP19253 Smarca2-209ENSMUST00000176030 5862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Rpl13aP19253 Acaa1b-201ENSMUST00000010795 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Rpl13aP19253 AC127597.1-201ENSMUST00000225697 5711 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
Rpl13aP19253 Clec11a-201ENSMUST00000004587 2978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Rpl13aP19253 Pax2-201ENSMUST00000004340 3095 ntTSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Rpl13aP19253 Col6a6-203ENSMUST00000166431 7098 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Rpl13aP19253 Tdrd9-201ENSMUST00000079009 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Rpl13aP19253 Gm26675-201ENSMUST00000181068 1525 ntTSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Rpl13aP19253 Osbpl1a-201ENSMUST00000074352 3956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Rpl13aP19253 Hdac11-201ENSMUST00000041736 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Rpl13aP19253 Dhrs3-206ENSMUST00000154208 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Rpl13aP19253 Sfxn5-203ENSMUST00000113787 638 ntTSL 2 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Rpl13aP19253 Evx1-202ENSMUST00000129243 1034 ntTSL 3 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Rpl13aP19253 2200002J24Rik-201ENSMUST00000013227 333 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Rpl13aP19253 Dbi-207ENSMUST00000151708 491 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Rpl13aP19253 Dpf3-205ENSMUST00000177801 1092 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Rpl13aP19253 Gm43332-201ENSMUST00000202511 1044 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
Rpl13aP19253 Gm32050-201ENSMUST00000209793 638 ntTSL 3 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Rpl13aP19253 Ndufaf2-202ENSMUST00000223734 556 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
Rpl13aP19253 AC151836.1-202ENSMUST00000226259 753 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
Rpl13aP19253 Mrpl54-201ENSMUST00000046114 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Rpl13aP19253 Tnp2-201ENSMUST00000051297 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Rpl13aP19253 Ly6k-201ENSMUST00000060301 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Rpl13aP19253 Hist1h2bg-201ENSMUST00000079251 618 ntAPPRIS P1 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Rpl13aP19253 Hist1h2bn-201ENSMUST00000091709 381 ntAPPRIS P1 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Rpl13aP19253 Slc52a3-202ENSMUST00000109858 2094 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Rpl13aP19253 Dmkn-205ENSMUST00000165887 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Rpl13aP19253 Zfp710-202ENSMUST00000164056 5871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Rpl13aP19253 Sema6d-207ENSMUST00000103240 4372 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Rpl13aP19253 AC131586.3-201ENSMUST00000228355 1367 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
Rpl13aP19253 Gas7-201ENSMUST00000041611 2968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Rpl13aP19253 Lims1-202ENSMUST00000020078 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Rpl13aP19253 Peg10-202ENSMUST00000176204 6667 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Rpl13aP19253 Gm11405-201ENSMUST00000118689 1556 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
Rpl13aP19253 Wsb1-201ENSMUST00000017821 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Rpl13aP19253 Itpk1-201ENSMUST00000046518 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Rpl13aP19253 Aspm-201ENSMUST00000053364 9867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Rpl13aP19253 Irf6-201ENSMUST00000076521 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Rpl13aP19253 Ctnnd1-204ENSMUST00000099941 5783 ntTSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Rpl13aP19253 Clcn4-203ENSMUST00000210061 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Rpl13aP19253 Gm12626-201ENSMUST00000117339 1983 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
Rpl13aP19253 Gm12623-201ENSMUST00000119849 1983 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
Rpl13aP19253 Chrna3-201ENSMUST00000034851 4358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Rpl13aP19253 Mbp-204ENSMUST00000080658 2063 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Rpl13aP19253 Tardbp-206ENSMUST00000105702 6425 ntTSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Rpl13aP19253 Nckipsd-201ENSMUST00000035218 3360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Rpl13aP19253 Gm12503-201ENSMUST00000146576 3127 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Rpl13aP19253 Clcnkb-202ENSMUST00000105788 2490 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Rpl13aP19253 Med13l-201ENSMUST00000100816 9296 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Rpl13aP19253 Fam192a-201ENSMUST00000034226 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Rpl13aP19253 Gdap1l1-203ENSMUST00000109421 1206 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Rpl13aP19253 Josd2-202ENSMUST00000117324 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Rpl13aP19253 Gm11185-201ENSMUST00000117732 1007 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
Rpl13aP19253 Gm11594-201ENSMUST00000122313 162 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
Rpl13aP19253 Slc38a6-204ENSMUST00000126488 589 ntTSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Rpl13aP19253 Caly-202ENSMUST00000166758 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Rpl13aP19253 Scamp5-203ENSMUST00000214256 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Rpl13aP19253 CT943659.1-201ENSMUST00000215459 326 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
Rpl13aP19253 Ldlrad3-201ENSMUST00000058790 3833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Rpl13aP19253 Pecr-202ENSMUST00000097698 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Rpl13aP19253 Pofut1-201ENSMUST00000049863 5600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Rpl13aP19253 Arhgap10-201ENSMUST00000076316 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Rpl13aP19253 Rbm22-201ENSMUST00000025506 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Rpl13aP19253 Lancl1-203ENSMUST00000119559 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Rpl13aP19253 Cabp1-201ENSMUST00000031519 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Rpl13aP19253 Esr2-201ENSMUST00000076634 3288 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Rpl13aP19253 Rhox9-202ENSMUST00000170643 2422 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Rpl13aP19253 Pdlim5-212ENSMUST00000200043 1581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Rpl13aP19253 Mettl14-201ENSMUST00000029759 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Rpl13aP19253 Bahcc1-203ENSMUST00000122148 10712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Rpl13aP19253 Setdb1-201ENSMUST00000015841 4658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Rpl13aP19253 Esm1-201ENSMUST00000038144 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Rpl13aP19253 Snrpn-202ENSMUST00000098402 2076 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Rpl13aP19253 Ptpru-201ENSMUST00000030741 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Rpl13aP19253 Fam83h-201ENSMUST00000060807 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Rpl13aP19253 Oxr1-203ENSMUST00000090096 4515 ntTSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Rpl13aP19253 Dusp6-201ENSMUST00000020118 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Rpl13aP19253 Reep5-201ENSMUST00000006027 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Rpl13aP19253 Rnase10-202ENSMUST00000164632 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Rpl13aP19253 Prr15-201ENSMUST00000059138 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Rpl13aP19253 Rasl12-202ENSMUST00000165682 1903 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Rpl13aP19253 Olfr742-202ENSMUST00000213935 2117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Rpl13aP19253 Hp1bp3-202ENSMUST00000097836 3113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.2 ms