Protein–RNA interactions for Protein: P19228

Csn1s1, Alpha-S1-casein, mousemouse

Predictions only

Length 313 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Csn1s1P19228 Disp2-202ENSMUST00000063975 1505 ntTSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Csn1s1P19228 Dmbt1-202ENSMUST00000208311 6272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Csn1s1P19228 Tmem206-201ENSMUST00000027940 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Csn1s1P19228 Kif1a-202ENSMUST00000112958 5931 ntTSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Csn1s1P19228 Plekhb1-207ENSMUST00000116287 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC12.41□□□□□ -0.42
Csn1s1P19228 Ecm1-202ENSMUST00000117507 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Csn1s1P19228 Gsdmcl2-203ENSMUST00000185431 1911 ntBASIC12.41□□□□□ -0.42
Csn1s1P19228 Otx1-201ENSMUST00000006071 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Csn1s1P19228 Gm45053-201ENSMUST00000206112 2499 ntBASIC12.4□□□□□ -0.42
Csn1s1P19228 Rnase10-201ENSMUST00000022424 1629 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Csn1s1P19228 Dnmt3a-205ENSMUST00000172689 2328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Csn1s1P19228 Scamp3-203ENSMUST00000120697 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Csn1s1P19228 B3gnt8-201ENSMUST00000076034 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Csn1s1P19228 Spock1-206ENSMUST00000189373 3128 ntTSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Csn1s1P19228 Sorcs1-201ENSMUST00000072685 4396 ntTSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Csn1s1P19228 Samd4-203ENSMUST00000125113 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Csn1s1P19228 Maged2-204ENSMUST00000112700 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Csn1s1P19228 Mip-201ENSMUST00000026455 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Csn1s1P19228 Gm26688-201ENSMUST00000181176 1568 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Csn1s1P19228 Dph5-204ENSMUST00000189799 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Csn1s1P19228 Gm8096-201ENSMUST00000209921 1591 ntBASIC12.4□□□□□ -0.42
Csn1s1P19228 Mcf2l-203ENSMUST00000110866 5108 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Csn1s1P19228 Gapdh-203ENSMUST00000118875 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Csn1s1P19228 Penk-201ENSMUST00000070375 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Csn1s1P19228 Prss44-201ENSMUST00000098345 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Csn1s1P19228 Erg-201ENSMUST00000077773 2232 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Csn1s1P19228 Hist1h2bj-201ENSMUST00000110452 463 ntAPPRIS P1 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Csn1s1P19228 Hist1h2bp-202ENSMUST00000110473 621 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Csn1s1P19228 Mis18bp1-202ENSMUST00000124201 717 ntTSL 3 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Csn1s1P19228 Gm29518-201ENSMUST00000190858 372 ntBASIC12.4□□□□□ -0.42
Csn1s1P19228 Vsig2-201ENSMUST00000002008 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Csn1s1P19228 Csrp2-207ENSMUST00000220409 780 ntTSL 2 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Csn1s1P19228 Hist1h2bm-201ENSMUST00000224651 524 ntAPPRIS P1 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Csn1s1P19228 Tctex1d4-201ENSMUST00000062206 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Csn1s1P19228 Sult2b1-201ENSMUST00000075571 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Csn1s1P19228 Hhipl2-202ENSMUST00000192527 2310 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Csn1s1P19228 Spsb1-203ENSMUST00000105685 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Csn1s1P19228 Tnfsf13-202ENSMUST00000108648 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Csn1s1P19228 AI314180-202ENSMUST00000102889 7045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Csn1s1P19228 Oxr1-203ENSMUST00000090096 4515 ntTSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Csn1s1P19228 Tcirg1-201ENSMUST00000001801 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Csn1s1P19228 Clcn6-201ENSMUST00000030879 3306 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Csn1s1P19228 Bdnf-205ENSMUST00000111045 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Csn1s1P19228 F830212C03Rik-201ENSMUST00000191701 2285 ntBASIC12.4□□□□□ -0.42
Csn1s1P19228 Gm5422-202ENSMUST00000216161 2928 ntTSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Csn1s1P19228 Krt74-201ENSMUST00000088018 1648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Csn1s1P19228 Tppp-201ENSMUST00000022057 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.43
Csn1s1P19228 B230206H07Rik-202ENSMUST00000134845 3269 ntTSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.43
Csn1s1P19228 Rasa3-201ENSMUST00000117551 4404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.43
Csn1s1P19228 Egr2-202ENSMUST00000105438 2864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.43
Csn1s1P19228 Hdac5-201ENSMUST00000008999 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.43
Csn1s1P19228 Psmd2-201ENSMUST00000007212 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Csn1s1P19228 Lgr5-201ENSMUST00000020350 4714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Csn1s1P19228 Gm36745-201ENSMUST00000213455 1594 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Csn1s1P19228 Kyat1-204ENSMUST00000113661 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Csn1s1P19228 Togaram2-205ENSMUST00000153445 3302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Csn1s1P19228 Adra1b-201ENSMUST00000067258 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Csn1s1P19228 Pus7-201ENSMUST00000119946 3407 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Csn1s1P19228 Tmem178b-201ENSMUST00000061740 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Csn1s1P19228 Pcdh15-238ENSMUST00000193739 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Csn1s1P19228 Klf4-201ENSMUST00000107619 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Csn1s1P19228 D130052B06Rik-201ENSMUST00000101371 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Csn1s1P19228 Tcf21-202ENSMUST00000218002 1788 ntBASIC12.39□□□□□ -0.43
Csn1s1P19228 Itgb4-204ENSMUST00000106460 5919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Csn1s1P19228 Tsku-202ENSMUST00000164726 2620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Csn1s1P19228 Car7-201ENSMUST00000056051 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Csn1s1P19228 Dcaf11-204ENSMUST00000121622 2379 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Csn1s1P19228 Cd82-204ENSMUST00000111257 1003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Csn1s1P19228 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Csn1s1P19228 A930006K02Rik-201ENSMUST00000149172 776 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Csn1s1P19228 Gm5253-201ENSMUST00000187104 1025 ntBASIC12.39□□□□□ -0.43
Csn1s1P19228 A430033K04Rik-204ENSMUST00000200521 1110 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Csn1s1P19228 Gm15406-202ENSMUST00000202229 767 ntTSL 2 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Csn1s1P19228 Stx3-208ENSMUST00000211641 1018 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Csn1s1P19228 AC131690.1-201ENSMUST00000218406 374 ntBASIC12.39□□□□□ -0.43
Csn1s1P19228 Gchfr-201ENSMUST00000057454 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Csn1s1P19228 Gnb4-205ENSMUST00000155737 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Csn1s1P19228 Efr3a-205ENSMUST00000173858 2848 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Csn1s1P19228 Ercc1-201ENSMUST00000003645 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Csn1s1P19228 AF529169-201ENSMUST00000044491 7202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Csn1s1P19228 Zbtb7b-201ENSMUST00000029677 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Csn1s1P19228 Foxd4-201ENSMUST00000058600 2345 ntAPPRIS P1 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Csn1s1P19228 Cnih4-204ENSMUST00000134115 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Csn1s1P19228 Ubr7-201ENSMUST00000046404 3261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Csn1s1P19228 Slco4a1-202ENSMUST00000038259 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Csn1s1P19228 Apbb1-212ENSMUST00000189072 2085 ntTSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Csn1s1P19228 Zfp707-201ENSMUST00000109966 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Csn1s1P19228 Arhgap4-203ENSMUST00000114405 6299 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Csn1s1P19228 4933434M16Rik-202ENSMUST00000153429 1940 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Csn1s1P19228 Shroom1-201ENSMUST00000018531 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Csn1s1P19228 Olfr1411-203ENSMUST00000216444 1901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Csn1s1P19228 Gm12020-201ENSMUST00000119030 2042 ntBASIC12.38□□□□□ -0.43
Csn1s1P19228 Marveld3-201ENSMUST00000001722 1330 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Csn1s1P19228 Auh-201ENSMUST00000021913 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Csn1s1P19228 Klhl26-203ENSMUST00000209415 2919 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Csn1s1P19228 Chrna3-201ENSMUST00000034851 4358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Csn1s1P19228 Slc22a20-201ENSMUST00000041827 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Csn1s1P19228 Gm4981-201ENSMUST00000099726 1854 ntAPPRIS P1 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Csn1s1P19228 Gm9920-204ENSMUST00000148544 2752 ntTSL 2 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Csn1s1P19228 Nfic-207ENSMUST00000221817 1531 ntTSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.5 ms