Protein–RNA interactions for Protein: P13372

Vpreb1, Immunoglobulin iota chain, mousemouse

Predictions only

Length 142 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vpreb1P13372 Atp5o-201ENSMUST00000023677 838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.93□□□□□ -0.98
Vpreb1P13372 Cort-201ENSMUST00000030815 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.93□□□□□ -0.98
Vpreb1P13372 Apopt1-201ENSMUST00000040519 1065 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.93□□□□□ -0.98
Vpreb1P13372 Gchfr-201ENSMUST00000057454 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.93□□□□□ -0.98
Vpreb1P13372 Rhox6-201ENSMUST00000006362 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.93□□□□□ -0.98
Vpreb1P13372 Nr1i3-203ENSMUST00000111328 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.93□□□□□ -0.98
Vpreb1P13372 Flot1-209ENSMUST00000174080 1383 ntTSL 5 BASIC8.93□□□□□ -0.98
Vpreb1P13372 Gm26547-201ENSMUST00000181186 1508 ntTSL 1 (best) BASIC8.93□□□□□ -0.98
Vpreb1P13372 Car7-201ENSMUST00000056051 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.93□□□□□ -0.98
Vpreb1P13372 4933434E20Rik-203ENSMUST00000068798 1500 ntTSL 5 BASIC8.93□□□□□ -0.98
Vpreb1P13372 Ece1-201ENSMUST00000102518 4816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.93□□□□□ -0.98
Vpreb1P13372 Urgcp-202ENSMUST00000093362 5089 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC8.93□□□□□ -0.98
Vpreb1P13372 Ccdc85a-202ENSMUST00000093253 5431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.93□□□□□ -0.98
Vpreb1P13372 Kif1a-202ENSMUST00000112958 5931 ntTSL 1 (best) BASIC8.93□□□□□ -0.98
Vpreb1P13372 4930579G24Rik-201ENSMUST00000029388 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.93□□□□□ -0.98
Vpreb1P13372 Extl3-201ENSMUST00000022550 5977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.93□□□□□ -0.98
Vpreb1P13372 AC154404.1-201ENSMUST00000223601 2077 ntBASIC8.93□□□□□ -0.98
Vpreb1P13372 Gm15567-201ENSMUST00000148699 2130 ntTSL 1 (best) BASIC8.93□□□□□ -0.98
Vpreb1P13372 Esrrb-202ENSMUST00000110203 2363 ntTSL 1 (best) BASIC8.93□□□□□ -0.98
Vpreb1P13372 Clcn4-203ENSMUST00000210061 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.93□□□□□ -0.98
Vpreb1P13372 Zfp385b-203ENSMUST00000111830 2642 ntTSL 1 (best) BASIC8.93□□□□□ -0.98
Vpreb1P13372 Stau1-201ENSMUST00000049412 2840 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.93□□□□□ -0.98
Vpreb1P13372 Pnkd-201ENSMUST00000027370 2937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.93□□□□□ -0.98
Vpreb1P13372 Srr-202ENSMUST00000108447 3138 ntTSL 5 BASIC8.93□□□□□ -0.98
Vpreb1P13372 Tram1l1-201ENSMUST00000058994 3889 ntAPPRIS P1 BASIC8.93□□□□□ -0.98
Vpreb1P13372 Sugp2-201ENSMUST00000093458 3874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.93□□□□□ -0.98
Vpreb1P13372 Rhbdd2-201ENSMUST00000043707 4207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.93□□□□□ -0.98
Vpreb1P13372 Txlna-202ENSMUST00000084264 4847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.93□□□□□ -0.98
Vpreb1P13372 Creb3l2-201ENSMUST00000041093 7082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.93□□□□□ -0.98
Vpreb1P13372 Ylpm1-202ENSMUST00000101202 4605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.92□□□□□ -0.98
Vpreb1P13372 Npr1-201ENSMUST00000029540 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.92□□□□□ -0.98
Vpreb1P13372 Keap1-202ENSMUST00000164812 3614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.92□□□□□ -0.98
Vpreb1P13372 Tacc3-202ENSMUST00000079534 2899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.92□□□□□ -0.98
Vpreb1P13372 Bcas3-201ENSMUST00000074875 2814 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC8.92□□□□□ -0.98
Vpreb1P13372 Traf1-202ENSMUST00000113064 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.92□□□□□ -0.98
Vpreb1P13372 Dhrs3-206ENSMUST00000154208 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.92□□□□□ -0.98
Vpreb1P13372 Kctd14-206ENSMUST00000206658 2339 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC8.92□□□□□ -0.98
Vpreb1P13372 Kcnj8-201ENSMUST00000032374 2269 ntTSL 1 (best) BASIC8.92□□□□□ -0.98
Vpreb1P13372 Tars2-204ENSMUST00000163530 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.92□□□□□ -0.98
Vpreb1P13372 Narfl-204ENSMUST00000134108 2062 ntTSL 1 (best) BASIC8.92□□□□□ -0.98
Vpreb1P13372 5930412G12Rik-203ENSMUST00000134673 2087 ntTSL 1 (best) BASIC8.92□□□□□ -0.98
Vpreb1P13372 Dcaf17-202ENSMUST00000102701 1703 ntTSL 1 (best) BASIC8.92□□□□□ -0.98
Vpreb1P13372 Synpo-209ENSMUST00000143275 5040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.92□□□□□ -0.98
Vpreb1P13372 AC130669.1-201ENSMUST00000228537 1672 ntBASIC8.92□□□□□ -0.98
Vpreb1P13372 2310011J03Rik-201ENSMUST00000020341 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.92□□□□□ -0.98
Vpreb1P13372 Nrip2-202ENSMUST00000120405 1468 ntTSL 2 BASIC8.92□□□□□ -0.98
Vpreb1P13372 1700022A21Rik-202ENSMUST00000182910 1448 ntTSL 1 (best) BASIC8.92□□□□□ -0.98
Vpreb1P13372 Ccdc24-201ENSMUST00000106422 1365 ntTSL 1 (best) BASIC8.92□□□□□ -0.98
Vpreb1P13372 Snupn-201ENSMUST00000068856 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.92□□□□□ -0.98
Vpreb1P13372 Lrrc25-201ENSMUST00000052437 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.92□□□□□ -0.98
Vpreb1P13372 Col6a2-201ENSMUST00000001181 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.92□□□□□ -0.98
Vpreb1P13372 Park7-203ENSMUST00000105674 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.92□□□□□ -0.98
Vpreb1P13372 Nme1-202ENSMUST00000107844 452 ntTSL 3 BASIC8.92□□□□□ -0.98
Vpreb1P13372 Gm4189-202ENSMUST00000174167 367 ntTSL 3 BASIC8.92□□□□□ -0.98
Vpreb1P13372 Rps13-ps1-201ENSMUST00000183478 538 ntBASIC8.92□□□□□ -0.98
Vpreb1P13372 Gm37153-201ENSMUST00000193637 231 ntBASIC8.92□□□□□ -0.98
Vpreb1P13372 Gm9449-201ENSMUST00000207265 1011 ntBASIC8.92□□□□□ -0.98
Vpreb1P13372 Gm32031-203ENSMUST00000208993 649 ntTSL 2 BASIC8.92□□□□□ -0.98
Vpreb1P13372 Saa2-203ENSMUST00000210769 652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.92□□□□□ -0.98
Vpreb1P13372 Gm10060-201ENSMUST00000212002 111 ntBASIC8.92□□□□□ -0.98
Vpreb1P13372 Lrr1-203ENSMUST00000222520 767 ntTSL 1 (best) BASIC8.92□□□□□ -0.98
Vpreb1P13372 Prm1-201ENSMUST00000023144 469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.92□□□□□ -0.98
Vpreb1P13372 Saa2-201ENSMUST00000075982 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.92□□□□□ -0.98
Vpreb1P13372 Dgcr6-202ENSMUST00000076757 894 ntTSL 5 BASIC8.92□□□□□ -0.98
Vpreb1P13372 Steap2-201ENSMUST00000015797 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.92□□□□□ -0.98
Vpreb1P13372 Begain-204ENSMUST00000209829 3272 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.92□□□□□ -0.98
Vpreb1P13372 Msh2-201ENSMUST00000024967 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.92□□□□□ -0.98
Vpreb1P13372 Ubr7-201ENSMUST00000046404 3261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.92□□□□□ -0.98
Vpreb1P13372 Atg16l1-202ENSMUST00000113186 3004 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC8.92□□□□□ -0.98
Vpreb1P13372 Bmp3-202ENSMUST00000197143 2739 ntTSL 2 BASIC8.92□□□□□ -0.98
Vpreb1P13372 BC024139-201ENSMUST00000054022 2623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.92□□□□□ -0.98
Vpreb1P13372 Pcnt-201ENSMUST00000001179 9331 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC8.92□□□□□ -0.98
Vpreb1P13372 Tiparp-201ENSMUST00000047906 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.92□□□□□ -0.98
Vpreb1P13372 Sgk1-203ENSMUST00000100036 2476 ntTSL 5 BASIC8.92□□□□□ -0.98
Vpreb1P13372 Sgk1-201ENSMUST00000020145 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.92□□□□□ -0.98
Vpreb1P13372 Osm-201ENSMUST00000075221 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.92□□□□□ -0.98
Vpreb1P13372 Slc39a3-201ENSMUST00000059551 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.92□□□□□ -0.98
Vpreb1P13372 Trem1-202ENSMUST00000113251 2077 ntTSL 1 (best) BASIC8.92□□□□□ -0.98
Vpreb1P13372 R3hcc1-202ENSMUST00000121142 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.92□□□□□ -0.98
Vpreb1P13372 Pnpla6-212ENSMUST00000208002 4444 ntTSL 1 (best) BASIC8.91□□□□□ -0.98
Vpreb1P13372 Asic3-201ENSMUST00000049346 1853 ntTSL 1 (best) BASIC8.91□□□□□ -0.98
Vpreb1P13372 Anks1b-221ENSMUST00000182786 3042 ntTSL 5 BASIC8.91□□□□□ -0.98
Vpreb1P13372 Slco4a1-202ENSMUST00000038259 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.91□□□□□ -0.98
Vpreb1P13372 Rbm4b-201ENSMUST00000036744 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.91□□□□□ -0.98
Vpreb1P13372 Tex44-201ENSMUST00000046004 1724 ntAPPRIS P1 BASIC8.91□□□□□ -0.98
Vpreb1P13372 Emilin2-201ENSMUST00000024849 3910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.91□□□□□ -0.98
Vpreb1P13372 Gjb1-201ENSMUST00000052130 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.91□□□□□ -0.98
Vpreb1P13372 Tspan32-204ENSMUST00000105923 1499 ntTSL 1 (best) BASIC8.91□□□□□ -0.98
Vpreb1P13372 Gm11992-201ENSMUST00000043285 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.91□□□□□ -0.98
Vpreb1P13372 Tat-201ENSMUST00000001720 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.91□□□□□ -0.98
Vpreb1P13372 Sdf4-201ENSMUST00000050078 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.91□□□□□ -0.98
Vpreb1P13372 Vmn2r-ps25-201ENSMUST00000202322 2321 ntBASIC8.91□□□□□ -0.98
Vpreb1P13372 Kcng1-201ENSMUST00000099069 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.91□□□□□ -0.98
Vpreb1P13372 Col6a6-202ENSMUST00000098441 8781 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC8.91□□□□□ -0.98
Vpreb1P13372 Thap1-201ENSMUST00000036807 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.91□□□□□ -0.98
Vpreb1P13372 Pik3cd-201ENSMUST00000038859 4905 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC8.91□□□□□ -0.98
Vpreb1P13372 Nat8f3-202ENSMUST00000168531 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.91□□□□□ -0.98
Vpreb1P13372 Marveld3-201ENSMUST00000001722 1330 ntTSL 1 (best) BASIC8.91□□□□□ -0.98
Vpreb1P13372 B4galt1-201ENSMUST00000030121 3983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.91□□□□□ -0.98
Vpreb1P13372 Gm25990-201ENSMUST00000102440 86 ntBASIC8.91□□□□□ -0.98
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.5 ms