Protein–RNA interactions for Protein: P09024

Hoxb7, Homeobox protein Hox-B7, mousemouse

Predictions only

Length 217 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxb7P09024 Gm8399-201ENSMUST00000082300 1117 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
Hoxb7P09024 Pin1rt1-201ENSMUST00000099659 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Hoxb7P09024 Arhgap10-201ENSMUST00000076316 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Hoxb7P09024 Ror1-201ENSMUST00000039630 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Hoxb7P09024 Map6-203ENSMUST00000122101 3233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Hoxb7P09024 Wrap53-201ENSMUST00000048139 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Hoxb7P09024 Xlr-202ENSMUST00000067782 1860 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Hoxb7P09024 Psmc3-203ENSMUST00000111441 1419 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Hoxb7P09024 Dcp1b-202ENSMUST00000112777 3313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Hoxb7P09024 Atp2a2-202ENSMUST00000177974 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Hoxb7P09024 Wasf2-201ENSMUST00000084241 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Hoxb7P09024 Lgr6-201ENSMUST00000044828 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Hoxb7P09024 Fam76b-201ENSMUST00000059579 3702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Hoxb7P09024 Rundc1-201ENSMUST00000040561 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Hoxb7P09024 Sf3a1-201ENSMUST00000002198 4920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Hoxb7P09024 Pgd-201ENSMUST00000084124 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Hoxb7P09024 Hnrnpc-211ENSMUST00000228748 1691 ntAPPRIS P5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Hoxb7P09024 Bicd2-201ENSMUST00000048544 6309 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Hoxb7P09024 Olfr533-203ENSMUST00000215308 2345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Hoxb7P09024 Slc12a5-201ENSMUST00000099092 6028 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Hoxb7P09024 Tex13c2-201ENSMUST00000197237 1834 ntAPPRIS P1 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Hoxb7P09024 2010300F17Rik-202ENSMUST00000181758 2493 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Hoxb7P09024 Mad2l1bp-201ENSMUST00000171172 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Hoxb7P09024 Gm5741-201ENSMUST00000177563 328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Hoxb7P09024 Zfp709-202ENSMUST00000188374 717 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Hoxb7P09024 Gm45233-201ENSMUST00000203633 898 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Hoxb7P09024 Sit1-201ENSMUST00000030180 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Hoxb7P09024 Nkiras2-202ENSMUST00000051947 831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Hoxb7P09024 Cyth2-208ENSMUST00000211783 1983 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Hoxb7P09024 Pnoc-202ENSMUST00000224594 1388 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Hoxb7P09024 Wfdc1-201ENSMUST00000024107 1371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Hoxb7P09024 Poli-202ENSMUST00000121674 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Hoxb7P09024 Gpr146-201ENSMUST00000051293 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Hoxb7P09024 Gm37736-201ENSMUST00000193564 2802 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Hoxb7P09024 Alas1-201ENSMUST00000074082 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Hoxb7P09024 9130019P16Rik-202ENSMUST00000145111 4486 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Hoxb7P09024 Afg3l2-201ENSMUST00000025408 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Hoxb7P09024 Msx3-201ENSMUST00000055353 2356 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Hoxb7P09024 Zfp879-201ENSMUST00000049625 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Hoxb7P09024 Hnrnpa2b1-204ENSMUST00000203220 1638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Hoxb7P09024 Tfdp2-201ENSMUST00000034982 7354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Hoxb7P09024 Slc6a4-202ENSMUST00000108402 2796 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Hoxb7P09024 Gpsm1-204ENSMUST00000114134 2043 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Hoxb7P09024 Mmp14-206ENSMUST00000225641 3238 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Hoxb7P09024 Rtf1-201ENSMUST00000028767 4664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Hoxb7P09024 Prickle3-203ENSMUST00000129662 2376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Hoxb7P09024 Nupl1-207ENSMUST00000225311 2475 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Hoxb7P09024 Tdrd5-201ENSMUST00000121146 3759 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Hoxb7P09024 Rpl38-204ENSMUST00000106602 371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Hoxb7P09024 Gm6447-201ENSMUST00000118905 835 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Hoxb7P09024 Prss41-202ENSMUST00000122936 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Hoxb7P09024 Borcs5-202ENSMUST00000166591 792 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Hoxb7P09024 Gm3893-201ENSMUST00000178882 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Hoxb7P09024 Prr29-204ENSMUST00000188561 592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Hoxb7P09024 Prr29-206ENSMUST00000190795 822 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Hoxb7P09024 C030018K13Rik-202ENSMUST00000196829 712 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Hoxb7P09024 Gm43597-201ENSMUST00000201650 1057 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Hoxb7P09024 Kitl-204ENSMUST00000218200 564 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Hoxb7P09024 Rrp36-201ENSMUST00000024766 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Hoxb7P09024 Utp23-201ENSMUST00000059599 740 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Hoxb7P09024 Rpl10-202ENSMUST00000074085 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Hoxb7P09024 Gm5934-201ENSMUST00000120734 2588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Hoxb7P09024 Rps13-203ENSMUST00000205490 1317 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Hoxb7P09024 Syk-203ENSMUST00000120135 5363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Hoxb7P09024 Gm45338-207ENSMUST00000211499 1405 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Hoxb7P09024 Edem3-202ENSMUST00000187951 3115 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Hoxb7P09024 Ppm1e-201ENSMUST00000055438 6344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Hoxb7P09024 Slamf8-201ENSMUST00000065679 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Hoxb7P09024 Gad1-205ENSMUST00000130998 1705 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Hoxb7P09024 Eif4g1-202ENSMUST00000073840 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Hoxb7P09024 Fam160b1-201ENSMUST00000036407 5630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Hoxb7P09024 Gm13055-201ENSMUST00000127875 1961 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Hoxb7P09024 I730028E13Rik-201ENSMUST00000216012 1959 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Hoxb7P09024 Aqp6-201ENSMUST00000023754 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Hoxb7P09024 Rlbp1-201ENSMUST00000053718 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Hoxb7P09024 Angptl7-201ENSMUST00000030840 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Hoxb7P09024 Csdc2-201ENSMUST00000038757 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Hoxb7P09024 Adam11-201ENSMUST00000068150 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Hoxb7P09024 Ap4b1-202ENSMUST00000076599 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Hoxb7P09024 Snx19-201ENSMUST00000164099 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Hoxb7P09024 Prrx1-202ENSMUST00000075805 4986 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Hoxb7P09024 Cox16-202ENSMUST00000110340 668 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Hoxb7P09024 Cabp5-202ENSMUST00000117400 1258 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Hoxb7P09024 Gm12846-201ENSMUST00000120431 1373 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Hoxb7P09024 Gm13123-201ENSMUST00000122173 492 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Hoxb7P09024 Gm27206-201ENSMUST00000154038 979 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Hoxb7P09024 Unc45bos-201ENSMUST00000156395 1306 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Hoxb7P09024 Gm16315-201ENSMUST00000163009 783 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Hoxb7P09024 C87198-201ENSMUST00000173553 1045 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Hoxb7P09024 Gm28380-201ENSMUST00000188800 385 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Hoxb7P09024 2610300A13Rik-201ENSMUST00000192930 503 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Hoxb7P09024 Gpr12-203ENSMUST00000197431 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Hoxb7P09024 4732471J01Rik-203ENSMUST00000206300 1887 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Hoxb7P09024 4930502A04Rik-201ENSMUST00000214059 865 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Hoxb7P09024 Scara3-201ENSMUST00000042046 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Hoxb7P09024 Sp8-201ENSMUST00000063918 4478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Hoxb7P09024 Dnajc30-201ENSMUST00000071263 1661 ntAPPRIS P1 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Hoxb7P09024 Gstcd-202ENSMUST00000080583 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Hoxb7P09024 Snora73a-201ENSMUST00000082453 205 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Hoxb7P09024 Olfr707-201ENSMUST00000088687 924 ntAPPRIS P1 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.4 ms