Protein–RNA interactions for Protein: P04202

Tgfb1, Transforming growth factor beta-1, mousemouse

Predictions only

Length 390 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tgfb1P04202 Gm8334-201ENSMUST00000112755 1662 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.36
Tgfb1P04202 Gm13589-201ENSMUST00000146404 1675 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Tgfb1P04202 Ap2a1-203ENSMUST00000166972 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Tgfb1P04202 Il18r1-204ENSMUST00000193391 1738 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Tgfb1P04202 Cplx4-201ENSMUST00000025397 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Tgfb1P04202 Eno1b-201ENSMUST00000076155 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Tgfb1P04202 Arfgap1-205ENSMUST00000108862 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Tgfb1P04202 Eps8l1-214ENSMUST00000171445 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.36
Tgfb1P04202 Lmx1b-201ENSMUST00000041730 4790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Tgfb1P04202 Samd4b-204ENSMUST00000208199 4391 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Tgfb1P04202 Rpl21-201ENSMUST00000035983 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Tgfb1P04202 Cggbp1-201ENSMUST00000067744 4425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Tgfb1P04202 Apoo-203ENSMUST00000113897 1218 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Tgfb1P04202 Atf7ip2-203ENSMUST00000117220 1230 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Tgfb1P04202 Gm13616-201ENSMUST00000120600 222 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
Tgfb1P04202 Ccdc24-209ENSMUST00000171052 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Tgfb1P04202 Gm26839-201ENSMUST00000180686 842 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Tgfb1P04202 4930502C17Rik-201ENSMUST00000200282 948 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
Tgfb1P04202 AC124732.2-201ENSMUST00000221977 316 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
Tgfb1P04202 Gm6888-201ENSMUST00000221983 706 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
Tgfb1P04202 Smdt1-201ENSMUST00000023086 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Tgfb1P04202 Olfr283-201ENSMUST00000057386 1102 ntAPPRIS P1 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Tgfb1P04202 Cmc2-201ENSMUST00000078589 523 ntTSL 2 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Tgfb1P04202 Gm14963-201ENSMUST00000146751 2558 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Tgfb1P04202 Creg2-201ENSMUST00000053355 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Tgfb1P04202 Vamp8-202ENSMUST00000142613 2076 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Tgfb1P04202 Cacna2d2-204ENSMUST00000166799 3474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Tgfb1P04202 Hoxaas3-202ENSMUST00000136806 2207 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Tgfb1P04202 Utp4-201ENSMUST00000047629 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Tgfb1P04202 D330025C20Rik-201ENSMUST00000191632 3046 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
Tgfb1P04202 Cadps2-213ENSMUST00000166458 4598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Tgfb1P04202 Gm5320-201ENSMUST00000207163 1519 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
Tgfb1P04202 Col7a1-202ENSMUST00000112070 9250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Tgfb1P04202 Cpeb4-201ENSMUST00000020543 2312 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Tgfb1P04202 Ttll9-202ENSMUST00000103155 1552 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Tgfb1P04202 Palb2-201ENSMUST00000063587 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Tgfb1P04202 Cbs-202ENSMUST00000078509 2403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Tgfb1P04202 Hps5-201ENSMUST00000014562 4953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Tgfb1P04202 Zfp354c-201ENSMUST00000000632 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Tgfb1P04202 Usp20-202ENSMUST00000102849 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Tgfb1P04202 Trp53-203ENSMUST00000108658 1771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Tgfb1P04202 Trp53-201ENSMUST00000005371 1772 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Tgfb1P04202 Plod2-201ENSMUST00000070522 3649 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Tgfb1P04202 2310022A10Rik-204ENSMUST00000187032 1871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Tgfb1P04202 Lrrc34-201ENSMUST00000029252 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Tgfb1P04202 Dagla-201ENSMUST00000039327 5634 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Tgfb1P04202 Nfyc-201ENSMUST00000043429 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Tgfb1P04202 Gm38197-201ENSMUST00000192320 2122 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
Tgfb1P04202 Rasgef1c-202ENSMUST00000093141 2120 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Tgfb1P04202 Pla2g5-204ENSMUST00000102513 2289 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Tgfb1P04202 Adgrb2-202ENSMUST00000097868 4635 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Tgfb1P04202 Xpot-201ENSMUST00000039810 5992 ntTSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Tgfb1P04202 Clcn4-203ENSMUST00000210061 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Tgfb1P04202 Nfxl1-202ENSMUST00000087216 3712 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Tgfb1P04202 Gm14206-201ENSMUST00000132973 747 ntTSL 3 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Tgfb1P04202 Cd63-ps-201ENSMUST00000145417 875 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
Tgfb1P04202 Iqcf1-202ENSMUST00000164965 523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Tgfb1P04202 Mir99ahg-211ENSMUST00000183099 1189 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Tgfb1P04202 Gm27430-201ENSMUST00000184585 107 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
Tgfb1P04202 Gm29019-202ENSMUST00000188623 564 ntTSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Tgfb1P04202 1700080E11Rik-202ENSMUST00000190661 682 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Tgfb1P04202 Gm44333-201ENSMUST00000197168 107 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
Tgfb1P04202 Gm44344-201ENSMUST00000200287 129 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
Tgfb1P04202 Elof1-203ENSMUST00000213233 810 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Tgfb1P04202 Aym1-201ENSMUST00000066573 528 ntAPPRIS P1 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Tgfb1P04202 Gm25007-201ENSMUST00000083808 133 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
Tgfb1P04202 Olfr1214-201ENSMUST00000099804 936 ntAPPRIS P1 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Tgfb1P04202 Cabp7-201ENSMUST00000009219 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Tgfb1P04202 Wbp2nl-201ENSMUST00000023089 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Tgfb1P04202 Zfp664-201ENSMUST00000111417 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Tgfb1P04202 1700065D16Rik-205ENSMUST00000190890 2903 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
Tgfb1P04202 Pnkd-203ENSMUST00000087226 3054 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Tgfb1P04202 Bnc2-215ENSMUST00000176691 3385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Tgfb1P04202 Mrgprh-201ENSMUST00000075296 1809 ntAPPRIS P1 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Tgfb1P04202 Slco3a1-203ENSMUST00000107453 3793 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Tgfb1P04202 Plekhb1-206ENSMUST00000107047 1926 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Tgfb1P04202 Esyt1-201ENSMUST00000026427 3981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Tgfb1P04202 Fbxo10-201ENSMUST00000052236 4635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Tgfb1P04202 Cnst-201ENSMUST00000040706 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Tgfb1P04202 Taok2-201ENSMUST00000071268 4720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Tgfb1P04202 Ascc3-201ENSMUST00000035606 7760 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Tgfb1P04202 Lipe-202ENSMUST00000054301 2661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Tgfb1P04202 Desi1-206ENSMUST00000152227 2934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Tgfb1P04202 Pde4a-203ENSMUST00000115458 2962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Tgfb1P04202 Brinp1-201ENSMUST00000030036 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Tgfb1P04202 Slc45a1-201ENSMUST00000037827 3387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Tgfb1P04202 Peli1-201ENSMUST00000093290 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Tgfb1P04202 Lypd6-201ENSMUST00000053208 3620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Tgfb1P04202 Papd5-201ENSMUST00000066748 4489 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Tgfb1P04202 Osbpl11-201ENSMUST00000039733 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Tgfb1P04202 Mtss1-201ENSMUST00000080371 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Tgfb1P04202 Synm-202ENSMUST00000074233 7818 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Tgfb1P04202 Slc4a4-207ENSMUST00000148750 7931 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Tgfb1P04202 Sgce-203ENSMUST00000101677 1656 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Tgfb1P04202 Polr2i-202ENSMUST00000108192 508 ntTSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Tgfb1P04202 Hipk4-202ENSMUST00000108353 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Tgfb1P04202 Etfrf1-204ENSMUST00000111723 842 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Tgfb1P04202 Ak1-202ENSMUST00000113277 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Tgfb1P04202 Taf3-202ENSMUST00000114906 583 ntTSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Tgfb1P04202 Mmp11-202ENSMUST00000120281 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.8 ms