Protein–RNA interactions for Protein: O55082

Ptpn20, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 20, mousemouse

Predictions only

Length 426 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ptpn20O55082 Trip13-201ENSMUST00000022053 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Ptpn20O55082 Zfp772-201ENSMUST00000074455 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Ptpn20O55082 Npepps-215ENSMUST00000167806 2307 ntTSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Ptpn20O55082 Ccdc85a-204ENSMUST00000109502 5220 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Ptpn20O55082 Msh4-201ENSMUST00000005630 3325 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Ptpn20O55082 Mab21l3-202ENSMUST00000118411 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Ptpn20O55082 Gtdc1-202ENSMUST00000100127 2422 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Ptpn20O55082 Fancc-214ENSMUST00000161977 3111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Ptpn20O55082 Cul4a-202ENSMUST00000121426 1044 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Ptpn20O55082 Rpp40-202ENSMUST00000174230 1053 ntTSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Ptpn20O55082 Gm27704-201ENSMUST00000185094 107 ntBASIC12.66□□□□□ -0.38
Ptpn20O55082 AV026068-207ENSMUST00000187718 400 ntTSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Ptpn20O55082 Gm44973-201ENSMUST00000207050 1003 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Ptpn20O55082 AL669916.2-201ENSMUST00000213219 358 ntTSL 2 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Ptpn20O55082 4930428E07Rik-201ENSMUST00000222132 920 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Ptpn20O55082 Otx2os1-206ENSMUST00000228153 787 ntBASIC12.66□□□□□ -0.38
Ptpn20O55082 Pla2g12b-201ENSMUST00000009790 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Ptpn20O55082 Tspan1-201ENSMUST00000030465 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Ptpn20O55082 Gm37472-201ENSMUST00000192342 4052 ntBASIC12.66□□□□□ -0.38
Ptpn20O55082 Rspo3-201ENSMUST00000092623 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Ptpn20O55082 AC154404.1-201ENSMUST00000223601 2077 ntBASIC12.66□□□□□ -0.38
Ptpn20O55082 March7-203ENSMUST00000102748 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Ptpn20O55082 Itga3-203ENSMUST00000120375 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Ptpn20O55082 Matn3-201ENSMUST00000020899 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Ptpn20O55082 Gm34419-201ENSMUST00000211383 1387 ntTSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Ptpn20O55082 Senp3-201ENSMUST00000005336 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Ptpn20O55082 Pdxdc1-201ENSMUST00000023361 4228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Ptpn20O55082 Slc16a12-201ENSMUST00000009522 4051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Ptpn20O55082 Arhgef2-219ENSMUST00000176500 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Ptpn20O55082 Bud23-201ENSMUST00000071677 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Ptpn20O55082 Grk4-202ENSMUST00000074651 3234 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Ptpn20O55082 1700001L05Rik-201ENSMUST00000100370 2270 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Ptpn20O55082 Fam46a-201ENSMUST00000034802 5479 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Ptpn20O55082 Wdr73-201ENSMUST00000026816 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Ptpn20O55082 Mfsd9-201ENSMUST00000039672 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Ptpn20O55082 Gm38385-201ENSMUST00000194454 2351 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
Ptpn20O55082 Tstd3-201ENSMUST00000029915 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Ptpn20O55082 Gm26794-201ENSMUST00000180810 4312 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Ptpn20O55082 Pbld2-201ENSMUST00000020262 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Ptpn20O55082 Psmd1-201ENSMUST00000027432 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Ptpn20O55082 Pak6-201ENSMUST00000099557 4411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Ptpn20O55082 Sidt1-201ENSMUST00000047446 4279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Ptpn20O55082 Dnmt3a-205ENSMUST00000172689 2328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Ptpn20O55082 Gm43102-201ENSMUST00000201004 2324 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
Ptpn20O55082 Trpv1-201ENSMUST00000006106 2340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Ptpn20O55082 Dnajc5-201ENSMUST00000072334 6578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Ptpn20O55082 CT010456.1-201ENSMUST00000222465 1688 ntTSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Ptpn20O55082 Klhl30-201ENSMUST00000027533 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Ptpn20O55082 Trpv4-202ENSMUST00000112217 2436 ntTSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Ptpn20O55082 Rps27a-202ENSMUST00000102845 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Ptpn20O55082 Chchd2-ps-201ENSMUST00000117487 462 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
Ptpn20O55082 Gm15165-201ENSMUST00000118140 502 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
Ptpn20O55082 Hist1h2bc-201ENSMUST00000018246 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Ptpn20O55082 Dusp13-213ENSMUST00000184703 902 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Ptpn20O55082 Ank1-201ENSMUST00000033947 1030 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Ptpn20O55082 Hist1h2ba-201ENSMUST00000052776 384 ntAPPRIS P1 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Ptpn20O55082 Pym1-201ENSMUST00000065210 1156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Ptpn20O55082 Zfp524-201ENSMUST00000086349 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Ptpn20O55082 Dsp-202ENSMUST00000127906 7761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Ptpn20O55082 Crhr2-208ENSMUST00000212633 2041 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Ptpn20O55082 Cacna1g-206ENSMUST00000107788 8050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Ptpn20O55082 Cacna1g-211ENSMUST00000107793 8071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Ptpn20O55082 Ppp1r18-203ENSMUST00000127442 3524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Ptpn20O55082 Specc1-202ENSMUST00000092415 6797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Ptpn20O55082 Spef1-202ENSMUST00000110218 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Ptpn20O55082 Cog7-203ENSMUST00000205438 3355 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Ptpn20O55082 Hspb6-201ENSMUST00000044048 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Ptpn20O55082 Wrap53-201ENSMUST00000048139 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Ptpn20O55082 Zufsp-201ENSMUST00000048222 2991 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Ptpn20O55082 Fgd6-201ENSMUST00000020208 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Ptpn20O55082 Bmp4-201ENSMUST00000074077 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.39
Ptpn20O55082 Csrnp3-202ENSMUST00000112394 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.39
Ptpn20O55082 Gm12355-201ENSMUST00000104933 1311 ntAPPRIS P1 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Ptpn20O55082 Rps6kb1-207ENSMUST00000154617 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Ptpn20O55082 Fads1-201ENSMUST00000010807 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Ptpn20O55082 Gm21983-201ENSMUST00000154724 1690 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Ptpn20O55082 Tbc1d9b-201ENSMUST00000093138 4407 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Ptpn20O55082 Crybg1-202ENSMUST00000200401 7525 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Ptpn20O55082 Cbln3-202ENSMUST00000172378 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Ptpn20O55082 Eml6-201ENSMUST00000058902 8083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Ptpn20O55082 Polg-201ENSMUST00000073889 7837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Ptpn20O55082 Oprd1-201ENSMUST00000056336 4021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Ptpn20O55082 Zmynd15-202ENSMUST00000092958 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Ptpn20O55082 Nrg1-201ENSMUST00000073884 2452 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Ptpn20O55082 Smim14-205ENSMUST00000139122 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Ptpn20O55082 Mpp4-210ENSMUST00000191200 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Ptpn20O55082 Pcdhb1-201ENSMUST00000052366 2588 ntAPPRIS P1 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Ptpn20O55082 Ncor2-204ENSMUST00000111394 7452 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Ptpn20O55082 Ppp1r2-202ENSMUST00000115233 958 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Ptpn20O55082 Tsfm-207ENSMUST00000152054 655 ntTSL 3 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Ptpn20O55082 Ffar2-203ENSMUST00000168528 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Ptpn20O55082 Gm25745-201ENSMUST00000174945 133 ntBASIC12.64□□□□□ -0.39
Ptpn20O55082 Vsig2-201ENSMUST00000002008 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Ptpn20O55082 Gm35082-201ENSMUST00000207308 338 ntTSL 3 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Ptpn20O55082 Ten1-201ENSMUST00000021130 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Ptpn20O55082 AC155729.1-201ENSMUST00000227758 544 ntBASIC12.64□□□□□ -0.39
Ptpn20O55082 Upk3a-201ENSMUST00000023070 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Ptpn20O55082 Sult2b1-201ENSMUST00000075571 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Ptpn20O55082 Celf1-202ENSMUST00000068726 7851 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Ptpn20O55082 Ptbp1-216ENSMUST00000172282 3110 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 69.9 ms