Protein–RNA interactions for Protein: O35599

Opn1mw, Medium-wave-sensitive opsin 1, mousemouse

Predictions only

Length 359 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Opn1mwO35599 Prdm10-202ENSMUST00000117389 1952 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Opn1mwO35599 Prpf31-202ENSMUST00000108636 1798 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Opn1mwO35599 Hsph1-209ENSMUST00000202089 3054 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Opn1mwO35599 Car3-201ENSMUST00000029076 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Opn1mwO35599 Gm11960-202ENSMUST00000181063 2858 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Opn1mwO35599 Tcf4-258ENSMUST00000202937 2103 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Opn1mwO35599 Fbxo21-201ENSMUST00000035579 3883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Opn1mwO35599 R3hcc1-206ENSMUST00000216152 1467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Opn1mwO35599 Actr1b-201ENSMUST00000043951 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Opn1mwO35599 F10-204ENSMUST00000128418 1395 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Opn1mwO35599 Zfp36-202ENSMUST00000209061 2465 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Opn1mwO35599 Crym-201ENSMUST00000033198 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Opn1mwO35599 Txn2-202ENSMUST00000100486 676 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Opn1mwO35599 Mkl2-203ENSMUST00000115809 667 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Opn1mwO35599 Map2k3os-201ENSMUST00000123544 1291 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Opn1mwO35599 Gm15317-201ENSMUST00000129569 699 ntTSL 3 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Opn1mwO35599 2900093K20Rik-201ENSMUST00000190930 567 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Opn1mwO35599 AC073947.2-201ENSMUST00000215888 1130 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Opn1mwO35599 Lsm7-208ENSMUST00000220225 1129 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Opn1mwO35599 Clps-201ENSMUST00000025062 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Opn1mwO35599 Upk2-201ENSMUST00000047740 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Opn1mwO35599 Gm17383-201ENSMUST00000078739 1041 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Opn1mwO35599 Olfr1209-201ENSMUST00000099809 933 ntAPPRIS P1 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Opn1mwO35599 Pcnx3-201ENSMUST00000068169 5276 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Opn1mwO35599 Kcp-201ENSMUST00000078112 4775 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Opn1mwO35599 Ralbp1-201ENSMUST00000024905 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Opn1mwO35599 Mark2-209ENSMUST00000165965 2874 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Opn1mwO35599 Flywch1-202ENSMUST00000086325 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Opn1mwO35599 Kctd14-206ENSMUST00000206658 2339 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Opn1mwO35599 Syde2-204ENSMUST00000212479 3810 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Opn1mwO35599 Rnf150-201ENSMUST00000078525 9682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Opn1mwO35599 Tcf4-248ENSMUST00000202354 2120 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Opn1mwO35599 Tcf4-257ENSMUST00000202772 2125 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Opn1mwO35599 Dok7-201ENSMUST00000050709 2498 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Opn1mwO35599 Phldb1-211ENSMUST00000135436 2844 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Opn1mwO35599 Tagap1-201ENSMUST00000063683 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Opn1mwO35599 Fam214b-202ENSMUST00000107956 3107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Opn1mwO35599 Myo9b-203ENSMUST00000170242 7297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Opn1mwO35599 Csnk1g1-212ENSMUST00000206048 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Opn1mwO35599 Ptprv-210ENSMUST00000183317 6108 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Opn1mwO35599 Pole2-201ENSMUST00000021359 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Opn1mwO35599 Col4a1-201ENSMUST00000033898 6615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Opn1mwO35599 Poli-201ENSMUST00000043286 2591 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Opn1mwO35599 Rad18-201ENSMUST00000068487 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Opn1mwO35599 Tmub2-205ENSMUST00000156326 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Opn1mwO35599 Agbl3-202ENSMUST00000115012 790 ntTSL 3 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Opn1mwO35599 Agbl3-203ENSMUST00000115014 805 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Opn1mwO35599 Gm12329-201ENSMUST00000120829 1007 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Opn1mwO35599 Pelp1-202ENSMUST00000135148 562 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Opn1mwO35599 Dnm3os-203ENSMUST00000185878 557 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Opn1mwO35599 4930447A16Rik-201ENSMUST00000022897 587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Opn1mwO35599 Hcfc1r1-201ENSMUST00000024697 946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Opn1mwO35599 Ceacam10-201ENSMUST00000038069 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Opn1mwO35599 Lim2-201ENSMUST00000004732 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Opn1mwO35599 Hoxb8-201ENSMUST00000052650 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Opn1mwO35599 Npnt-204ENSMUST00000117164 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Opn1mwO35599 Irf3-201ENSMUST00000003284 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Opn1mwO35599 Tdrd6-203ENSMUST00000168073 7062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Opn1mwO35599 Trim65-201ENSMUST00000067632 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Opn1mwO35599 Mrps9-201ENSMUST00000057208 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Opn1mwO35599 Cenpl-203ENSMUST00000111620 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Opn1mwO35599 Bin2-205ENSMUST00000182814 1901 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Opn1mwO35599 AI849053-201ENSMUST00000181021 2658 ntTSL 3 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Opn1mwO35599 Col7a1-202ENSMUST00000112070 9250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Opn1mwO35599 A930004D18Rik-201ENSMUST00000066163 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Opn1mwO35599 Vav1-201ENSMUST00000005889 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Opn1mwO35599 Cpsf6-207ENSMUST00000176686 2200 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Opn1mwO35599 Gm14379-201ENSMUST00000128858 1878 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Opn1mwO35599 Vegfa-202ENSMUST00000071648 3451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Opn1mwO35599 Trim24-203ENSMUST00000120428 3940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Opn1mwO35599 Dab1-203ENSMUST00000106830 5278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Opn1mwO35599 Sppl2b-201ENSMUST00000035597 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Opn1mwO35599 Gpc6-201ENSMUST00000078849 1668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Opn1mwO35599 Nipsnap3b-202ENSMUST00000107665 848 ntTSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Opn1mwO35599 Pole-203ENSMUST00000112482 747 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Opn1mwO35599 Gm5687-201ENSMUST00000118252 640 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
Opn1mwO35599 Gm15351-201ENSMUST00000123920 419 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Opn1mwO35599 Gm12050-201ENSMUST00000127483 615 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Opn1mwO35599 Gm13070-201ENSMUST00000146532 768 ntTSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Opn1mwO35599 Hoxb5os-202ENSMUST00000150698 596 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Opn1mwO35599 Gm11754-201ENSMUST00000156576 661 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Opn1mwO35599 Gm16315-201ENSMUST00000163009 783 ntTSL 3 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Opn1mwO35599 6030498E09Rik-202ENSMUST00000168144 510 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Opn1mwO35599 Rwdd3-209ENSMUST00000170781 1111 ntTSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Opn1mwO35599 Hspb9-201ENSMUST00000017976 652 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Opn1mwO35599 Gm37008-201ENSMUST00000195712 319 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
Opn1mwO35599 Crip2-206ENSMUST00000200380 864 ntTSL 3 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Opn1mwO35599 Tpd52l1-205ENSMUST00000215515 857 ntTSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Opn1mwO35599 Gm19309-201ENSMUST00000218295 205 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
Opn1mwO35599 Exosc7-201ENSMUST00000026891 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Opn1mwO35599 Utp23-201ENSMUST00000059599 740 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Opn1mwO35599 Gng8-201ENSMUST00000078182 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Opn1mwO35599 Celf5-201ENSMUST00000118763 4391 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Opn1mwO35599 Gpd1l-204ENSMUST00000146623 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Opn1mwO35599 Camta1-211ENSMUST00000169423 5208 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Opn1mwO35599 Gm9946-202ENSMUST00000162741 1580 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Opn1mwO35599 Ddhd1-202ENSMUST00000087320 9820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Opn1mwO35599 Gm37411-201ENSMUST00000194180 2282 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
Opn1mwO35599 Tesk2-203ENSMUST00000106459 2444 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Opn1mwO35599 Cpeb3-208ENSMUST00000132580 3148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
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