Protein–RNA interactions for Protein: O35085

Arx, Homeobox protein ARX, mousemouse

Predictions only

Length 564 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ArxO35085 Grip1os3-202ENSMUST00000146294 957 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
ArxO35085 Gm17399-201ENSMUST00000181824 1181 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
ArxO35085 Gm5177-201ENSMUST00000183092 997 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
ArxO35085 Gm28237-202ENSMUST00000189477 748 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
ArxO35085 Gm37019-201ENSMUST00000192133 2134 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
ArxO35085 Gm8239-201ENSMUST00000204094 444 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
ArxO35085 Gm29683-202ENSMUST00000208511 720 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
ArxO35085 Aprt-209ENSMUST00000213062 560 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
ArxO35085 AC151971.1-201ENSMUST00000217329 993 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
ArxO35085 Cyhr1-201ENSMUST00000066677 1163 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
ArxO35085 Ak1-201ENSMUST00000068271 2034 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
ArxO35085 Ptk2-201ENSMUST00000110036 4184 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
ArxO35085 Ifnlr1-201ENSMUST00000074408 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
ArxO35085 Tbkbp1-201ENSMUST00000066078 3338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
ArxO35085 Map3k20-201ENSMUST00000090824 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
ArxO35085 Igha-202ENSMUST00000194738 2540 ntAPPRIS P5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
ArxO35085 Pde1c-201ENSMUST00000044505 3907 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
ArxO35085 Gm26513-201ENSMUST00000181802 2489 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
ArxO35085 Rhobtb1-210ENSMUST00000167384 2331 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
ArxO35085 E430024P14Rik-203ENSMUST00000160545 2833 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
ArxO35085 Pgap2-204ENSMUST00000120879 2141 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
ArxO35085 Rcn3-201ENSMUST00000019683 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
ArxO35085 Rcn3-208ENSMUST00000211352 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
ArxO35085 Slc39a3-202ENSMUST00000117276 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
ArxO35085 4930518I15Rik-201ENSMUST00000099141 1331 ntAPPRIS P1 BASIC17.57■□□□□ 0.4
ArxO35085 Gm32591-204ENSMUST00000208679 1806 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
ArxO35085 Bhlhb9-204ENSMUST00000180025 2812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
ArxO35085 Zglp1-201ENSMUST00000115494 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
ArxO35085 Med28-202ENSMUST00000118833 734 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
ArxO35085 Dusp3-205ENSMUST00000143177 391 ntTSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
ArxO35085 Gm10244-202ENSMUST00000156905 474 ntTSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
ArxO35085 Rxfp4-201ENSMUST00000063119 1245 ntAPPRIS P1 BASIC17.57■□□□□ 0.4
ArxO35085 Tcf21-202ENSMUST00000218002 1788 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
ArxO35085 Polr2a-202ENSMUST00000071213 5799 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
ArxO35085 Rcan1-201ENSMUST00000023672 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
ArxO35085 Zfp957-201ENSMUST00000040802 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
ArxO35085 Wac-201ENSMUST00000074919 3070 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
ArxO35085 Idh3b-201ENSMUST00000028892 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
ArxO35085 Nrxn1-202ENSMUST00000072671 8118 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
ArxO35085 Bhmt2-201ENSMUST00000015941 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
ArxO35085 Pcnx2-204ENSMUST00000131127 3782 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
ArxO35085 Trim45-203ENSMUST00000106980 3337 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
ArxO35085 Clcn3-204ENSMUST00000110301 4099 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
ArxO35085 Smim13-201ENSMUST00000165561 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
ArxO35085 2610507B11Rik-201ENSMUST00000010421 7443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
ArxO35085 Ebf4-201ENSMUST00000110286 2670 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
ArxO35085 Cnot7-201ENSMUST00000034012 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
ArxO35085 Gpr153-203ENSMUST00000105651 3777 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
ArxO35085 Gpr153-201ENSMUST00000055754 3757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
ArxO35085 Surf6-201ENSMUST00000047632 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
ArxO35085 Slc16a13-201ENSMUST00000060010 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
ArxO35085 Zyg11b-201ENSMUST00000043616 8691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
ArxO35085 Gm5366-201ENSMUST00000215494 1338 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
ArxO35085 Prickle3-203ENSMUST00000129662 2376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
ArxO35085 Tnfrsf13b-202ENSMUST00000101103 750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
ArxO35085 Derl2-202ENSMUST00000108523 884 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
ArxO35085 Ppil3-203ENSMUST00000114348 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
ArxO35085 Mmab-203ENSMUST00000123256 1277 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
ArxO35085 Gm42560-201ENSMUST00000201216 1023 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
ArxO35085 Olfr975-201ENSMUST00000054067 933 ntAPPRIS P1 BASIC17.56■□□□□ 0.4
ArxO35085 Krtap19-3-201ENSMUST00000075284 526 ntAPPRIS P1 BASIC17.56■□□□□ 0.4
ArxO35085 D930028M14Rik-201ENSMUST00000098678 1003 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
ArxO35085 Ephb3-201ENSMUST00000006112 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
ArxO35085 Zfp853-201ENSMUST00000180336 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
ArxO35085 Hdac8-201ENSMUST00000087916 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
ArxO35085 Rnf152-202ENSMUST00000172299 8406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
ArxO35085 Maged2-201ENSMUST00000026302 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
ArxO35085 Gm42471-201ENSMUST00000201457 1865 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
ArxO35085 Trpm4-201ENSMUST00000042194 4234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
ArxO35085 Arhgef25-202ENSMUST00000167353 2189 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
ArxO35085 Ap4b1-207ENSMUST00000200377 1823 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
ArxO35085 Slc4a5-201ENSMUST00000039212 5123 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
ArxO35085 Adal-205ENSMUST00000119031 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
ArxO35085 Mau2-202ENSMUST00000168013 5323 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
ArxO35085 Ssh3-202ENSMUST00000113852 2735 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
ArxO35085 Ssh3-201ENSMUST00000037992 2728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
ArxO35085 Kcnj3-201ENSMUST00000067101 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
ArxO35085 Dlk1-205ENSMUST00000109844 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
ArxO35085 Pde4a-203ENSMUST00000115458 2962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
ArxO35085 Tcf25-208ENSMUST00000212571 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
ArxO35085 Vax2os-203ENSMUST00000155159 4063 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
ArxO35085 Psmd12-201ENSMUST00000021063 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
ArxO35085 Mdm2-201ENSMUST00000020408 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
ArxO35085 Ppl-201ENSMUST00000035672 6277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
ArxO35085 Gm5096-201ENSMUST00000091776 1858 ntAPPRIS P1 BASIC17.55■□□□□ 0.4
ArxO35085 Car10-201ENSMUST00000042943 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
ArxO35085 Ubr7-201ENSMUST00000046404 3261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
ArxO35085 Mdk-204ENSMUST00000111309 771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
ArxO35085 Rerg-203ENSMUST00000119610 890 ntTSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
ArxO35085 Ccer2-201ENSMUST00000178767 1054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
ArxO35085 Gm10253-201ENSMUST00000194270 940 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
ArxO35085 Mlnr-ps-201ENSMUST00000208959 969 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
ArxO35085 Tssk3-201ENSMUST00000000421 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
ArxO35085 Etnk2-201ENSMUST00000129213 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
ArxO35085 Kctd14-206ENSMUST00000206658 2339 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
ArxO35085 Srp72-202ENSMUST00000120550 2297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
ArxO35085 St13-205ENSMUST00000172107 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
ArxO35085 Srpx-203ENSMUST00000115544 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
ArxO35085 Ilvbl-201ENSMUST00000105384 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
ArxO35085 Dmkn-205ENSMUST00000165887 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.2 ms