Protein–RNA interactions for Protein: J3QQ02

Gm2056, Predicted gene 2056, mousemouse

Predictions only

Length 144 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm2056J3QQ02 Sh3bgrl3-201ENSMUST00000030651 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gm2056J3QQ02 Gm5356-201ENSMUST00000093326 615 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Gm2056J3QQ02 Anks1b-213ENSMUST00000182284 2607 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gm2056J3QQ02 Drd5-201ENSMUST00000041646 3152 ntAPPRIS P1 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gm2056J3QQ02 Dnmt3b-204ENSMUST00000088976 4130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gm2056J3QQ02 Rara-203ENSMUST00000107474 2380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gm2056J3QQ02 Ccnc-203ENSMUST00000108240 1406 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gm2056J3QQ02 Rassf10-201ENSMUST00000182858 3496 ntAPPRIS P1 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gm2056J3QQ02 Gm996-201ENSMUST00000114217 4881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gm2056J3QQ02 Neu2-203ENSMUST00000164128 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gm2056J3QQ02 Arhgap28-201ENSMUST00000024840 5322 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gm2056J3QQ02 Men1-207ENSMUST00000113503 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gm2056J3QQ02 Slc25a46-201ENSMUST00000060396 4371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gm2056J3QQ02 Depdc1b-201ENSMUST00000051594 2563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gm2056J3QQ02 Spidr-201ENSMUST00000040248 3279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gm2056J3QQ02 Ociad1-202ENSMUST00000071081 1311 ntTSL 3 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gm2056J3QQ02 Ssr1-204ENSMUST00000225319 1610 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Gm2056J3QQ02 AC115735.4-201ENSMUST00000227460 1944 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Gm2056J3QQ02 Eaf1-201ENSMUST00000022446 4918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gm2056J3QQ02 Pex12-202ENSMUST00000108146 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gm2056J3QQ02 Atp2a2-202ENSMUST00000177974 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gm2056J3QQ02 Clptm1-201ENSMUST00000055242 4143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gm2056J3QQ02 Tap2-201ENSMUST00000025197 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gm2056J3QQ02 Ccdc85a-201ENSMUST00000042534 5332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gm2056J3QQ02 Pdpn-201ENSMUST00000030317 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gm2056J3QQ02 Cuedc2-201ENSMUST00000051234 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gm2056J3QQ02 Tcf4-248ENSMUST00000202354 2120 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gm2056J3QQ02 Tcf4-257ENSMUST00000202772 2125 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gm2056J3QQ02 Fndc7-201ENSMUST00000053065 3009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gm2056J3QQ02 Foxo4-201ENSMUST00000062000 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gm2056J3QQ02 Raver1-202ENSMUST00000217282 4234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gm2056J3QQ02 Col3a1-201ENSMUST00000087883 5564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gm2056J3QQ02 Eogt-202ENSMUST00000113387 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gm2056J3QQ02 Gm4984-201ENSMUST00000115987 360 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Gm2056J3QQ02 Ankzf1-201ENSMUST00000127625 1167 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gm2056J3QQ02 Gnb2-215ENSMUST00000170293 993 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gm2056J3QQ02 Ube2i-205ENSMUST00000172587 508 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gm2056J3QQ02 Gm17634-201ENSMUST00000181383 1285 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gm2056J3QQ02 Gm29358-201ENSMUST00000186510 1734 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gm2056J3QQ02 4932422M17Rik-201ENSMUST00000195992 2639 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Gm2056J3QQ02 Gm6266-201ENSMUST00000203844 806 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Gm2056J3QQ02 Rita1-201ENSMUST00000031599 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gm2056J3QQ02 Selenon-201ENSMUST00000060435 3445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gm2056J3QQ02 Eif4g3-215ENSMUST00000203828 5289 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gm2056J3QQ02 Ap3d1-201ENSMUST00000020420 4805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gm2056J3QQ02 Aire-207ENSMUST00000140636 1615 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gm2056J3QQ02 Tspan32-205ENSMUST00000105924 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gm2056J3QQ02 Edc4-201ENSMUST00000040254 4780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gm2056J3QQ02 Gm15512-201ENSMUST00000137359 2257 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gm2056J3QQ02 Dmpk-201ENSMUST00000032568 2761 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gm2056J3QQ02 Slco3a1-203ENSMUST00000107453 3793 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Gm2056J3QQ02 Ppp1r18-206ENSMUST00000190496 1395 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Gm2056J3QQ02 Spon2-201ENSMUST00000046186 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Gm2056J3QQ02 Rusc1-202ENSMUST00000090929 3706 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Gm2056J3QQ02 Grb10-201ENSMUST00000093321 5061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Gm2056J3QQ02 Tbc1d4-210ENSMUST00000162617 4762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Gm2056J3QQ02 Gtf2ird1-208ENSMUST00000167084 3283 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Gm2056J3QQ02 Repin1-201ENSMUST00000009420 3145 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Gm2056J3QQ02 Npnt-204ENSMUST00000117164 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Gm2056J3QQ02 Tbc1d10c-201ENSMUST00000045864 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Gm2056J3QQ02 Ubc-202ENSMUST00000136312 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Gm2056J3QQ02 Gm15440-201ENSMUST00000110042 1231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Gm2056J3QQ02 Mrps10-202ENSMUST00000119841 1113 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Gm2056J3QQ02 Ift20-203ENSMUST00000128788 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Gm2056J3QQ02 C430049B03Rik-201ENSMUST00000129764 868 ntTSL 3 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Gm2056J3QQ02 Klk12-201ENSMUST00000014063 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Gm2056J3QQ02 Kctd17-202ENSMUST00000159771 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Gm2056J3QQ02 Gm17232-201ENSMUST00000164515 453 ntTSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Gm2056J3QQ02 Gm17150-201ENSMUST00000165577 381 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Gm2056J3QQ02 Ighv1-51-201ENSMUST00000192903 354 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Gm2056J3QQ02 Gm9932-201ENSMUST00000194154 2116 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Gm2056J3QQ02 Gm15411-202ENSMUST00000201913 668 ntTSL 3 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Gm2056J3QQ02 4930438A08Rik-202ENSMUST00000208022 918 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Gm2056J3QQ02 Chst4-202ENSMUST00000211894 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Gm2056J3QQ02 Crybb2-201ENSMUST00000031295 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Gm2056J3QQ02 Ngf-201ENSMUST00000035952 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Gm2056J3QQ02 9330182L06Rik-201ENSMUST00000069538 4688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Gm2056J3QQ02 Wdr83-201ENSMUST00000093357 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Gm2056J3QQ02 Mvk-202ENSMUST00000112239 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Gm2056J3QQ02 Adck5-207ENSMUST00000160784 1998 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Gm2056J3QQ02 Ccdc117-201ENSMUST00000020776 3372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Gm2056J3QQ02 Cry2-202ENSMUST00000111278 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Gm2056J3QQ02 Trim2-203ENSMUST00000107691 7428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Gm2056J3QQ02 Poc1b-204ENSMUST00000159990 3449 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Gm2056J3QQ02 Pip5k1c-201ENSMUST00000045469 4323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Gm2056J3QQ02 Snrpa-202ENSMUST00000122202 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Gm2056J3QQ02 Gm9856-201ENSMUST00000217077 2578 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Gm2056J3QQ02 Phldb1-214ENSMUST00000147495 5424 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Gm2056J3QQ02 Cct6b-202ENSMUST00000100722 1871 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Gm2056J3QQ02 Gatd1-201ENSMUST00000106008 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Gm2056J3QQ02 Fh1-201ENSMUST00000027810 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Gm2056J3QQ02 Zfand3-201ENSMUST00000057897 2617 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Gm2056J3QQ02 Gm6159-201ENSMUST00000191249 1724 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Gm2056J3QQ02 Nfxl1-202ENSMUST00000087216 3712 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Gm2056J3QQ02 Ankrd50-201ENSMUST00000094300 1944 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Gm2056J3QQ02 Madd-201ENSMUST00000066420 3753 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Gm2056J3QQ02 Il1r1-202ENSMUST00000114795 4832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Gm2056J3QQ02 Pard3b-202ENSMUST00000075374 8392 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Gm2056J3QQ02 Hadhb-201ENSMUST00000026841 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Gm2056J3QQ02 Itgb3-201ENSMUST00000021028 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.7 ms