Protein–RNA interactions for Protein: G5E8Z2

Taf4b, Transcription initiation factor TFIID subunit 4B, mousemouse

Predictions only

Length 855 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Taf4bG5E8Z2 Itpripl1-203ENSMUST00000154021 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Taf4bG5E8Z2 Ccdc27-201ENSMUST00000047207 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Taf4bG5E8Z2 Lpar1-201ENSMUST00000055018 3512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Taf4bG5E8Z2 Wfdc3-201ENSMUST00000103096 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Taf4bG5E8Z2 Spaca3-202ENSMUST00000103223 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Taf4bG5E8Z2 Diablo-202ENSMUST00000111586 719 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Taf4bG5E8Z2 Cd99l2-204ENSMUST00000114587 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Taf4bG5E8Z2 Snap47-202ENSMUST00000120940 1192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Taf4bG5E8Z2 Gm20661-203ENSMUST00000177368 900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Taf4bG5E8Z2 4833428L15Rik-201ENSMUST00000181230 1259 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Taf4bG5E8Z2 Pde8a-201ENSMUST00000026672 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Taf4bG5E8Z2 Diablo-201ENSMUST00000031385 681 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Taf4bG5E8Z2 Cited1-201ENSMUST00000050551 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Taf4bG5E8Z2 Nanos3-201ENSMUST00000070102 730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Taf4bG5E8Z2 Tjap1-211ENSMUST00000225080 2412 ntAPPRIS P2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Taf4bG5E8Z2 Marveld3-202ENSMUST00000051430 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Taf4bG5E8Z2 Bpifa6-201ENSMUST00000109753 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Taf4bG5E8Z2 C330018A13Rik-201ENSMUST00000127792 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Taf4bG5E8Z2 Larp1b-205ENSMUST00000191805 1581 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Taf4bG5E8Z2 Olfr718-ps1-202ENSMUST00000213631 4737 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Taf4bG5E8Z2 Pctp-201ENSMUST00000020864 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Taf4bG5E8Z2 Stag1-206ENSMUST00000129269 6186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Taf4bG5E8Z2 Itfg1-201ENSMUST00000034140 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Taf4bG5E8Z2 Tnks1bp1-202ENSMUST00000111605 5747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Taf4bG5E8Z2 Oxa1l-201ENSMUST00000000985 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Taf4bG5E8Z2 Ppp1r15a-202ENSMUST00000167273 2809 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Taf4bG5E8Z2 Lime1-201ENSMUST00000048077 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Taf4bG5E8Z2 Fggy-203ENSMUST00000107091 1395 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Taf4bG5E8Z2 St8sia3-201ENSMUST00000025477 6282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Taf4bG5E8Z2 Zbtb33-201ENSMUST00000049740 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Taf4bG5E8Z2 Tspan11-201ENSMUST00000032501 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Taf4bG5E8Z2 Rcbtb1-202ENSMUST00000043227 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Taf4bG5E8Z2 Gm13883-201ENSMUST00000150450 1404 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Taf4bG5E8Z2 Kcnq1-201ENSMUST00000009689 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Taf4bG5E8Z2 Snx14-204ENSMUST00000165315 3109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Taf4bG5E8Z2 Plch2-208ENSMUST00000145662 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Taf4bG5E8Z2 Clcf1-201ENSMUST00000046506 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Taf4bG5E8Z2 Acox3-204ENSMUST00000114238 2825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Taf4bG5E8Z2 Sgsm1-201ENSMUST00000048112 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Taf4bG5E8Z2 Osbpl11-201ENSMUST00000039733 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Taf4bG5E8Z2 AC121805.2-201ENSMUST00000218808 2538 ntBASIC15.08■□□□□ 0.01
Taf4bG5E8Z2 Gm11946-201ENSMUST00000123459 3941 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Taf4bG5E8Z2 Zkscan14-203ENSMUST00000198959 2243 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Taf4bG5E8Z2 Npc2-201ENSMUST00000021668 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Taf4bG5E8Z2 Kctd14-206ENSMUST00000206658 2339 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
Taf4bG5E8Z2 Pmvk-202ENSMUST00000107410 652 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Taf4bG5E8Z2 Gfpt1-203ENSMUST00000113657 1200 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Taf4bG5E8Z2 Eef1akmt4-201ENSMUST00000115522 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Taf4bG5E8Z2 Gm14104-201ENSMUST00000135990 356 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Taf4bG5E8Z2 1700028J19Rik-203ENSMUST00000206686 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Taf4bG5E8Z2 Gm18934-201ENSMUST00000216671 1044 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Taf4bG5E8Z2 AC154621.1-201ENSMUST00000226155 1119 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Taf4bG5E8Z2 Poli-202ENSMUST00000121674 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Taf4bG5E8Z2 Adgrb2-202ENSMUST00000097868 4635 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Taf4bG5E8Z2 Abcg8-202ENSMUST00000170725 2415 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Taf4bG5E8Z2 AU040320-201ENSMUST00000047431 4384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Taf4bG5E8Z2 Vwa2-201ENSMUST00000026068 4049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Taf4bG5E8Z2 Atxn7l1-202ENSMUST00000090597 2563 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Taf4bG5E8Z2 Gm42690-201ENSMUST00000197921 1836 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Taf4bG5E8Z2 Uhrf1bp1l-201ENSMUST00000020112 6448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Taf4bG5E8Z2 E230013L22Rik-201ENSMUST00000180408 1856 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Taf4bG5E8Z2 Ckmt2-201ENSMUST00000022122 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Taf4bG5E8Z2 Gad2-201ENSMUST00000028123 5744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Taf4bG5E8Z2 P4ha1-202ENSMUST00000092512 2387 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Taf4bG5E8Z2 Hoxc4-201ENSMUST00000100164 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Taf4bG5E8Z2 Gm16029-201ENSMUST00000161643 2427 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Taf4bG5E8Z2 Fgfr2-207ENSMUST00000117872 4223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Taf4bG5E8Z2 Spo11-202ENSMUST00000109125 1591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Taf4bG5E8Z2 9330162012Rik-201ENSMUST00000154919 3836 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Taf4bG5E8Z2 Ptx4-201ENSMUST00000054930 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Taf4bG5E8Z2 Gckr-201ENSMUST00000072228 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Taf4bG5E8Z2 Zscan22-203ENSMUST00000119989 2087 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Taf4bG5E8Z2 Slc25a37-201ENSMUST00000037064 4174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Taf4bG5E8Z2 Degs2-202ENSMUST00000167978 1729 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Taf4bG5E8Z2 Ppt2-201ENSMUST00000064953 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Taf4bG5E8Z2 Fgd4-211ENSMUST00000162671 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Taf4bG5E8Z2 Lman2-201ENSMUST00000021940 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Taf4bG5E8Z2 Gosr2-202ENSMUST00000107013 1044 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Taf4bG5E8Z2 Hcrt-202ENSMUST00000107360 509 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Taf4bG5E8Z2 Gm26830-201ENSMUST00000180389 993 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Taf4bG5E8Z2 Gm10576-201ENSMUST00000191927 825 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Taf4bG5E8Z2 4930502C17Rik-201ENSMUST00000200282 948 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Taf4bG5E8Z2 Gm42846-201ENSMUST00000201771 514 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Taf4bG5E8Z2 Snapc2-203ENSMUST00000208316 1190 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Taf4bG5E8Z2 Gm17795-201ENSMUST00000214505 757 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Taf4bG5E8Z2 Cmc2-201ENSMUST00000078589 523 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Taf4bG5E8Z2 Palld-203ENSMUST00000121493 5445 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Taf4bG5E8Z2 Asb18-201ENSMUST00000086882 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Taf4bG5E8Z2 Sptb-201ENSMUST00000021458 10394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Taf4bG5E8Z2 Plekhb1-206ENSMUST00000107047 1926 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Taf4bG5E8Z2 Gm8337-201ENSMUST00000187358 1938 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Taf4bG5E8Z2 Gm10729-202ENSMUST00000193403 1375 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Taf4bG5E8Z2 Ltbp4-203ENSMUST00000118583 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Taf4bG5E8Z2 Ntn4-201ENSMUST00000020204 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Taf4bG5E8Z2 Fgfr3-210ENSMUST00000169212 4245 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Taf4bG5E8Z2 Higd1a-205ENSMUST00000215007 1980 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Taf4bG5E8Z2 Serpinb2-201ENSMUST00000009356 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Taf4bG5E8Z2 Nat6-201ENSMUST00000093785 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Taf4bG5E8Z2 Pias3-203ENSMUST00000107077 2695 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Taf4bG5E8Z2 Vav1-203ENSMUST00000112870 2743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.8 ms