Protein–RNA interactions for Protein: F6YKY3

Gm8005, Predicted gene 8005 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 213 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm8005F6YKY3 Adal-204ENSMUST00000110665 2356 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Gm8005F6YKY3 Hp1bp3-201ENSMUST00000030541 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Gm8005F6YKY3 Myo18a-210ENSMUST00000130305 5450 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Gm8005F6YKY3 Crhr2-208ENSMUST00000212633 2041 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Gm8005F6YKY3 Podn-202ENSMUST00000106708 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Gm8005F6YKY3 Kif13a-201ENSMUST00000056978 6866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Gm8005F6YKY3 Fibin-201ENSMUST00000099626 2267 ntAPPRIS P1 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Gm8005F6YKY3 Pik3r1-202ENSMUST00000055518 7113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Gm8005F6YKY3 Dync1i1-204ENSMUST00000115559 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Gm8005F6YKY3 Fn1-201ENSMUST00000055226 8315 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Gm8005F6YKY3 Mpp4-210ENSMUST00000191200 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Gm8005F6YKY3 Cyp11b2-201ENSMUST00000167634 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Gm8005F6YKY3 2810468N07Rik-201ENSMUST00000163493 1349 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Gm8005F6YKY3 Tepsin-201ENSMUST00000026442 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Gm8005F6YKY3 Ctps2-206ENSMUST00000112303 3289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Gm8005F6YKY3 0610010K14Rik-204ENSMUST00000102569 778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Gm8005F6YKY3 Gamt-202ENSMUST00000105363 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Gm8005F6YKY3 Gm11185-201ENSMUST00000117732 1007 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
Gm8005F6YKY3 Gm6433-201ENSMUST00000118634 875 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
Gm8005F6YKY3 Pgap2-204ENSMUST00000120879 2141 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Gm8005F6YKY3 Gm16120-201ENSMUST00000127990 808 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Gm8005F6YKY3 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Gm8005F6YKY3 Gm18489-201ENSMUST00000172565 551 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
Gm8005F6YKY3 BC022687-202ENSMUST00000177808 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Gm8005F6YKY3 Rac3-201ENSMUST00000018156 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Gm8005F6YKY3 Gm27646-201ENSMUST00000183989 110 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
Gm8005F6YKY3 Smim22-208ENSMUST00000185147 399 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Gm8005F6YKY3 1700028B04Rik-202ENSMUST00000190841 971 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Gm8005F6YKY3 Ighv6-1-201ENSMUST00000193612 343 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
Gm8005F6YKY3 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Gm8005F6YKY3 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Gm8005F6YKY3 Kiss1r-202ENSMUST00000219745 979 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Gm8005F6YKY3 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Gm8005F6YKY3 Cbr2-201ENSMUST00000026148 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Gm8005F6YKY3 2310002L09Rik-201ENSMUST00000030101 958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Gm8005F6YKY3 Prima1-201ENSMUST00000074416 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Gm8005F6YKY3 Pprc1-201ENSMUST00000062322 5205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Gm8005F6YKY3 Psen1-201ENSMUST00000041806 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Gm8005F6YKY3 Rbpms2-202ENSMUST00000169003 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Gm8005F6YKY3 Cyp2w1-201ENSMUST00000031521 1512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Gm8005F6YKY3 Ldb3-201ENSMUST00000022327 5119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Gm8005F6YKY3 Cox16-201ENSMUST00000002757 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Gm8005F6YKY3 Thap1-201ENSMUST00000036807 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Gm8005F6YKY3 2610028D06Rik-201ENSMUST00000215216 1713 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
Gm8005F6YKY3 Terf2ip-201ENSMUST00000052138 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Gm8005F6YKY3 Ndc80-201ENSMUST00000024851 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Gm8005F6YKY3 Kcnb1-204ENSMUST00000207917 11153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Gm8005F6YKY3 C030034I22Rik-202ENSMUST00000188481 4231 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
Gm8005F6YKY3 Pgm3-201ENSMUST00000070064 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Gm8005F6YKY3 Ccpg1-208ENSMUST00000150826 2939 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Gm8005F6YKY3 Atp8a1-202ENSMUST00000072971 7154 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Gm8005F6YKY3 Usf1-207ENSMUST00000160486 1878 ntTSL 2 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Gm8005F6YKY3 Fn1-213ENSMUST00000188674 7680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Gm8005F6YKY3 Fn1-217ENSMUST00000190780 7694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Gm8005F6YKY3 Canx-201ENSMUST00000020637 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Gm8005F6YKY3 Ddah1-201ENSMUST00000029845 3764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Gm8005F6YKY3 Atp6v1h-204ENSMUST00000192698 1811 ntTSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Gm8005F6YKY3 Etv3-205ENSMUST00000170036 5127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Gm8005F6YKY3 Ciz1-203ENSMUST00000113332 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Gm8005F6YKY3 Ncapd3-201ENSMUST00000073127 5499 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Gm8005F6YKY3 Snrk-203ENSMUST00000120173 4758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Gm8005F6YKY3 Med25-211ENSMUST00000208551 2678 ntTSL 2 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Gm8005F6YKY3 Gm17435-202ENSMUST00000212699 1998 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
Gm8005F6YKY3 Mrpl58-202ENSMUST00000103036 749 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Gm8005F6YKY3 Yif1b-203ENSMUST00000108238 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Gm8005F6YKY3 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Gm8005F6YKY3 Nfya-203ENSMUST00000159063 1255 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Gm8005F6YKY3 Tmprss5-204ENSMUST00000167095 1146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Gm8005F6YKY3 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Gm8005F6YKY3 Gm20496-202ENSMUST00000173770 523 ntTSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Gm8005F6YKY3 Gm5914-202ENSMUST00000182863 375 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Gm8005F6YKY3 Hint1-201ENSMUST00000020504 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Gm8005F6YKY3 Dctn6-201ENSMUST00000033913 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Gm8005F6YKY3 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Gm8005F6YKY3 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Gm8005F6YKY3 Ifi27-204ENSMUST00000079294 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Gm8005F6YKY3 Rxrg-204ENSMUST00000111386 1705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Gm8005F6YKY3 Wnt9a-202ENSMUST00000108783 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Gm8005F6YKY3 D230017M19Rik-201ENSMUST00000180722 3096 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Gm8005F6YKY3 Rnft2-202ENSMUST00000121369 4431 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Gm8005F6YKY3 Coasy-202ENSMUST00000107308 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Gm8005F6YKY3 Ankrd42-205ENSMUST00000138267 2827 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Gm8005F6YKY3 Nfkb2-202ENSMUST00000111881 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Gm8005F6YKY3 Mylk-201ENSMUST00000023538 7824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Gm8005F6YKY3 Mid1-215ENSMUST00000171433 2546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Gm8005F6YKY3 Creb3l3-201ENSMUST00000117422 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Gm8005F6YKY3 Chac1-201ENSMUST00000028780 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Gm8005F6YKY3 Cyth1-201ENSMUST00000017276 3135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Gm8005F6YKY3 Hadhb-202ENSMUST00000114783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Gm8005F6YKY3 Slc39a9-208ENSMUST00000219706 5427 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Gm8005F6YKY3 Ints13-201ENSMUST00000032427 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Gm8005F6YKY3 Rbpj-207ENSMUST00000201883 4961 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Gm8005F6YKY3 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Gm8005F6YKY3 Abat-203ENSMUST00000115839 2414 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Gm8005F6YKY3 Msi2-203ENSMUST00000107909 6436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Gm8005F6YKY3 Gm5385-201ENSMUST00000118988 1559 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
Gm8005F6YKY3 Bmp7-201ENSMUST00000009143 3670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Gm8005F6YKY3 Egfem1-201ENSMUST00000118531 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Gm8005F6YKY3 Sh3bp2-202ENSMUST00000101316 3031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Gm8005F6YKY3 Ptprr-204ENSMUST00000128399 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
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