Protein–RNA interactions for Protein: E9PUP1

Syde2, Synapse defective 1, Rho GTPase, homolog 2 (C. elegans), mousemouse

Predictions only

Length 1,314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syde2E9PUP1 Naaa-202ENSMUST00000159345 1629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Syde2E9PUP1 Usp33-202ENSMUST00000117492 3886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Syde2E9PUP1 Zfp157-202ENSMUST00000100524 869 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Syde2E9PUP1 Ighv7-3-201ENSMUST00000103461 361 ntAPPRIS P1 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Syde2E9PUP1 Rab15-204ENSMUST00000122419 856 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Syde2E9PUP1 Gm12050-201ENSMUST00000127483 615 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Syde2E9PUP1 Gm7029-201ENSMUST00000173226 450 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Syde2E9PUP1 Gm8801-201ENSMUST00000173255 1064 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Syde2E9PUP1 Gm20033-203ENSMUST00000180912 796 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Syde2E9PUP1 2310040G24Rik-202ENSMUST00000189386 775 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Syde2E9PUP1 Chfr-212ENSMUST00000200038 606 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Syde2E9PUP1 Gm43597-201ENSMUST00000201650 1057 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Syde2E9PUP1 Gm36264-202ENSMUST00000221989 1142 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Syde2E9PUP1 Ccdc134-201ENSMUST00000089174 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Syde2E9PUP1 P2ry2-201ENSMUST00000037540 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Syde2E9PUP1 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Syde2E9PUP1 Gpt-201ENSMUST00000023203 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Syde2E9PUP1 Trim24-203ENSMUST00000120428 3940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Syde2E9PUP1 Elavl3-201ENSMUST00000003501 5014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Syde2E9PUP1 Gm10040-201ENSMUST00000080726 1662 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Syde2E9PUP1 Iffo1-202ENSMUST00000119527 2840 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Syde2E9PUP1 Mon1a-202ENSMUST00000191906 2821 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Syde2E9PUP1 Gm11725-201ENSMUST00000125607 1850 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Syde2E9PUP1 Eif4g1-206ENSMUST00000115463 5378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Syde2E9PUP1 Traf2-201ENSMUST00000028311 3044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Syde2E9PUP1 Troap-201ENSMUST00000039665 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Syde2E9PUP1 Chd4-202ENSMUST00000112390 6537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Syde2E9PUP1 Snx14-204ENSMUST00000165315 3109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Syde2E9PUP1 Vwa3b-202ENSMUST00000067178 1769 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Syde2E9PUP1 Txnrd1-206ENSMUST00000219442 3531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Syde2E9PUP1 Yap1-201ENSMUST00000065353 4171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Syde2E9PUP1 Cryzl1-201ENSMUST00000073466 1965 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Syde2E9PUP1 Psme2b-201ENSMUST00000104958 837 ntAPPRIS P1 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Syde2E9PUP1 Gm10327-201ENSMUST00000105222 1002 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Syde2E9PUP1 Tagln2-201ENSMUST00000111228 716 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Syde2E9PUP1 Hoxb5os-202ENSMUST00000150698 596 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Syde2E9PUP1 Mmgt2-207ENSMUST00000155759 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Syde2E9PUP1 Crb3-204ENSMUST00000163763 868 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Syde2E9PUP1 S100a14-202ENSMUST00000167598 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Syde2E9PUP1 Gm7584-201ENSMUST00000175829 940 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Syde2E9PUP1 Gm26728-201ENSMUST00000185268 595 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Syde2E9PUP1 0610005C13Rik-202ENSMUST00000209510 671 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Syde2E9PUP1 Rpl10-201ENSMUST00000008826 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Syde2E9PUP1 Olfr1209-201ENSMUST00000099809 933 ntAPPRIS P1 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Syde2E9PUP1 Luc7l3-201ENSMUST00000021226 3373 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Syde2E9PUP1 Trim62-201ENSMUST00000035667 3752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Syde2E9PUP1 Iah1-204ENSMUST00000223345 1890 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Syde2E9PUP1 Crhr2-201ENSMUST00000003568 2695 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Syde2E9PUP1 Palm-201ENSMUST00000046945 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Syde2E9PUP1 Evpl-201ENSMUST00000037007 6384 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Syde2E9PUP1 Tle1-204ENSMUST00000102848 3660 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Syde2E9PUP1 Ppp2r2c-201ENSMUST00000031003 4088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Syde2E9PUP1 Zmynd11-207ENSMUST00000110638 4003 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Syde2E9PUP1 Smyd4-201ENSMUST00000044530 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Syde2E9PUP1 Tmpo-202ENSMUST00000072239 3533 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Syde2E9PUP1 Bend7-201ENSMUST00000056914 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Syde2E9PUP1 Sppl2b-201ENSMUST00000035597 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Syde2E9PUP1 Adam23-204ENSMUST00000114103 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Syde2E9PUP1 Gabra4-201ENSMUST00000031121 4108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Syde2E9PUP1 Ccdc88c-202ENSMUST00000085096 6313 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Syde2E9PUP1 Fdx1-202ENSMUST00000214013 2759 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Syde2E9PUP1 Gm8706-201ENSMUST00000197372 1491 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
Syde2E9PUP1 Clcf1-201ENSMUST00000046506 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Syde2E9PUP1 Lrguk-202ENSMUST00000101564 967 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Syde2E9PUP1 Mad2l2-203ENSMUST00000105707 949 ntTSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Syde2E9PUP1 Mapkapk5-205ENSMUST00000111786 975 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Syde2E9PUP1 Ube4bos1-202ENSMUST00000151896 1286 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Syde2E9PUP1 1110006O24Rik-201ENSMUST00000201728 768 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
Syde2E9PUP1 Gm45720-201ENSMUST00000211881 484 ntTSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Syde2E9PUP1 Jakmip1-215ENSMUST00000212047 1191 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Syde2E9PUP1 Tpd52l1-205ENSMUST00000215515 857 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Syde2E9PUP1 Kitl-204ENSMUST00000218200 564 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Syde2E9PUP1 AC133598.1-201ENSMUST00000224327 660 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
Syde2E9PUP1 AC140406.1-201ENSMUST00000226481 465 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
Syde2E9PUP1 Snora73a-201ENSMUST00000082453 205 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
Syde2E9PUP1 Trpt1-201ENSMUST00000088223 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Syde2E9PUP1 Irs2-201ENSMUST00000040514 6323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Syde2E9PUP1 Zranb2-201ENSMUST00000029831 2540 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Syde2E9PUP1 Itgb4-201ENSMUST00000021107 6014 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Syde2E9PUP1 Cpped1-203ENSMUST00000121750 2614 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Syde2E9PUP1 Snx19-201ENSMUST00000164099 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Syde2E9PUP1 Syde2-204ENSMUST00000212479 3810 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Syde2E9PUP1 Gpam-201ENSMUST00000061856 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Syde2E9PUP1 Hpse-201ENSMUST00000045617 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Syde2E9PUP1 Gm16029-201ENSMUST00000161643 2427 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Syde2E9PUP1 Rab23-201ENSMUST00000088287 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Syde2E9PUP1 Atp2a2-202ENSMUST00000177974 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Syde2E9PUP1 Tle1-202ENSMUST00000072695 3644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Syde2E9PUP1 B230319C09Rik-201ENSMUST00000063376 1689 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Syde2E9PUP1 Bid-201ENSMUST00000004560 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Syde2E9PUP1 Rnf26-205ENSMUST00000215685 1804 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Syde2E9PUP1 Susd2-201ENSMUST00000077610 2275 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Syde2E9PUP1 Stat3-201ENSMUST00000092671 2927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Syde2E9PUP1 Rassf5-203ENSMUST00000112442 3388 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Syde2E9PUP1 Med15-201ENSMUST00000012259 3383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Syde2E9PUP1 Gypc-202ENSMUST00000174000 2072 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Syde2E9PUP1 Csnk1g1-212ENSMUST00000206048 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Syde2E9PUP1 Ppih-203ENSMUST00000106318 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Syde2E9PUP1 Rps2-ps9-201ENSMUST00000121414 817 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Syde2E9PUP1 Gm15317-201ENSMUST00000129569 699 ntTSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.4 ms