Protein–RNA interactions for Protein: D3Z1V9

Defa28, Defensin, alpha, 28, mousemouse

Predictions only

Length 94 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Defa28D3Z1V9 Gm43134-201ENSMUST00000199434 1886 ntBASIC9.05□□□□□ -0.96
Defa28D3Z1V9 Lims2-201ENSMUST00000025254 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
Defa28D3Z1V9 Tpm1-214ENSMUST00000113701 1677 ntTSL 5 BASIC9.05□□□□□ -0.96
Defa28D3Z1V9 Pdia2-202ENSMUST00000120333 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
Defa28D3Z1V9 Scml2-206ENSMUST00000112345 4847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.05□□□□□ -0.96
Defa28D3Z1V9 Rcn3-201ENSMUST00000019683 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
Defa28D3Z1V9 Rcn3-208ENSMUST00000211352 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
Defa28D3Z1V9 Sdhb-201ENSMUST00000010007 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
Defa28D3Z1V9 1700020A23Rik-202ENSMUST00000110281 521 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.05□□□□□ -0.96
Defa28D3Z1V9 Pgam1-ps2-201ENSMUST00000117129 765 ntBASIC9.05□□□□□ -0.96
Defa28D3Z1V9 Gm6184-201ENSMUST00000120403 1261 ntBASIC9.05□□□□□ -0.96
Defa28D3Z1V9 Gm11455-201ENSMUST00000149285 733 ntTSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
Defa28D3Z1V9 Snx15-207ENSMUST00000154601 767 ntTSL 5 BASIC9.05□□□□□ -0.96
Defa28D3Z1V9 Hectd2-208ENSMUST00000169036 3842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
Defa28D3Z1V9 Tbc1d7-202ENSMUST00000179852 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
Defa28D3Z1V9 Gm6550-201ENSMUST00000187574 993 ntBASIC9.05□□□□□ -0.96
Defa28D3Z1V9 Gm29629-201ENSMUST00000187926 386 ntTSL 3 BASIC9.05□□□□□ -0.96
Defa28D3Z1V9 Gm45167-201ENSMUST00000208007 322 ntBASIC9.05□□□□□ -0.96
Defa28D3Z1V9 Fosb-206ENSMUST00000208446 1090 ntTSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
Defa28D3Z1V9 AC148328.1-201ENSMUST00000216448 920 ntTSL 5 BASIC9.05□□□□□ -0.96
Defa28D3Z1V9 AC159106.1-201ENSMUST00000224421 690 ntBASIC9.05□□□□□ -0.96
Defa28D3Z1V9 Gsdmcl1-201ENSMUST00000071847 1133 ntTSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
Defa28D3Z1V9 Pus7-201ENSMUST00000119946 3407 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
Defa28D3Z1V9 Cadm2-202ENSMUST00000120594 3248 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.05□□□□□ -0.96
Defa28D3Z1V9 Wars-201ENSMUST00000109848 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
Defa28D3Z1V9 Cad-204ENSMUST00000201182 6529 ntTSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
Defa28D3Z1V9 Ccdc162-203ENSMUST00000099932 2742 ntTSL 5 BASIC9.05□□□□□ -0.96
Defa28D3Z1V9 Myo15-202ENSMUST00000081823 7953 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.05□□□□□ -0.96
Defa28D3Z1V9 Pofut1-201ENSMUST00000049863 5600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
Defa28D3Z1V9 Tram1l1-201ENSMUST00000058994 3889 ntAPPRIS P1 BASIC9.05□□□□□ -0.96
Defa28D3Z1V9 Armcx1-206ENSMUST00000113201 2228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.05□□□□□ -0.96
Defa28D3Z1V9 Pdk2-201ENSMUST00000038431 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
Defa28D3Z1V9 Cald1-201ENSMUST00000031775 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.05□□□□□ -0.96
Defa28D3Z1V9 1700012B07Rik-202ENSMUST00000106674 2035 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
Defa28D3Z1V9 Trim26-201ENSMUST00000053434 3198 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
Defa28D3Z1V9 Atxn1-201ENSMUST00000091628 10569 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
Defa28D3Z1V9 Nin-201ENSMUST00000021468 6708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
Defa28D3Z1V9 Kcnn1-204ENSMUST00000212086 2964 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
Defa28D3Z1V9 Hnrnph2-201ENSMUST00000050331 1701 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.05□□□□□ -0.96
Defa28D3Z1V9 Prex1-202ENSMUST00000099080 5818 ntTSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
Defa28D3Z1V9 Zfp108-203ENSMUST00000206777 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
Defa28D3Z1V9 Wsb1-201ENSMUST00000017821 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
Defa28D3Z1V9 Klrg1-201ENSMUST00000032207 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
Defa28D3Z1V9 Fbln7-202ENSMUST00000110324 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.05□□□□□ -0.96
Defa28D3Z1V9 Arpin-201ENSMUST00000048731 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
Defa28D3Z1V9 Rtn4-203ENSMUST00000102841 4060 ntTSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
Defa28D3Z1V9 Mgll-201ENSMUST00000089449 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
Defa28D3Z1V9 Prdm10-202ENSMUST00000117389 1952 ntTSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
Defa28D3Z1V9 Chaf1b-202ENSMUST00000117099 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.04□□□□□ -0.96
Defa28D3Z1V9 Il2rb-202ENSMUST00000163494 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
Defa28D3Z1V9 Gm39244-202ENSMUST00000210837 1857 ntTSL 5 BASIC9.04□□□□□ -0.96
Defa28D3Z1V9 Tmem218-201ENSMUST00000034632 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
Defa28D3Z1V9 BC030867-201ENSMUST00000100392 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
Defa28D3Z1V9 Fars2-208ENSMUST00000224611 1750 ntAPPRIS P1 BASIC9.04□□□□□ -0.96
Defa28D3Z1V9 Grin1-205ENSMUST00000114312 3838 ntTSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
Defa28D3Z1V9 Grin1-207ENSMUST00000114317 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
Defa28D3Z1V9 Xrcc3-201ENSMUST00000021715 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
Defa28D3Z1V9 Chrna3-201ENSMUST00000034851 4358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
Defa28D3Z1V9 Astl-204ENSMUST00000179618 2236 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
Defa28D3Z1V9 Gjb1-201ENSMUST00000052130 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
Defa28D3Z1V9 Tepsin-201ENSMUST00000026442 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
Defa28D3Z1V9 Mbp-207ENSMUST00000114674 2108 ntTSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
Defa28D3Z1V9 Tspan5-202ENSMUST00000119993 2107 ntTSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
Defa28D3Z1V9 Wdr73-201ENSMUST00000026816 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
Defa28D3Z1V9 Plekha1-201ENSMUST00000048180 3321 ntTSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
Defa28D3Z1V9 4931414P19Rik-201ENSMUST00000022786 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
Defa28D3Z1V9 Gtf2b-201ENSMUST00000029938 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
Defa28D3Z1V9 Baiap2l1-201ENSMUST00000055190 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
Defa28D3Z1V9 Zbtb7b-203ENSMUST00000107433 3650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
Defa28D3Z1V9 Spryd7-201ENSMUST00000022497 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
Defa28D3Z1V9 Ube3a-203ENSMUST00000200758 9856 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
Defa28D3Z1V9 Col6a2-201ENSMUST00000001181 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
Defa28D3Z1V9 Ly6h-207ENSMUST00000163116 2801 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC9.04□□□□□ -0.96
Defa28D3Z1V9 Rpgrip1-202ENSMUST00000111603 5380 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
Defa28D3Z1V9 Tubgcp6-201ENSMUST00000041656 5357 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.04□□□□□ -0.96
Defa28D3Z1V9 Bex1-203ENSMUST00000113120 718 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.04□□□□□ -0.96
Defa28D3Z1V9 Rhox2h-201ENSMUST00000115162 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
Defa28D3Z1V9 Ssr2-205ENSMUST00000193934 569 ntTSL 3 BASIC9.04□□□□□ -0.96
Defa28D3Z1V9 Gm20337-201ENSMUST00000219062 1118 ntTSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
Defa28D3Z1V9 Vkorc1-201ENSMUST00000033074 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
Defa28D3Z1V9 Gnptg-201ENSMUST00000038973 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
Defa28D3Z1V9 Rpl8-201ENSMUST00000004072 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
Defa28D3Z1V9 Sfxn5-202ENSMUST00000059034 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
Defa28D3Z1V9 Disp2-204ENSMUST00000110846 1732 ntTSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
Defa28D3Z1V9 Cdt1-201ENSMUST00000006760 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
Defa28D3Z1V9 Trappc5-202ENSMUST00000207787 4411 ntAPPRIS P1 BASIC9.04□□□□□ -0.96
Defa28D3Z1V9 Dnase1l2-202ENSMUST00000119932 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
Defa28D3Z1V9 Pcdh1-202ENSMUST00000159405 3880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.04□□□□□ -0.96
Defa28D3Z1V9 Wnk1-224ENSMUST00000203030 8163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
Defa28D3Z1V9 Tnfsf13-202ENSMUST00000108648 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.04□□□□□ -0.96
Defa28D3Z1V9 Malt1-202ENSMUST00000224056 4028 ntAPPRIS ALT2 BASIC9.04□□□□□ -0.96
Defa28D3Z1V9 Slc25a19-201ENSMUST00000021089 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
Defa28D3Z1V9 Wnt7b-202ENSMUST00000109424 3492 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
Defa28D3Z1V9 Rassf5-201ENSMUST00000027688 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
Defa28D3Z1V9 Nup210-201ENSMUST00000032179 7037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
Defa28D3Z1V9 Ern1-201ENSMUST00000001059 6946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
Defa28D3Z1V9 Mcf2l-217ENSMUST00000145067 5313 ntTSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
Defa28D3Z1V9 Ntng2-201ENSMUST00000048455 1770 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
Defa28D3Z1V9 Podn-202ENSMUST00000106708 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
Defa28D3Z1V9 Gm6198-201ENSMUST00000191337 2929 ntBASIC9.04□□□□□ -0.96
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 131 ms