Protein–RNA interactions for Protein: D3Z0K6

Rsbn1l, MCG120108, isoform CRA_a, mousemouse

Predictions only

Length 821 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rsbn1lD3Z0K6 Togaram2-205ENSMUST00000153445 3302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rsbn1lD3Z0K6 Rhbdl3-201ENSMUST00000017836 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rsbn1lD3Z0K6 Pam-202ENSMUST00000097625 4102 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rsbn1lD3Z0K6 Clcf1-201ENSMUST00000046506 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rsbn1lD3Z0K6 Dlx6-202ENSMUST00000160937 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rsbn1lD3Z0K6 Mpp4-210ENSMUST00000191200 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rsbn1lD3Z0K6 Pigg-201ENSMUST00000031189 3427 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rsbn1lD3Z0K6 Gm12859-201ENSMUST00000117834 427 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Rsbn1lD3Z0K6 Snap47-202ENSMUST00000120940 1192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rsbn1lD3Z0K6 Gm15491-201ENSMUST00000133963 751 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rsbn1lD3Z0K6 Gm20499-201ENSMUST00000140374 444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rsbn1lD3Z0K6 1700022A21Rik-201ENSMUST00000182745 1051 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Rsbn1lD3Z0K6 Gm27772-201ENSMUST00000184900 187 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Rsbn1lD3Z0K6 Gm36979-201ENSMUST00000193616 539 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rsbn1lD3Z0K6 Gm44719-201ENSMUST00000206404 149 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Rsbn1lD3Z0K6 Lcmt1-204ENSMUST00000206574 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rsbn1lD3Z0K6 AC131997.1-201ENSMUST00000228611 1229 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Rsbn1lD3Z0K6 Rps11-201ENSMUST00000003521 661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rsbn1lD3Z0K6 Rhbdl2-201ENSMUST00000053202 1217 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rsbn1lD3Z0K6 Col7a1-201ENSMUST00000026740 9198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rsbn1lD3Z0K6 Col1a1-201ENSMUST00000001547 5930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rsbn1lD3Z0K6 Fstl5-201ENSMUST00000038364 5107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rsbn1lD3Z0K6 Wdfy3-206ENSMUST00000174698 3858 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rsbn1lD3Z0K6 Tm7sf2-203ENSMUST00000159084 1351 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rsbn1lD3Z0K6 4931428F04Rik-203ENSMUST00000212219 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rsbn1lD3Z0K6 Fgfr3-201ENSMUST00000067150 4218 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Rsbn1lD3Z0K6 Lancl1-202ENSMUST00000113979 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Rsbn1lD3Z0K6 Srr-204ENSMUST00000121738 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Rsbn1lD3Z0K6 Gstcd-202ENSMUST00000080583 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Rsbn1lD3Z0K6 Degs2-202ENSMUST00000167978 1729 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Rsbn1lD3Z0K6 Mfap4-202ENSMUST00000064783 1722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Rsbn1lD3Z0K6 Rnf135-201ENSMUST00000017839 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rsbn1lD3Z0K6 Dlg1-201ENSMUST00000023454 3725 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rsbn1lD3Z0K6 Cpeb4-201ENSMUST00000020543 2312 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rsbn1lD3Z0K6 Rwdd4a-201ENSMUST00000033973 2921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rsbn1lD3Z0K6 AI480526-202ENSMUST00000159637 1697 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rsbn1lD3Z0K6 Prmt2-201ENSMUST00000020452 2016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rsbn1lD3Z0K6 Itpripl1-203ENSMUST00000154021 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rsbn1lD3Z0K6 Arf5-202ENSMUST00000169841 768 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rsbn1lD3Z0K6 Gm30906-201ENSMUST00000219578 535 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rsbn1lD3Z0K6 Prorsd1-201ENSMUST00000039900 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rsbn1lD3Z0K6 Tmem242-201ENSMUST00000005053 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rsbn1lD3Z0K6 Car5a-201ENSMUST00000057653 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rsbn1lD3Z0K6 Cldn13-201ENSMUST00000008987 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rsbn1lD3Z0K6 6430531B16Rik-201ENSMUST00000097970 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rsbn1lD3Z0K6 Rnf168-201ENSMUST00000014218 3932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rsbn1lD3Z0K6 Serpinb2-201ENSMUST00000009356 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rsbn1lD3Z0K6 Bend7-201ENSMUST00000056914 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rsbn1lD3Z0K6 Morc4-202ENSMUST00000087401 3862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rsbn1lD3Z0K6 Rnf224-202ENSMUST00000205192 1707 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rsbn1lD3Z0K6 Plekhb1-201ENSMUST00000079176 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rsbn1lD3Z0K6 Cyp2ab1-205ENSMUST00000182741 1497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rsbn1lD3Z0K6 Ank-201ENSMUST00000022875 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rsbn1lD3Z0K6 Pank1-201ENSMUST00000036584 3460 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rsbn1lD3Z0K6 Zfp568-203ENSMUST00000148442 4005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rsbn1lD3Z0K6 Fam57b-203ENSMUST00000205324 1915 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rsbn1lD3Z0K6 G3bp2-203ENSMUST00000167918 4232 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rsbn1lD3Z0K6 Sectm1a-203ENSMUST00000106119 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rsbn1lD3Z0K6 Kdm5c-202ENSMUST00000112584 5900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rsbn1lD3Z0K6 1700029H14Rik-205ENSMUST00000187391 1408 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rsbn1lD3Z0K6 Arpc1b-201ENSMUST00000085679 3105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rsbn1lD3Z0K6 Ptprn2-201ENSMUST00000070733 3201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rsbn1lD3Z0K6 Igf2-202ENSMUST00000097936 2503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rsbn1lD3Z0K6 Gm29358-201ENSMUST00000186510 1734 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rsbn1lD3Z0K6 Ighv5-17-201ENSMUST00000103459 405 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rsbn1lD3Z0K6 Bola2-202ENSMUST00000106369 642 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rsbn1lD3Z0K6 Mrpl53-201ENSMUST00000113938 695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rsbn1lD3Z0K6 Pttg1ip-205ENSMUST00000162429 652 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rsbn1lD3Z0K6 Il11-202ENSMUST00000163481 990 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rsbn1lD3Z0K6 Gm5354-201ENSMUST00000182417 973 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Rsbn1lD3Z0K6 Gm19265-201ENSMUST00000201818 894 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rsbn1lD3Z0K6 AC135669.1-201ENSMUST00000213585 412 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Rsbn1lD3Z0K6 AI463170-203ENSMUST00000219353 430 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rsbn1lD3Z0K6 AC099934.3-201ENSMUST00000223192 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rsbn1lD3Z0K6 Aga-201ENSMUST00000033920 1181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rsbn1lD3Z0K6 Smim11-201ENSMUST00000063641 517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rsbn1lD3Z0K6 Ppig-201ENSMUST00000040915 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rsbn1lD3Z0K6 Ppip5k2-201ENSMUST00000042509 5882 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rsbn1lD3Z0K6 Arhgef1-203ENSMUST00000117419 3214 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rsbn1lD3Z0K6 Rnf150-201ENSMUST00000078525 9682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rsbn1lD3Z0K6 Car6-202ENSMUST00000105683 1460 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rsbn1lD3Z0K6 Sacs-201ENSMUST00000089394 3345 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rsbn1lD3Z0K6 Bpifa6-201ENSMUST00000109753 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rsbn1lD3Z0K6 Cd3eap-201ENSMUST00000047036 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rsbn1lD3Z0K6 Zkscan4-201ENSMUST00000062609 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rsbn1lD3Z0K6 Safb2-201ENSMUST00000075510 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rsbn1lD3Z0K6 Skap1-205ENSMUST00000107662 1861 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rsbn1lD3Z0K6 Gm12626-201ENSMUST00000117339 1983 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Rsbn1lD3Z0K6 Gm12623-201ENSMUST00000119849 1983 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Rsbn1lD3Z0K6 Slc12a8-202ENSMUST00000117134 2081 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rsbn1lD3Z0K6 Wisp3-201ENSMUST00000076713 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rsbn1lD3Z0K6 Ccdc85a-201ENSMUST00000042534 5332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rsbn1lD3Z0K6 Sipa1-203ENSMUST00000164304 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rsbn1lD3Z0K6 Syngap1-202ENSMUST00000177932 3927 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rsbn1lD3Z0K6 Ccny-201ENSMUST00000053917 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rsbn1lD3Z0K6 Peli3-202ENSMUST00000120475 2988 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rsbn1lD3Z0K6 Fgfr3-210ENSMUST00000169212 4245 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rsbn1lD3Z0K6 Plch2-208ENSMUST00000145662 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rsbn1lD3Z0K6 Arid4b-203ENSMUST00000110534 5864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rsbn1lD3Z0K6 Fbxo10-201ENSMUST00000052236 4635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.6 ms