Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z321

Top3b, DNA topoisomerase 3-beta-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 862 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Top3bQ9Z321 Irf7-203ENSMUST00000106023 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Top3bQ9Z321 Rgs6-203ENSMUST00000185665 2201 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Top3bQ9Z321 Vasp-201ENSMUST00000032561 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Top3bQ9Z321 Wwox-202ENSMUST00000109107 2383 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Top3bQ9Z321 Sohlh2-201ENSMUST00000029369 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Top3bQ9Z321 Sema4b-204ENSMUST00000205822 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Top3bQ9Z321 Mtcl1-211ENSMUST00000177034 5441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Top3bQ9Z321 Slc8a2-202ENSMUST00000211649 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Top3bQ9Z321 Ctu2-201ENSMUST00000116412 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Top3bQ9Z321 Scarf1-202ENSMUST00000118243 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Top3bQ9Z321 Slc5a2-202ENSMUST00000118169 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Top3bQ9Z321 Il18r1-203ENSMUST00000167723 1919 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Top3bQ9Z321 Tpm1-202ENSMUST00000034928 1824 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Top3bQ9Z321 Cdcp2-202ENSMUST00000221740 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Top3bQ9Z321 Zfp606-201ENSMUST00000098822 4748 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Top3bQ9Z321 Gm5912-201ENSMUST00000122282 1438 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Top3bQ9Z321 Trav3d-3-201ENSMUST00000103599 276 ntAPPRIS P1 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Top3bQ9Z321 Trav3n-3-201ENSMUST00000103625 276 ntAPPRIS P1 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Top3bQ9Z321 Nedd8-201ENSMUST00000010520 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Top3bQ9Z321 Gm5940-201ENSMUST00000117582 1068 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Top3bQ9Z321 Rapgef3os2-201ENSMUST00000124374 920 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Top3bQ9Z321 Trav3-3-202ENSMUST00000183835 276 ntAPPRIS P1 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Top3bQ9Z321 Swi5-207ENSMUST00000183946 768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Top3bQ9Z321 Sftpa1-201ENSMUST00000022314 851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Top3bQ9Z321 Gm7399-201ENSMUST00000032395 858 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Top3bQ9Z321 Gpr31b-201ENSMUST00000091648 960 ntAPPRIS P1 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Top3bQ9Z321 Tpd52-204ENSMUST00000094381 1074 ntTSL 3 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Top3bQ9Z321 Arrdc5-201ENSMUST00000097303 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Top3bQ9Z321 Il6ra-202ENSMUST00000197679 8639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Top3bQ9Z321 Ss18-201ENSMUST00000040924 3090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Top3bQ9Z321 Loxl2-202ENSMUST00000100420 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Top3bQ9Z321 Col4a1-201ENSMUST00000033898 6615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Top3bQ9Z321 Wnt3a-201ENSMUST00000010044 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Top3bQ9Z321 Ctps-201ENSMUST00000030381 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Top3bQ9Z321 Pou2f3-202ENSMUST00000176636 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Top3bQ9Z321 Itsn1-202ENSMUST00000064797 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Top3bQ9Z321 Spg20-204ENSMUST00000118118 3981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Top3bQ9Z321 Ociad2-205ENSMUST00000201908 2378 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Top3bQ9Z321 AC166491.1-201ENSMUST00000227053 2308 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Top3bQ9Z321 Lrrc14-210ENSMUST00000155735 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Top3bQ9Z321 Mrap2-202ENSMUST00000113149 2112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Top3bQ9Z321 Frmd4b-203ENSMUST00000113355 4913 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Top3bQ9Z321 Cox16-201ENSMUST00000002757 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Top3bQ9Z321 Klhl12-203ENSMUST00000116528 3277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Top3bQ9Z321 Sesn3-201ENSMUST00000034507 1827 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Top3bQ9Z321 Abi3-201ENSMUST00000059026 4006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Top3bQ9Z321 Ccdc190-201ENSMUST00000094348 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Top3bQ9Z321 Pramel1-201ENSMUST00000037419 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Top3bQ9Z321 Cep126-201ENSMUST00000037397 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Top3bQ9Z321 Kat8-201ENSMUST00000033070 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Top3bQ9Z321 Gm14451-201ENSMUST00000121581 1542 ntBASIC14.52□□□□□ -0.08
Top3bQ9Z321 Specc1-209ENSMUST00000201671 2523 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Top3bQ9Z321 Clstn1-202ENSMUST00000105691 4459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Top3bQ9Z321 Nck1-202ENSMUST00000116522 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Top3bQ9Z321 Acrbp-205ENSMUST00000112414 1498 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Top3bQ9Z321 Hyou1-201ENSMUST00000066601 4432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Top3bQ9Z321 Ptp4a2-207ENSMUST00000165853 3382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Top3bQ9Z321 Clcc1-201ENSMUST00000029483 2224 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Top3bQ9Z321 Htr2c-203ENSMUST00000112831 809 ntTSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Top3bQ9Z321 Gm15236-201ENSMUST00000117309 379 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Top3bQ9Z321 Hemk1-202ENSMUST00000118051 453 ntTSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Top3bQ9Z321 Gm11615-201ENSMUST00000156205 818 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Top3bQ9Z321 Gm16282-201ENSMUST00000162641 451 ntTSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Top3bQ9Z321 Gm29585-201ENSMUST00000185270 514 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Top3bQ9Z321 Gm38230-201ENSMUST00000193572 1159 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Top3bQ9Z321 Gm34086-201ENSMUST00000196486 743 ntTSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Top3bQ9Z321 Aqp10-ps-201ENSMUST00000199555 611 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Top3bQ9Z321 Rad51d-202ENSMUST00000021033 1201 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Top3bQ9Z321 Gm29154-230ENSMUST00000215044 1165 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Top3bQ9Z321 Oit1-201ENSMUST00000022269 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Top3bQ9Z321 Tbc1d16-203ENSMUST00000207655 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Top3bQ9Z321 Pglyrp2-201ENSMUST00000114455 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Top3bQ9Z321 Ankrd34b-203ENSMUST00000168871 3397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Top3bQ9Z321 Gm10110-201ENSMUST00000081204 1891 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Top3bQ9Z321 Ror2-201ENSMUST00000021918 3985 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Top3bQ9Z321 Kdm5c-202ENSMUST00000112584 5900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Top3bQ9Z321 Fbxw7-204ENSMUST00000107679 4473 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Top3bQ9Z321 Ubiad1-201ENSMUST00000051633 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Top3bQ9Z321 Krt71-201ENSMUST00000023710 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Top3bQ9Z321 Bcat2-202ENSMUST00000120864 1536 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Top3bQ9Z321 9330020H09Rik-201ENSMUST00000163781 2147 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Top3bQ9Z321 Fzd7-201ENSMUST00000114246 4532 ntAPPRIS P1 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Top3bQ9Z321 Ppia-206ENSMUST00000213200 1450 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Top3bQ9Z321 Dhrs1-201ENSMUST00000002403 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Top3bQ9Z321 Yod1-201ENSMUST00000049813 6128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Top3bQ9Z321 Gm36065-202ENSMUST00000219654 1424 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Top3bQ9Z321 Phtf2-201ENSMUST00000118174 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Top3bQ9Z321 Rasl12-202ENSMUST00000165682 1903 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Top3bQ9Z321 Gm38391-201ENSMUST00000191720 4069 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Top3bQ9Z321 5730559C18Rik-201ENSMUST00000120339 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Top3bQ9Z321 Trim24-203ENSMUST00000120428 3940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Top3bQ9Z321 Dnajc5-202ENSMUST00000108796 934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Top3bQ9Z321 Gm12176-201ENSMUST00000121420 875 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Top3bQ9Z321 Mir1894-201ENSMUST00000122802 81 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Top3bQ9Z321 Mir7654-201ENSMUST00000185082 70 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Top3bQ9Z321 Lsmem2-201ENSMUST00000191791 369 ntTSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Top3bQ9Z321 Gm32926-202ENSMUST00000215162 1176 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Top3bQ9Z321 Gm36634-201ENSMUST00000218356 1259 ntTSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Top3bQ9Z321 S100a7a-201ENSMUST00000079286 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Top3bQ9Z321 Polr2g-201ENSMUST00000096261 868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
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