Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZS0

Col4a3, Collagen alpha-3(IV) chain, mousemouse

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Length 1,669 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col4a3Q9QZS0 Gm43423-201ENSMUST00000198390 2094 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Col4a3Q9QZS0 Rnase10-201ENSMUST00000022424 1629 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Col4a3Q9QZS0 Gm45684-201ENSMUST00000210244 1571 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Col4a3Q9QZS0 Rbm34-201ENSMUST00000045994 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Col4a3Q9QZS0 Prr33-201ENSMUST00000054910 2251 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Col4a3Q9QZS0 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Col4a3Q9QZS0 Tmed9-203ENSMUST00000224741 1450 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Col4a3Q9QZS0 Zbtb7b-204ENSMUST00000107435 4333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
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Col4a3Q9QZS0 Ifi35-201ENSMUST00000010502 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Col4a3Q9QZS0 Gm33195-201ENSMUST00000220827 2337 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Col4a3Q9QZS0 Dlk1-204ENSMUST00000109843 1300 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Col4a3Q9QZS0 Gm5620-201ENSMUST00000077991 1348 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Col4a3Q9QZS0 Lime1-201ENSMUST00000048077 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Col4a3Q9QZS0 Prkcd-203ENSMUST00000112203 1927 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Col4a3Q9QZS0 Bin2-205ENSMUST00000182814 1901 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Col4a3Q9QZS0 Gm15198-201ENSMUST00000117283 177 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Col4a3Q9QZS0 6330418K02Rik-201ENSMUST00000124298 743 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Col4a3Q9QZS0 Gm15635-202ENSMUST00000131160 917 ntTSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Col4a3Q9QZS0 1600014C23Rik-201ENSMUST00000178179 518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Col4a3Q9QZS0 Gm5370-201ENSMUST00000187187 574 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Col4a3Q9QZS0 Tyms-ps-201ENSMUST00000219550 915 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Col4a3Q9QZS0 CU024892.2-201ENSMUST00000224608 832 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Col4a3Q9QZS0 St13-201ENSMUST00000023039 1089 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Col4a3Q9QZS0 Rrp36-201ENSMUST00000024766 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Col4a3Q9QZS0 S100a8-201ENSMUST00000069927 486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Col4a3Q9QZS0 Ccdc33-202ENSMUST00000098681 1093 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Col4a3Q9QZS0 Fubp1-206ENSMUST00000196739 2526 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Col4a3Q9QZS0 Amz2-202ENSMUST00000092500 2816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Col4a3Q9QZS0 Inppl1-201ENSMUST00000035836 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Col4a3Q9QZS0 Eda-209ENSMUST00000113783 4930 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Col4a3Q9QZS0 Ctu2-201ENSMUST00000116412 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Col4a3Q9QZS0 Gm4219-201ENSMUST00000168140 2143 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Col4a3Q9QZS0 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Col4a3Q9QZS0 Rinl-206ENSMUST00000209035 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Col4a3Q9QZS0 Gm2155-201ENSMUST00000181581 1974 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Col4a3Q9QZS0 Krt32-201ENSMUST00000107419 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Col4a3Q9QZS0 Rfx5-201ENSMUST00000029772 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Col4a3Q9QZS0 Usp43-202ENSMUST00000108677 4447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Col4a3Q9QZS0 Ado-201ENSMUST00000075686 4445 ntAPPRIS P1 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Col4a3Q9QZS0 Grtp1-206ENSMUST00000210317 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Col4a3Q9QZS0 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Col4a3Q9QZS0 Foxq1-201ENSMUST00000042118 4843 ntAPPRIS P1 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Col4a3Q9QZS0 Rps8-201ENSMUST00000102696 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Col4a3Q9QZS0 Emd-204ENSMUST00000119197 768 ntTSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Col4a3Q9QZS0 Ict1os-201ENSMUST00000125653 1052 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Col4a3Q9QZS0 Gm11754-201ENSMUST00000156576 661 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Col4a3Q9QZS0 Gm16282-201ENSMUST00000162641 451 ntTSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Col4a3Q9QZS0 Crb3-204ENSMUST00000163763 868 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Col4a3Q9QZS0 Fkbp2-202ENSMUST00000177752 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Col4a3Q9QZS0 Mturn-202ENSMUST00000187701 503 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Col4a3Q9QZS0 Gm19184-201ENSMUST00000196798 928 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Col4a3Q9QZS0 H2afv-201ENSMUST00000093346 519 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
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Col4a3Q9QZS0 Ddx51-201ENSMUST00000031478 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
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Col4a3Q9QZS0 Gpr12-203ENSMUST00000197431 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Col4a3Q9QZS0 Prpf3-201ENSMUST00000015892 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Col4a3Q9QZS0 Slamf8-201ENSMUST00000065679 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Col4a3Q9QZS0 Sesn1-201ENSMUST00000041438 2600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
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Col4a3Q9QZS0 Rbbp5-206ENSMUST00000190825 2456 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Col4a3Q9QZS0 Trim24-203ENSMUST00000120428 3940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
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Col4a3Q9QZS0 Gm43818-201ENSMUST00000200605 466 ntBASIC14.71□□□□□ -0.06
Col4a3Q9QZS0 Timm10-201ENSMUST00000028470 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Col4a3Q9QZS0 Ccdc113-201ENSMUST00000041569 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Col4a3Q9QZS0 Alas1-201ENSMUST00000074082 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Col4a3Q9QZS0 Rpl36-201ENSMUST00000080492 404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Col4a3Q9QZS0 Axdnd1-204ENSMUST00000178036 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.06
Col4a3Q9QZS0 Edil3-203ENSMUST00000118731 2721 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Col4a3Q9QZS0 Mutyh-201ENSMUST00000102699 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Col4a3Q9QZS0 Cnih4-203ENSMUST00000111059 3127 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Col4a3Q9QZS0 Asb10-202ENSMUST00000117900 1432 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Col4a3Q9QZS0 AC153938.1-201ENSMUST00000220354 1425 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Col4a3Q9QZS0 4933431E20Rik-209ENSMUST00000146337 1636 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Col4a3Q9QZS0 Ncln-202ENSMUST00000118498 2841 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Col4a3Q9QZS0 P4ha1-202ENSMUST00000092512 2387 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Col4a3Q9QZS0 Kcnab2-203ENSMUST00000159186 1552 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Col4a3Q9QZS0 Zxdc-202ENSMUST00000075117 4126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Col4a3Q9QZS0 Gm996-203ENSMUST00000188161 2925 ntAPPRIS P1 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Col4a3Q9QZS0 Tmem198b-201ENSMUST00000051011 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Col4a3Q9QZS0 Trim80-201ENSMUST00000093914 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Col4a3Q9QZS0 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Col4a3Q9QZS0 Kifc5c-ps-201ENSMUST00000179040 1530 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Col4a3Q9QZS0 4930556M19Rik-201ENSMUST00000180604 2468 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Col4a3Q9QZS0 Os9-201ENSMUST00000080975 2458 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Col4a3Q9QZS0 Apol8-202ENSMUST00000089450 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Col4a3Q9QZS0 Arhgef1-203ENSMUST00000117419 3214 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Col4a3Q9QZS0 Acsl6-201ENSMUST00000000145 2297 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Col4a3Q9QZS0 Hoxb9-202ENSMUST00000174042 2269 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Col4a3Q9QZS0 Micu1-202ENSMUST00000092508 2294 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
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