Protein–RNA interactions for Protein: Q9D5U5

Pudp, Pseudouridine-5'-phosphatase, mousemouse

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Length 234 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PudpQ9D5U5 Grip1-212ENSMUST00000147356 4145 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
PudpQ9D5U5 Auts2-208ENSMUST00000161374 4216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
PudpQ9D5U5 Zfp672-204ENSMUST00000108829 3094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
PudpQ9D5U5 Uhrf1bp1-201ENSMUST00000114849 8584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
PudpQ9D5U5 Sec61a2-209ENSMUST00000193792 2110 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
PudpQ9D5U5 Gnb1l-211ENSMUST00000167778 3569 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
PudpQ9D5U5 Ctbp1-212ENSMUST00000202962 3595 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
PudpQ9D5U5 Wdr13-205ENSMUST00000130832 4374 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
PudpQ9D5U5 Ggt7-201ENSMUST00000029131 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
PudpQ9D5U5 Cxcr5-204ENSMUST00000215293 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
PudpQ9D5U5 Grb10-201ENSMUST00000093321 5061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
PudpQ9D5U5 Ppl-201ENSMUST00000035672 6277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
PudpQ9D5U5 Plekhb1-202ENSMUST00000107043 931 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
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PudpQ9D5U5 Rps13-ps5-201ENSMUST00000117939 456 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
PudpQ9D5U5 Med28-202ENSMUST00000118833 734 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
PudpQ9D5U5 Gm15483-201ENSMUST00000120338 456 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
PudpQ9D5U5 Cmc2-202ENSMUST00000128304 394 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
PudpQ9D5U5 Gm40123-201ENSMUST00000198175 1027 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
PudpQ9D5U5 Dcun1d3-203ENSMUST00000106519 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
PudpQ9D5U5 Maged2-203ENSMUST00000112699 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
PudpQ9D5U5 Haus5-201ENSMUST00000019697 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
PudpQ9D5U5 D630023F18Rik-201ENSMUST00000050047 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
PudpQ9D5U5 Rreb1-202ENSMUST00000110237 4617 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
PudpQ9D5U5 Adgrg3-201ENSMUST00000051259 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
PudpQ9D5U5 Gm42748-201ENSMUST00000199354 2341 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
PudpQ9D5U5 Gdap1l1-201ENSMUST00000018087 2220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
PudpQ9D5U5 Ppp1r8-201ENSMUST00000030702 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
PudpQ9D5U5 Bace1-201ENSMUST00000034591 6058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
PudpQ9D5U5 Fbxo15-204ENSMUST00000224467 1908 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
PudpQ9D5U5 Gm16090-201ENSMUST00000130296 1704 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
PudpQ9D5U5 Ldlrad3-201ENSMUST00000058790 3833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
PudpQ9D5U5 Cndp2-202ENSMUST00000168419 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
PudpQ9D5U5 Nphs2-201ENSMUST00000027896 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
PudpQ9D5U5 Zbtb49-202ENSMUST00000114113 2645 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
PudpQ9D5U5 Trim32-202ENSMUST00000107366 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
PudpQ9D5U5 Nsg2-201ENSMUST00000020537 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
PudpQ9D5U5 Rab37-201ENSMUST00000021076 2210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
PudpQ9D5U5 Mmp2-201ENSMUST00000034187 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
PudpQ9D5U5 Tbx3-203ENSMUST00000121021 4777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
PudpQ9D5U5 Crem-221ENSMUST00000142690 1256 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
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PudpQ9D5U5 6030443J06Rik-204ENSMUST00000195898 786 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
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PudpQ9D5U5 Rhpn1-201ENSMUST00000023244 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
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PudpQ9D5U5 Ankrd61-201ENSMUST00000079624 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
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PudpQ9D5U5 Pcolce-201ENSMUST00000031731 1626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
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PudpQ9D5U5 Gm27198-201ENSMUST00000184172 1517 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
PudpQ9D5U5 S1pr3-201ENSMUST00000087978 4463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
PudpQ9D5U5 Rab3d-201ENSMUST00000115351 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
PudpQ9D5U5 Gm26867-201ENSMUST00000180963 3615 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
PudpQ9D5U5 Frzb-201ENSMUST00000028389 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
PudpQ9D5U5 Gm20743-201ENSMUST00000191735 1576 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
PudpQ9D5U5 Mlkl-201ENSMUST00000056157 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
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PudpQ9D5U5 Sema4a-214ENSMUST00000166237 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
PudpQ9D5U5 Reln-201ENSMUST00000062372 10885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
PudpQ9D5U5 A530072M11Rik-201ENSMUST00000151122 1852 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
PudpQ9D5U5 E430024P14Rik-203ENSMUST00000160545 2833 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
PudpQ9D5U5 Gm26847-201ENSMUST00000180407 2109 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
PudpQ9D5U5 A430093F15Rik-204ENSMUST00000186596 2115 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
PudpQ9D5U5 Dab2ip-206ENSMUST00000112987 6287 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
PudpQ9D5U5 Upk1a-201ENSMUST00000006476 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
PudpQ9D5U5 Gpsm1-204ENSMUST00000114134 2043 ntTSL 3 BASIC13.37□□□□□ -0.27
PudpQ9D5U5 Kcnj9-202ENSMUST00000194204 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
PudpQ9D5U5 Daglb-201ENSMUST00000045593 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
PudpQ9D5U5 Alx4-202ENSMUST00000111254 7056 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
PudpQ9D5U5 Ptbp2-201ENSMUST00000029780 3364 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
PudpQ9D5U5 Ntrk2-204ENSMUST00000224259 3049 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
PudpQ9D5U5 Ahi1-201ENSMUST00000105525 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
PudpQ9D5U5 Zyx-202ENSMUST00000164375 3188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
PudpQ9D5U5 Trpm4-209ENSMUST00000211743 3673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
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