Protein–RNA interactions for Protein: Q9CZH8

Ccdc77, Coiled-coil domain-containing protein 77, mousemouse

Predictions only

Length 489 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc77Q9CZH8 Gm31727-201ENSMUST00000210102 360 ntTSL 3 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Ccdc77Q9CZH8 Bloc1s5-203ENSMUST00000224902 612 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
Ccdc77Q9CZH8 Il17rd-203ENSMUST00000225146 3366 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
Ccdc77Q9CZH8 Mbl1-202ENSMUST00000225792 1563 ntAPPRIS P1 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Ccdc77Q9CZH8 Mbnl2-204ENSMUST00000227012 2390 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
Ccdc77Q9CZH8 Msrb2-201ENSMUST00000023856 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Ccdc77Q9CZH8 Stip1-201ENSMUST00000025918 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Ccdc77Q9CZH8 Fam192a-201ENSMUST00000034226 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Ccdc77Q9CZH8 Hnrnpul1-201ENSMUST00000043765 3354 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Ccdc77Q9CZH8 Tspo-201ENSMUST00000047419 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Ccdc77Q9CZH8 Gdf6-201ENSMUST00000057613 3532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Ccdc77Q9CZH8 Xrcc1-201ENSMUST00000063249 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Ccdc77Q9CZH8 1700086L19Rik-201ENSMUST00000095617 706 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
Ccdc77Q9CZH8 Ip6k1-201ENSMUST00000035214 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Ccdc77Q9CZH8 Grin1-204ENSMUST00000114310 4276 ntTSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Ccdc77Q9CZH8 Nek7-201ENSMUST00000027642 3737 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Ccdc77Q9CZH8 Vcpip1-201ENSMUST00000057438 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Ccdc77Q9CZH8 Grtp1-206ENSMUST00000210317 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Ccdc77Q9CZH8 Kcna5-201ENSMUST00000060972 2862 ntAPPRIS P1 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Ccdc77Q9CZH8 Dusp6-201ENSMUST00000020118 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Ccdc77Q9CZH8 Il12rb1-205ENSMUST00000212657 2741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Ccdc77Q9CZH8 Gm5639-201ENSMUST00000122305 2403 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Ccdc77Q9CZH8 Olfr322-202ENSMUST00000213232 4632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Ccdc77Q9CZH8 Gm37644-201ENSMUST00000192190 2270 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Ccdc77Q9CZH8 Osm-201ENSMUST00000075221 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Ccdc77Q9CZH8 Rab37-201ENSMUST00000021076 2210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Ccdc77Q9CZH8 Myh2-203ENSMUST00000170159 6083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Ccdc77Q9CZH8 Rad9a-201ENSMUST00000025740 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Ccdc77Q9CZH8 Osbpl1a-201ENSMUST00000074352 3956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Ccdc77Q9CZH8 Gm12626-201ENSMUST00000117339 1983 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Ccdc77Q9CZH8 Gm12623-201ENSMUST00000119849 1983 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Ccdc77Q9CZH8 Sema6c-201ENSMUST00000090821 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Ccdc77Q9CZH8 Aire-213ENSMUST00000148469 1618 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Ccdc77Q9CZH8 Cdcp2-202ENSMUST00000221740 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Ccdc77Q9CZH8 Eif4a3-201ENSMUST00000026667 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Ccdc77Q9CZH8 Ywhab-201ENSMUST00000018470 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Ccdc77Q9CZH8 Clec11a-201ENSMUST00000004587 2978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Ccdc77Q9CZH8 Ifnz-201ENSMUST00000105144 1462 ntAPPRIS P1 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Ccdc77Q9CZH8 Arhgap8-205ENSMUST00000168811 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Ccdc77Q9CZH8 C920006O11Rik-201ENSMUST00000180974 1444 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Ccdc77Q9CZH8 Otub2-201ENSMUST00000021620 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Ccdc77Q9CZH8 Clcn3-204ENSMUST00000110301 4099 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Ccdc77Q9CZH8 Colgalt2-201ENSMUST00000044311 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Ccdc77Q9CZH8 Mef2b-204ENSMUST00000110146 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Ccdc77Q9CZH8 Mef2b-205ENSMUST00000163756 1337 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Ccdc77Q9CZH8 Sipa1-201ENSMUST00000071857 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Ccdc77Q9CZH8 Gm12017-201ENSMUST00000122453 1003 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Ccdc77Q9CZH8 A530058N18Rik-205ENSMUST00000143993 550 ntTSL 3 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Ccdc77Q9CZH8 Mymx-202ENSMUST00000169137 616 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Ccdc77Q9CZH8 Gm20509-201ENSMUST00000174203 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Ccdc77Q9CZH8 Gm8000-201ENSMUST00000188378 592 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Ccdc77Q9CZH8 Irs3-202ENSMUST00000196511 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Ccdc77Q9CZH8 Dnal1-201ENSMUST00000046340 790 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Ccdc77Q9CZH8 Fgfr1-203ENSMUST00000119398 3789 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Ccdc77Q9CZH8 Arhgap11a-201ENSMUST00000102545 4958 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Ccdc77Q9CZH8 Sfpq-201ENSMUST00000030623 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Ccdc77Q9CZH8 Esyt3-201ENSMUST00000042158 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Ccdc77Q9CZH8 Rapgef2-201ENSMUST00000118100 6573 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Ccdc77Q9CZH8 Frzb-201ENSMUST00000028389 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Ccdc77Q9CZH8 Zeb2-211ENSMUST00000153561 2070 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Ccdc77Q9CZH8 4930579G24Rik-201ENSMUST00000029388 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Ccdc77Q9CZH8 Lime1-201ENSMUST00000048077 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Ccdc77Q9CZH8 Bend3-201ENSMUST00000040147 5882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Ccdc77Q9CZH8 Dpp8-201ENSMUST00000034960 4808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Ccdc77Q9CZH8 Epha8-201ENSMUST00000030420 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Ccdc77Q9CZH8 Mtus1-202ENSMUST00000059115 6548 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Ccdc77Q9CZH8 Slc8b1-204ENSMUST00000111890 2775 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Ccdc77Q9CZH8 Ngef-201ENSMUST00000027477 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Ccdc77Q9CZH8 Glis2-201ENSMUST00000014447 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Ccdc77Q9CZH8 Cngb1-202ENSMUST00000119870 6189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Ccdc77Q9CZH8 Tlr9-201ENSMUST00000062241 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Ccdc77Q9CZH8 Mrpl58-209ENSMUST00000153983 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Ccdc77Q9CZH8 Ctdspl2-204ENSMUST00000110578 3386 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Ccdc77Q9CZH8 Fam13b-201ENSMUST00000040506 3343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Ccdc77Q9CZH8 Gm6226-201ENSMUST00000117765 1146 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Ccdc77Q9CZH8 Rps13-ps4-201ENSMUST00000117927 456 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Ccdc77Q9CZH8 Rps13-ps5-201ENSMUST00000117939 456 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Ccdc77Q9CZH8 Gm15483-201ENSMUST00000120338 456 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Ccdc77Q9CZH8 Rpl39l-202ENSMUST00000121292 550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Ccdc77Q9CZH8 Rps27l-203ENSMUST00000127896 575 ntTSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Ccdc77Q9CZH8 Gm11025-201ENSMUST00000140773 466 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Ccdc77Q9CZH8 Tpt1-205ENSMUST00000142061 996 ntTSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Ccdc77Q9CZH8 Fam241b-208ENSMUST00000142796 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Ccdc77Q9CZH8 AC102291.3-201ENSMUST00000226566 405 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Ccdc77Q9CZH8 Pfn3-201ENSMUST00000054146 545 ntAPPRIS P1 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Ccdc77Q9CZH8 C1qtnf2-201ENSMUST00000057679 1211 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Ccdc77Q9CZH8 Phgdh-201ENSMUST00000065793 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Ccdc77Q9CZH8 Gm4981-201ENSMUST00000099726 1854 ntAPPRIS P1 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Ccdc77Q9CZH8 Xrcc3-201ENSMUST00000021715 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Ccdc77Q9CZH8 Cep68-201ENSMUST00000050611 4804 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Ccdc77Q9CZH8 Zeb2-201ENSMUST00000028229 5335 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Ccdc77Q9CZH8 Gm6159-201ENSMUST00000191249 1724 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Ccdc77Q9CZH8 Gm45638-201ENSMUST00000211507 2878 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Ccdc77Q9CZH8 Cd3d-201ENSMUST00000034602 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Ccdc77Q9CZH8 Sec61a2-209ENSMUST00000193792 2110 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Ccdc77Q9CZH8 Gm18244-201ENSMUST00000219747 1566 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Ccdc77Q9CZH8 Lzts3-202ENSMUST00000089561 4169 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Ccdc77Q9CZH8 Arap1-204ENSMUST00000107010 5147 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Ccdc77Q9CZH8 Hnrnpa2b1-210ENSMUST00000204188 1518 ntTSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Ccdc77Q9CZH8 Wdr66-202ENSMUST00000121964 4873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
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