Protein–RNA interactions for Protein: Q9CPX6

Atg3, Ubiquitin-like-conjugating enzyme ATG3, mousemouse

Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg3Q9CPX6 Slc39a8-202ENSMUST00000081978 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Atg3Q9CPX6 Shank1-203ENSMUST00000107938 9826 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Atg3Q9CPX6 Ints14-201ENSMUST00000037504 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Atg3Q9CPX6 Rnf44-201ENSMUST00000037422 3734 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Atg3Q9CPX6 Midn-201ENSMUST00000042057 3727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Atg3Q9CPX6 1700029H14Rik-205ENSMUST00000187391 1408 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Atg3Q9CPX6 Casp8ap2-201ENSMUST00000029950 6799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Atg3Q9CPX6 Iqsec1-202ENSMUST00000101153 8036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Atg3Q9CPX6 A930004D18Rik-201ENSMUST00000066163 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Atg3Q9CPX6 Fstl1-201ENSMUST00000114763 3789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Atg3Q9CPX6 Rnase10-201ENSMUST00000022424 1629 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Atg3Q9CPX6 Rhox2f-201ENSMUST00000115173 799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Atg3Q9CPX6 Mmgt2-207ENSMUST00000155759 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Atg3Q9CPX6 Gm17180-201ENSMUST00000172211 435 ntTSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Atg3Q9CPX6 Gm27501-201ENSMUST00000183599 107 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
Atg3Q9CPX6 Gm27516-201ENSMUST00000184237 98 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
Atg3Q9CPX6 Gm42929-201ENSMUST00000198374 1286 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
Atg3Q9CPX6 Gm39318-201ENSMUST00000214606 1118 ntTSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Atg3Q9CPX6 Olfr142-201ENSMUST00000099752 918 ntAPPRIS P1 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Atg3Q9CPX6 Olfr1209-201ENSMUST00000099809 933 ntAPPRIS P1 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Atg3Q9CPX6 R3hcc1-206ENSMUST00000216152 1467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Atg3Q9CPX6 Gpr18-201ENSMUST00000055475 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Atg3Q9CPX6 Cdk2-202ENSMUST00000026416 2406 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Atg3Q9CPX6 Gm14379-201ENSMUST00000128858 1878 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Atg3Q9CPX6 Tbx6-202ENSMUST00000172352 1529 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Atg3Q9CPX6 Rbmx2-201ENSMUST00000033433 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Atg3Q9CPX6 Elk3-201ENSMUST00000008542 4212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Atg3Q9CPX6 Ffar2-202ENSMUST00000163504 1913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Atg3Q9CPX6 Fam76b-201ENSMUST00000059579 3702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Atg3Q9CPX6 Luc7l3-201ENSMUST00000021226 3373 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Atg3Q9CPX6 Dhdds-204ENSMUST00000105887 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Atg3Q9CPX6 Gm12020-201ENSMUST00000119030 2042 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
Atg3Q9CPX6 Tpm1-202ENSMUST00000034928 1824 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Atg3Q9CPX6 Foxi2-201ENSMUST00000060356 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Atg3Q9CPX6 Kcnj3-203ENSMUST00000112633 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Atg3Q9CPX6 B230319C09Rik-201ENSMUST00000063376 1689 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Atg3Q9CPX6 Gm4756-202ENSMUST00000208039 2344 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Atg3Q9CPX6 Ighv7-3-201ENSMUST00000103461 361 ntAPPRIS P1 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Atg3Q9CPX6 Tmem219-203ENSMUST00000120007 1087 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Atg3Q9CPX6 6330418K02Rik-201ENSMUST00000124298 743 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Atg3Q9CPX6 Rwdd3-209ENSMUST00000170781 1111 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Atg3Q9CPX6 Gm38241-201ENSMUST00000192641 898 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
Atg3Q9CPX6 Gm43118-201ENSMUST00000199149 775 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
Atg3Q9CPX6 Gm34549-203ENSMUST00000208300 896 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Atg3Q9CPX6 4930447A16Rik-201ENSMUST00000022897 587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Atg3Q9CPX6 Hcfc1r1-201ENSMUST00000024697 946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Atg3Q9CPX6 Ier3-201ENSMUST00000003635 1131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Atg3Q9CPX6 Rpl10-202ENSMUST00000074085 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Atg3Q9CPX6 Trpt1-201ENSMUST00000088223 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Atg3Q9CPX6 Rpl10-201ENSMUST00000008826 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Atg3Q9CPX6 Pef1-202ENSMUST00000118199 1915 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Atg3Q9CPX6 Actr1b-201ENSMUST00000043951 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Atg3Q9CPX6 Art3-204ENSMUST00000119587 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Atg3Q9CPX6 Msl2-201ENSMUST00000085177 4889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Atg3Q9CPX6 Brd7-201ENSMUST00000034085 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Atg3Q9CPX6 F830212C03Rik-201ENSMUST00000191701 2285 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
Atg3Q9CPX6 Dctn1-201ENSMUST00000077407 4118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Atg3Q9CPX6 Aldh3b1-201ENSMUST00000051803 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
Atg3Q9CPX6 Ralgds-201ENSMUST00000028170 3590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Atg3Q9CPX6 Sgce-203ENSMUST00000101677 1656 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Atg3Q9CPX6 Gprin1-201ENSMUST00000099506 4141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Atg3Q9CPX6 Tesmin-202ENSMUST00000127142 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Atg3Q9CPX6 Serpinh1-201ENSMUST00000094154 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Atg3Q9CPX6 Trim62-201ENSMUST00000035667 3752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Atg3Q9CPX6 Rhox2g-201ENSMUST00000115169 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Atg3Q9CPX6 Rps2-ps9-201ENSMUST00000121414 817 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
Atg3Q9CPX6 Hoxb5os-202ENSMUST00000150698 596 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Atg3Q9CPX6 4933421O10Rik-201ENSMUST00000155691 3847 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Atg3Q9CPX6 Chfr-212ENSMUST00000200038 606 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Atg3Q9CPX6 Rad51d-202ENSMUST00000021033 1201 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Atg3Q9CPX6 Bphl-201ENSMUST00000040656 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Atg3Q9CPX6 Prss2-201ENSMUST00000070380 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Atg3Q9CPX6 Gm11563-201ENSMUST00000092695 1012 ntAPPRIS P1 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Atg3Q9CPX6 Lgr6-201ENSMUST00000044828 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Atg3Q9CPX6 Entpd7-201ENSMUST00000081079 5911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Atg3Q9CPX6 Sgpl1-202ENSMUST00000122259 4102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Atg3Q9CPX6 Kctd14-204ENSMUST00000205577 2310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Atg3Q9CPX6 Mbp-203ENSMUST00000075372 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Atg3Q9CPX6 Asb2-201ENSMUST00000021617 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Atg3Q9CPX6 Ankrd13b-202ENSMUST00000092892 3336 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Atg3Q9CPX6 Hnrnpr-204ENSMUST00000131671 2543 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Atg3Q9CPX6 Rnf38-202ENSMUST00000098098 5061 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Atg3Q9CPX6 Fam174a-202ENSMUST00000186780 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Atg3Q9CPX6 Prkcz-201ENSMUST00000030922 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Atg3Q9CPX6 Adal-204ENSMUST00000110665 2356 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Atg3Q9CPX6 AC167013.2-201ENSMUST00000228520 2684 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Atg3Q9CPX6 Itgb4-201ENSMUST00000021107 6014 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Atg3Q9CPX6 Hipk4-202ENSMUST00000108353 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Atg3Q9CPX6 Gm26513-201ENSMUST00000181802 2489 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Atg3Q9CPX6 Dym-201ENSMUST00000039608 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Atg3Q9CPX6 Gstt3-201ENSMUST00000001715 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Atg3Q9CPX6 Hes2-201ENSMUST00000030782 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Atg3Q9CPX6 Cacna1b-201ENSMUST00000041342 6984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Atg3Q9CPX6 Gm10327-201ENSMUST00000105222 1002 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Atg3Q9CPX6 Fam53b-205ENSMUST00000106166 1270 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Atg3Q9CPX6 Pole-203ENSMUST00000112482 747 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Atg3Q9CPX6 Agbl3-202ENSMUST00000115012 790 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Atg3Q9CPX6 Agbl3-203ENSMUST00000115014 805 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Atg3Q9CPX6 Gm12843-201ENSMUST00000137607 601 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Atg3Q9CPX6 Gm16124-201ENSMUST00000146938 516 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.7 ms