Protein–RNA interactions for Protein: Q99MP8

Brap, BRCA1-associated protein, mousemouse

Predictions only

Length 591 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BrapQ99MP8 Crip3-202ENSMUST00000113465 1035 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
BrapQ99MP8 Ifnar2-203ENSMUST00000117836 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
BrapQ99MP8 Gm15240-201ENSMUST00000118156 720 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
BrapQ99MP8 Crybb3-203ENSMUST00000118226 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
BrapQ99MP8 Tex30-213ENSMUST00000156392 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
BrapQ99MP8 Ercc1-203ENSMUST00000160369 1175 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
BrapQ99MP8 Mettl26-204ENSMUST00000169085 324 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
BrapQ99MP8 Gm44872-201ENSMUST00000207864 420 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
BrapQ99MP8 Clps-201ENSMUST00000025062 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
BrapQ99MP8 Mettl26-201ENSMUST00000026827 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
BrapQ99MP8 Pdlim7-203ENSMUST00000069968 1006 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
BrapQ99MP8 Crybb3-201ENSMUST00000076069 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
BrapQ99MP8 Ilvbl-203ENSMUST00000218215 2331 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
BrapQ99MP8 Tsc2-205ENSMUST00000226398 5459 ntAPPRIS P2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
BrapQ99MP8 Thnsl2-201ENSMUST00000074241 1821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
BrapQ99MP8 Pprc1-202ENSMUST00000099392 3956 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
BrapQ99MP8 Tfap2a-201ENSMUST00000021787 3487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
BrapQ99MP8 Rps6ka5-209ENSMUST00000222731 5642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
BrapQ99MP8 Hcn3-201ENSMUST00000029686 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
BrapQ99MP8 Aip-202ENSMUST00000117831 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
BrapQ99MP8 Art3-205ENSMUST00000120193 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
BrapQ99MP8 F10-204ENSMUST00000128418 1395 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
BrapQ99MP8 Nfyc-201ENSMUST00000043429 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
BrapQ99MP8 Tbc1d4-210ENSMUST00000162617 4762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
BrapQ99MP8 Chtop-205ENSMUST00000107343 3118 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
BrapQ99MP8 Grin2c-201ENSMUST00000003351 4279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
BrapQ99MP8 Brpf1-210ENSMUST00000204626 4381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
BrapQ99MP8 Sipa1-202ENSMUST00000080824 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
BrapQ99MP8 Myo19-202ENSMUST00000093969 4091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
BrapQ99MP8 Ttll9-202ENSMUST00000103155 1552 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
BrapQ99MP8 Crybg1-201ENSMUST00000020017 6608 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
BrapQ99MP8 Il1r1-202ENSMUST00000114795 4832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
BrapQ99MP8 Eno1b-201ENSMUST00000076155 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
BrapQ99MP8 Mrgprh-201ENSMUST00000075296 1809 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.17
BrapQ99MP8 Rnpepl1-201ENSMUST00000027487 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
BrapQ99MP8 Kif3c-205ENSMUST00000220210 4144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
BrapQ99MP8 I730028E13Rik-201ENSMUST00000216012 1959 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
BrapQ99MP8 Gm26935-201ENSMUST00000182686 519 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
BrapQ99MP8 AC238811.1-201ENSMUST00000225302 441 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
BrapQ99MP8 Batf3-201ENSMUST00000027943 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
BrapQ99MP8 Gnai1-201ENSMUST00000074694 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
BrapQ99MP8 Ttc8-202ENSMUST00000085109 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
BrapQ99MP8 Rasal3-207ENSMUST00000137458 3272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
BrapQ99MP8 AC124751.1-201ENSMUST00000222716 1408 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
BrapQ99MP8 Il6ra-201ENSMUST00000029559 3343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
BrapQ99MP8 Ccdc85a-201ENSMUST00000042534 5332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
BrapQ99MP8 Arhgef12-202ENSMUST00000165665 10752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
BrapQ99MP8 Ate1-202ENSMUST00000035458 4685 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
BrapQ99MP8 Myt1l-204ENSMUST00000218198 2735 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
BrapQ99MP8 Dlgap3-201ENSMUST00000046659 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
BrapQ99MP8 2700080J24Rik-201ENSMUST00000205314 1662 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
BrapQ99MP8 Efcab8-203ENSMUST00000175856 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
BrapQ99MP8 Spata5-209ENSMUST00000198968 2916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
BrapQ99MP8 Trp53-203ENSMUST00000108658 1771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
BrapQ99MP8 Trp53-201ENSMUST00000005371 1772 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
BrapQ99MP8 Ttc5-201ENSMUST00000006451 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
BrapQ99MP8 Ss18-201ENSMUST00000040924 3090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
BrapQ99MP8 Lrrc34-201ENSMUST00000029252 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
BrapQ99MP8 Spred2-202ENSMUST00000093299 4449 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
BrapQ99MP8 Trim32-202ENSMUST00000107366 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
BrapQ99MP8 Synm-204ENSMUST00000208231 4457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
BrapQ99MP8 Grm5-204ENSMUST00000155358 4500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
BrapQ99MP8 Tdg-208ENSMUST00000151390 3502 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
BrapQ99MP8 Socs7-201ENSMUST00000045540 7015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
BrapQ99MP8 Itgb3-201ENSMUST00000021028 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
BrapQ99MP8 Itga8-201ENSMUST00000028106 5812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
BrapQ99MP8 Matn2-206ENSMUST00000228570 2798 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
BrapQ99MP8 Olfr718-ps1-202ENSMUST00000213631 4737 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
BrapQ99MP8 Cmss1-201ENSMUST00000114371 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
BrapQ99MP8 Gm15920-201ENSMUST00000118998 402 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
BrapQ99MP8 Gm16137-201ENSMUST00000161571 664 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
BrapQ99MP8 2900092O11Rik-201ENSMUST00000191770 755 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
BrapQ99MP8 AC158804.1-201ENSMUST00000219046 541 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
BrapQ99MP8 AC154595.3-201ENSMUST00000224579 384 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
BrapQ99MP8 AC154846.1-201ENSMUST00000226278 862 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
BrapQ99MP8 Pecr-201ENSMUST00000027381 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
BrapQ99MP8 Mesp1-201ENSMUST00000032760 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
BrapQ99MP8 Cmtm5-201ENSMUST00000037814 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
BrapQ99MP8 Prtn3-201ENSMUST00000006679 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
BrapQ99MP8 4930423C22Rik-201ENSMUST00000193863 1311 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
BrapQ99MP8 Fggy-203ENSMUST00000107091 1395 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
BrapQ99MP8 Rtp3-201ENSMUST00000084922 1425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
BrapQ99MP8 Gm18244-201ENSMUST00000219747 1566 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
BrapQ99MP8 Cct3-ps1-201ENSMUST00000118023 1647 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
BrapQ99MP8 Trim15-203ENSMUST00000174195 1778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
BrapQ99MP8 9030612E09Rik-201ENSMUST00000053792 1859 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
BrapQ99MP8 Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 2739 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
BrapQ99MP8 Axdnd1-204ENSMUST00000178036 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
BrapQ99MP8 Kif7-204ENSMUST00000184137 4093 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
BrapQ99MP8 Mcur1-201ENSMUST00000021800 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
BrapQ99MP8 Klhl33-204ENSMUST00000227271 5513 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
BrapQ99MP8 Akap17b-201ENSMUST00000051906 6003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
BrapQ99MP8 Skida1-202ENSMUST00000091420 4376 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
BrapQ99MP8 Rnf168-201ENSMUST00000014218 3932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
BrapQ99MP8 Steap2-201ENSMUST00000015797 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
BrapQ99MP8 Btrc-201ENSMUST00000065601 2978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
BrapQ99MP8 Mob3c-201ENSMUST00000030477 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
BrapQ99MP8 Otop3-202ENSMUST00000106543 2369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
BrapQ99MP8 Gucy1a2-201ENSMUST00000115733 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
BrapQ99MP8 Kmt5c-203ENSMUST00000108583 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.7 ms