Protein–RNA interactions for Protein: Q99ME6

Atp1b4, Protein ATP1B4, mousemouse

Predictions only

Length 356 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp1b4Q99ME6 Ppt2-201ENSMUST00000064953 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Atp1b4Q99ME6 Acadvl-202ENSMUST00000102574 2168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Atp1b4Q99ME6 Tmem87b-201ENSMUST00000110325 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Atp1b4Q99ME6 Cxadr-202ENSMUST00000114229 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Atp1b4Q99ME6 1600002D24Rik-202ENSMUST00000136744 1854 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Atp1b4Q99ME6 Plch2-210ENSMUST00000176194 5619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Atp1b4Q99ME6 Trf-201ENSMUST00000035158 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Atp1b4Q99ME6 Plxnb1-201ENSMUST00000072093 8649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Atp1b4Q99ME6 Nrap-201ENSMUST00000040711 5334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Atp1b4Q99ME6 Cyp2u1-201ENSMUST00000106337 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Atp1b4Q99ME6 Ccdc157-201ENSMUST00000093381 5015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Atp1b4Q99ME6 Igsf5-202ENSMUST00000081093 1554 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Atp1b4Q99ME6 Tbx15-201ENSMUST00000029462 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Atp1b4Q99ME6 Trp73-201ENSMUST00000097762 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Atp1b4Q99ME6 F2r-201ENSMUST00000059193 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Atp1b4Q99ME6 2310026I22Rik-201ENSMUST00000180941 1300 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Atp1b4Q99ME6 Ctsk-201ENSMUST00000015664 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Atp1b4Q99ME6 Cpsf4l-203ENSMUST00000106617 1123 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Atp1b4Q99ME6 Pole-203ENSMUST00000112482 747 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Atp1b4Q99ME6 Gm14723-201ENSMUST00000118686 215 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
Atp1b4Q99ME6 4930481A15Rik-201ENSMUST00000128542 2106 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Atp1b4Q99ME6 Proscos-202ENSMUST00000178990 666 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
Atp1b4Q99ME6 Ascl5-201ENSMUST00000180436 567 ntAPPRIS P1 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Atp1b4Q99ME6 Gm19184-201ENSMUST00000196798 928 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
Atp1b4Q99ME6 Chfr-212ENSMUST00000200038 606 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Atp1b4Q99ME6 Gm5161-201ENSMUST00000075243 853 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
Atp1b4Q99ME6 Hnrnpul1-201ENSMUST00000043765 3354 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Atp1b4Q99ME6 Mrgprf-201ENSMUST00000033386 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Atp1b4Q99ME6 Zbtb7b-204ENSMUST00000107435 4333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Atp1b4Q99ME6 Itga3-203ENSMUST00000120375 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Atp1b4Q99ME6 Ankrd6-202ENSMUST00000084748 4354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Atp1b4Q99ME6 Decr2-201ENSMUST00000040907 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Atp1b4Q99ME6 Trip4-201ENSMUST00000117083 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Atp1b4Q99ME6 Aqp3-201ENSMUST00000055327 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Atp1b4Q99ME6 Kcnh4-201ENSMUST00000107361 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Atp1b4Q99ME6 Krt90-201ENSMUST00000023714 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Atp1b4Q99ME6 Lmnb1-201ENSMUST00000025486 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Atp1b4Q99ME6 Gm29676-201ENSMUST00000222396 1689 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Atp1b4Q99ME6 Phf8-204ENSMUST00000112666 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Atp1b4Q99ME6 Rhox2f-201ENSMUST00000115173 799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Atp1b4Q99ME6 Ssr4-208ENSMUST00000166518 800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Atp1b4Q99ME6 Glo1-202ENSMUST00000167624 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Atp1b4Q99ME6 Gm3809-201ENSMUST00000180973 1006 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
Atp1b4Q99ME6 2900093K20Rik-201ENSMUST00000190930 567 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
Atp1b4Q99ME6 Ssr2-202ENSMUST00000192495 620 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Atp1b4Q99ME6 AC154276.1-201ENSMUST00000228874 1299 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
Atp1b4Q99ME6 Krtcap2-201ENSMUST00000040888 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Atp1b4Q99ME6 Fam173a-201ENSMUST00000072735 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Atp1b4Q99ME6 Zbtb4-202ENSMUST00000108639 7811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Atp1b4Q99ME6 Kmt5c-203ENSMUST00000108583 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Atp1b4Q99ME6 Slc8b1-203ENSMUST00000111889 1624 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Atp1b4Q99ME6 Cep295nl-202ENSMUST00000168100 1602 ntAPPRIS P1 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Atp1b4Q99ME6 Trim62-201ENSMUST00000035667 3752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Atp1b4Q99ME6 Mageb10-ps-201ENSMUST00000119697 1407 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
Atp1b4Q99ME6 Gm26788-201ENSMUST00000181692 1750 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Atp1b4Q99ME6 Rad54l2-201ENSMUST00000046502 9305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Atp1b4Q99ME6 1500009C09Rik-202ENSMUST00000143238 1552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Atp1b4Q99ME6 Atat1-201ENSMUST00000056034 1930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Atp1b4Q99ME6 Epha1-203ENSMUST00000204357 2948 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Atp1b4Q99ME6 Gm10339-203ENSMUST00000225409 1671 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
Atp1b4Q99ME6 Sgsm1-201ENSMUST00000048112 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Atp1b4Q99ME6 6430573F11Rik-205ENSMUST00000171777 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Atp1b4Q99ME6 Gm45212-201ENSMUST00000205831 3403 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
Atp1b4Q99ME6 Pdlim3-201ENSMUST00000034053 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Atp1b4Q99ME6 Agbl3-202ENSMUST00000115012 790 ntTSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Atp1b4Q99ME6 Agbl3-203ENSMUST00000115014 805 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Atp1b4Q99ME6 Spdye4b-202ENSMUST00000159781 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Atp1b4Q99ME6 Gm27243-201ENSMUST00000183964 521 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
Atp1b4Q99ME6 Olfr54-201ENSMUST00000072152 942 ntAPPRIS P1 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Atp1b4Q99ME6 Olfr1375-201ENSMUST00000073543 942 ntAPPRIS P1 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Atp1b4Q99ME6 Olfr1209-201ENSMUST00000099809 933 ntAPPRIS P1 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Atp1b4Q99ME6 Rbbp7-201ENSMUST00000033720 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Atp1b4Q99ME6 Grin2c-201ENSMUST00000003351 4279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Atp1b4Q99ME6 Hsd3b7-203ENSMUST00000106272 1725 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Atp1b4Q99ME6 Dnajc27-202ENSMUST00000049584 2934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Atp1b4Q99ME6 Col1a1-201ENSMUST00000001547 5930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Atp1b4Q99ME6 Pelp1-201ENSMUST00000019065 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Atp1b4Q99ME6 Rbfox3-203ENSMUST00000103023 2809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Atp1b4Q99ME6 Mapt-202ENSMUST00000106988 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Atp1b4Q99ME6 Foxp1-208ENSMUST00000113329 1926 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Atp1b4Q99ME6 H2-DMb2-201ENSMUST00000041982 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Atp1b4Q99ME6 Mmp28-203ENSMUST00000108137 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Atp1b4Q99ME6 Il11ra1-201ENSMUST00000098132 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Atp1b4Q99ME6 Gm14379-201ENSMUST00000128858 1878 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Atp1b4Q99ME6 Gm26747-201ENSMUST00000180597 1716 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Atp1b4Q99ME6 Mcf2l-207ENSMUST00000110876 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Atp1b4Q99ME6 Cd63-202ENSMUST00000105229 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Atp1b4Q99ME6 Gm1335-201ENSMUST00000121653 386 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
Atp1b4Q99ME6 6330418K02Rik-201ENSMUST00000124298 743 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Atp1b4Q99ME6 Gm15317-201ENSMUST00000129569 699 ntTSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Atp1b4Q99ME6 Cmc4-203ENSMUST00000149863 507 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Atp1b4Q99ME6 Ube2m-208ENSMUST00000165394 1228 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Atp1b4Q99ME6 Aif1-206ENSMUST00000173324 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Atp1b4Q99ME6 Gm27516-201ENSMUST00000184237 98 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
Atp1b4Q99ME6 Tcf4-258ENSMUST00000202937 2103 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Atp1b4Q99ME6 Cd63-204ENSMUST00000219317 1109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Atp1b4Q99ME6 Gm17383-201ENSMUST00000078739 1041 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
Atp1b4Q99ME6 P2ry2-206ENSMUST00000208340 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Atp1b4Q99ME6 Hells-201ENSMUST00000025965 5868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Atp1b4Q99ME6 Stpg1-201ENSMUST00000063707 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.3 ms