Protein–RNA interactions for Protein: Q99LH9

Sh3bp5l, SH3 domain-binding protein 5-like, mousemouse

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Length 392 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh3bp5lQ99LH9 Ecm1-202ENSMUST00000117507 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Sh3bp5lQ99LH9 Il2rb-202ENSMUST00000163494 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Sh3bp5lQ99LH9 Mrgprh-201ENSMUST00000075296 1809 ntAPPRIS P1 BASIC16.31■□□□□ 0.2
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Sh3bp5lQ99LH9 Gpr19-202ENSMUST00000066107 1647 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Sh3bp5lQ99LH9 Zfp879-201ENSMUST00000049625 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
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Sh3bp5lQ99LH9 Acsl3-201ENSMUST00000035779 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
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Sh3bp5lQ99LH9 Scgb3a2-201ENSMUST00000043803 842 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Sh3bp5lQ99LH9 Gpam-201ENSMUST00000061856 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Sh3bp5lQ99LH9 Rb1cc1-201ENSMUST00000027040 7607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Sh3bp5lQ99LH9 Gm11725-201ENSMUST00000125607 1850 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Sh3bp5lQ99LH9 2310022A10Rik-204ENSMUST00000187032 1871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Sh3bp5lQ99LH9 Rtkn-202ENSMUST00000087938 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Sh3bp5lQ99LH9 Adcy7-203ENSMUST00000169037 5198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Sh3bp5lQ99LH9 Chrnb1-201ENSMUST00000045971 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Sh3bp5lQ99LH9 Gm15336-201ENSMUST00000128894 1571 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
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Sh3bp5lQ99LH9 Bsx-201ENSMUST00000067375 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Sh3bp5lQ99LH9 Dbn1-203ENSMUST00000109923 2940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Sh3bp5lQ99LH9 AC153938.1-201ENSMUST00000220354 1425 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Sh3bp5lQ99LH9 Ano8-201ENSMUST00000093450 3653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Sh3bp5lQ99LH9 Lcmt1-201ENSMUST00000033025 1369 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Sh3bp5lQ99LH9 Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 7127 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
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Sh3bp5lQ99LH9 Sbk3-201ENSMUST00000133272 1086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Sh3bp5lQ99LH9 Agtpbp1-213ENSMUST00000167096 508 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Sh3bp5lQ99LH9 Gm43755-201ENSMUST00000200001 408 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Sh3bp5lQ99LH9 Lsm7-208ENSMUST00000220225 1129 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Sh3bp5lQ99LH9 Cyp11a1-201ENSMUST00000034874 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Sh3bp5lQ99LH9 Ccdc117-201ENSMUST00000020776 3372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Sh3bp5lQ99LH9 Gm10339-203ENSMUST00000225409 1671 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
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Sh3bp5lQ99LH9 Ppp2r1a-201ENSMUST00000007708 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Sh3bp5lQ99LH9 Prickle3-203ENSMUST00000129662 2376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Sh3bp5lQ99LH9 Celrr-202ENSMUST00000181433 1561 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Sh3bp5lQ99LH9 Cpeb4-201ENSMUST00000020543 2312 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Sh3bp5lQ99LH9 Kif21a-204ENSMUST00000109287 6124 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Sh3bp5lQ99LH9 Brd3-203ENSMUST00000113941 5289 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Sh3bp5lQ99LH9 Tdrd7-201ENSMUST00000102929 3716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
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Sh3bp5lQ99LH9 Gpc1-201ENSMUST00000045970 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Sh3bp5lQ99LH9 Slc4a2-201ENSMUST00000080067 4179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
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Sh3bp5lQ99LH9 Acot6-201ENSMUST00000056822 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Sh3bp5lQ99LH9 Csnk1d-201ENSMUST00000018274 3675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Sh3bp5lQ99LH9 Gm16029-201ENSMUST00000161643 2427 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Sh3bp5lQ99LH9 Marveld3-202ENSMUST00000051430 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Sh3bp5lQ99LH9 Cchcr1-201ENSMUST00000045956 2748 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Sh3bp5lQ99LH9 Gm45760-201ENSMUST00000212190 1782 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Sh3bp5lQ99LH9 Ptdss1-201ENSMUST00000021990 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Sh3bp5lQ99LH9 Gas8-201ENSMUST00000093043 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Sh3bp5lQ99LH9 Capn15-205ENSMUST00000212520 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Sh3bp5lQ99LH9 Slc35f1-201ENSMUST00000105473 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Sh3bp5lQ99LH9 Sema3b-201ENSMUST00000073448 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Sh3bp5lQ99LH9 Snx12-202ENSMUST00000120389 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Sh3bp5lQ99LH9 Pls1-201ENSMUST00000093800 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Sh3bp5lQ99LH9 Ninj1-202ENSMUST00000120733 1321 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Sh3bp5lQ99LH9 Gm11661-201ENSMUST00000121761 1327 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Sh3bp5lQ99LH9 Mus81-202ENSMUST00000124334 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
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